PřF BINFO Bioinformatics
Name in Czech: Bioinformatika
Bachelor's full-time specialized, language of instruction: Czech Czech
Included in the programme: PřF B-BIC Biochemistry

Parts of the final state examination and its content

The state final examination includes the courses General Chemical Basis, Biochemistry, Clinical Biochemistry, and Bioanalytical Methods, which focus on the student's broader theoretical basis in the areas of chemistry including biochemistry, inorganic, organic, analytical or physical chemistry, as well as in the understanding of the organization of chemical and biological data, including an overview of basic computer science disciplines. Another component of the BSc in Biochemistry is the BSc Thesis, which tests students' practical skills in the laboratory, their ability to interpret data, critically evaluate it, and their ability to write a text to the required standard.
The state final examination includes builds on the following courses:
C1601 Fundamentals of General and Inorganic Chemistry
C1660 Fundamentals of Analytical Chemistry
C2700 Fundamentals of Organic Chemistry
C4660 Physical Chemistry I
C3181 Biochemistry I
C4182 Biochemistry II
C4230 Biochemistry - lab course
C7879 Experimental Data Processing
Bi4020 Molecular Biology
C2133 Introduction to chemoinformatics
C2135 Bioinformatics in practice
C2184 Introduction to Python programming
C3210 Structural Bioinformatics
FI:PB001 Introduction to Information Technology
C5014 Bachelor's Thesis in Biochemistry I
C6016 Bachelor's Thesis in Biochemistry II

Suggestion of theses topics and the topics of defended theses

Evaluation of various conductivity detectors in the analysis of lactate/pyruvate using capillary electrophoresis
Petra Crhonková, bachelor thesis, defended 17 June 2022, https://is.muni.cz/auth/th/y3atl/

Influence of natural products of dental hygiene on the microbiome of the oral cavity
Veronika Brychtová, bachelor thesis, defended 20 June 2022, https://is.muni.cz/auth/th/cw57t/

Stability of antipsychotics in a dried blood spot
Miriam Štolcová, bachelor thesis, defended 8 July 2021, https://is.muni.cz/auth/th/bjhj1/

Application of photon-upconversion nanoparticles in immunoassays
Eliška Odstrčilíková, Bachelor thesis, defended 15 July 2020, https://is.muni.cz/auth/th/fur0u/

Immunoassay with fluorescent nanoparticles for detection of Melissococcus plutonius
Miroslav Herczeg, bachelor thesis, defended 25 June 2019, https://is.muni.cz/auth/th/px0c7/

Recommended progress through the study plan

Společná část (90-120kr.)

Společný univerzitní základ (15 kr.)

K úspěšnému zakončení studia student v bakalářských studijních programech získá 15 kr. z předmětů tzv. Společného univerzitního základu. Mezi tyto kredity se počítají 2 kredity z předmětů sportovních aktivit (TV), 4 kredity za cizí jazyk, a 9 kreditů za předměty společensko-vědního či přírodovědného základu – tzv. CORE předmětů. Aktuální nabídka CORE předmětů je k dispozici zde: https://www.muni.cz/studenti/spolecny-univerzitni-zaklad

Společensko-vědní a přírodovědný základ

Student povinně zapisuje předměty v minimální celkové hodnotě 9 kreditů za celé bakalářské studium ze základní nabídky Společného univerzitního základu. https://www.muni.cz/studenti/spolecny-univerzitni-zaklad

Languages

K úspěšnému ukončení studia na PřF má student povinnost absolvovat zkoušku JASUZ Odborná angličtina - zkouška za 4 kredity. Výuka jazyků je zajišťována Centrem jazykového vzdělávání MU.

Code Name Guarantor Type of Completion Extent and Intensity Credits Term Profile Cat.
PřF:JASUZExamination in English for Specific Purposes – Science A. Bízková Doleželovázk 0/0/04 --
4 credits
TV

Všichni studenti prezenčního studia bakalářských studijních programů mají povinnost během studia splnit podmínky pro udělení dvou zápočtů (1 zápočet = 1 kredit) z předmětů sportovních aktivit vypisovaných pod kódy P9. Předměty zajišťuje Centrum univerzitního sportu Fakulty sportovních studií.

Bakalářská práce (min 10kr.)

Code Name Guarantor Type of Completion Extent and Intensity Credits Term Profile Cat.
PřF:C5014Bachelor thesis from biochemistry J. Lochmanz 0/0/55 5P
PřF:C6016Bachelor thesis from biochemistry II J. Lochmanz 0/0/1515 6P
20 credits

Compulsory courses

Každý akademický rok studia je nutno absolvovat povinný předmět bez kreditového hodnocení C7777 Zacházení s chemickými látkami zakončený zápočtem. Absolvování předmětu C7777 je nutnou podmínkou pro vstup do všech předmětů, ve kterých dochází k manipulaci s chemickými látkami, tzn. laboratorní cvičení, bakalářská práce apod.

Code Name Guarantor Type of Completion Extent and Intensity Credits Term Profile Cat.
PřF:Bi4020Molecular biology J. Šmardazk 3/0/03+2 4Z
PřF:C1200Introduction to the biochemistry J. Lochmank 2/0/02+1 1P
PřF:C1471Applied mathematics for biochemists R. Svobodovázk 1/0/01+2 2-
PřF:C1472Applied mathematics for biochemists - seminar R. Svobodováz 0/1/01 2-
PřF:C1601General and Inorganic Chemistry M. Nečaszk 2/0/02+2 1Z
PřF:C1605General and Inorganic Chemistry - seminar M. Nečasz 0/2/02 1-
PřF:C1660Basic Analytical Chemistry K. Novotnýzk 2/0/02+2 3Z
PřF:C2131Introduction to bioinformatics M. Wimmerovázk 2/0/02+2 2Z
PřF:C2700Basic Organic Chemistry J. Literákzk 2/0/02+2 2Z
PřF:C2701Basic Organic Chemistry-seminar J. Literákz 0/1/01 2-
PřF:C3150Physical Chemistry I - seminar H. Semrádz 0/2/02 2-
PřF:C3181Biochemistry I P. Skládalzk 2/0/02+2 3Z
PřF:C4182Biochemistry II P. Skládalzk 2/0/02+2 4Z
PřF:C4185Seminar to bachalor thesis P. Bouchalz 0/2/02 5P
PřF:C4221Biochemical Lab Technique J. Lochmanz 0/0/44 2P
PřF:C4222Basic calculations in laboratory V. Sedláčekz 0/1/02 1P
PřF:C4230Biochemistry - laboratory course J. Lochmanz 0/0/66 4P
PřF:C4660Physical Chemistry I M. Munzarovázk 2/0/02+2 2Z
PřF:C6185Seminar to bachalor thesis P. Bouchalz 0/2/02 6P
PřF:C7879Experimental data processing K. Dadákovázk 1/0/01+2 3P
PřF:F2120Physics Z. Bochníčekk 2/1/03+1 1-
PřF:M1035Mathematics for biochemists M. Čadekzk 2/2/06 1-
74 credits

Selective courses

Code Name Guarantor Type of Completion Extent and Intensity Credits Term Profile Cat.
PřF:C2132Introduction to bioinformatics - seminar M. Wimmerováz 0/1/01 2-
1 credit

Elective courses

Student si zapisuje předměty tak, aby za celé studium získal alespoň 180 kreditů.

Specializační část

Compulsory courses

Code Name Guarantor Type of Completion Extent and Intensity Credits Term Profile Cat.
PřF:C1473Selected chapters in applied mathematics T. Račekz 1/0/01 3P
PřF:C2110UNIX Operating System and Programming Basics P. Kulhánekk 0/2/02+1 3-
PřF:C2133Introduction to chemoinformatics R. Svobodovázk 2/0/02+2 1P
PřF:C2135Bioinformatics for practice L. Malinovskák 0/2/02+1 4P
PřF:C2142Design of algorithms in life sciences T. Račekzk 1/2/03+2 2-
PřF:C2143Design of algorithms in life sciences - seminary T. Račekz 0/1/01 2P
PřF:C2145Structural bioinformatics in praxis R. Svobodovák 0/1/13 5-
PřF:C2150Information processing and visualization in chemistry and biochemistry P. Kulhánekk 0/2/02+1 4P
PřF:C2184Introduction to programming in Python T. Račekk 0/2/02+1 1P
PřF:C3210Structural bioinformatics M. Wimmerovázk 1/0/01+2 3P
PřF:C4020Physical Chemistry II M. Munzarovázk 2/0/02+2 3-
PřF:C4040Physical Chemistry II - seminar M. Munzarováz 0/2/02 3-
PřF:C5020Chemical Structure P. Brožzk 2/0/02+2 5-
PřF:C5030Chemical Structure-sem. P. Brožz 0/1/01 5-
PřF:C9088RNA & DNA sequence analysis R. Svobodovázk 1/1/02+2 6P
PřF:C9530Structure of biomacromolecules L. Žídekzk 2/0/02+2 3P
PřF:E1051Introduction to Computational Biology and Biomedicine II T. Pavlíkz 1/0/01 6P
FI:PB001Introduction to Information Technologies L. Matyskazk 2/0/02+2 1P
53 credits

Selective courses

Student je povinen z výběru povinně volitelných předmětů získat minimálně 19 kreditů.

Code Name Guarantor Type of Completion Extent and Intensity Credits Term Profile Cat.
PřF:Bi8350Evolutionary genomics R. Hobzazk 2/0/02+2 6-
PřF:C2115Practical Introduction to Supercomputing P. Kulhánekk 0/2/02 4-
PřF:C2160C Programming for Chemists M. Wimmerovák 0/2/02+1 4-
PřF:C3200Chemical Information Search C. Mazalzk 1/0/01+2 3-
PřF:C3220Advanced C Programming for Chemists T. Trnkak 0/2/02+1 5-
PřF:C6200Biochemical Methods Z. Farkazk 4/0/04+2 6-
PřF:C9531Structure of biomacromolecules L. Žídekz 0/2/02 3-
PřF:C9920Introduction to Quantum Chemistry M. Munzarovázk 2/1/03+2 5-
PřF:C9930Methods of Quantum Chemistry M. Munzarovázk 2/1/03+2 6-
PřF:E5444Analysis of sequencing data E. Budinskázk 2/1/02+2 3-
FI:PB029Electronic Document Preparation P. Sojkazk 2/1/03+2 3-
FI:PB168Introduction to DB and IS V. Dohnalzk 2/2/03+2 3-
47 credits