OVAERE, Margriet, Jiří ŠPONER, Judit ŠPONEROVÁ, Piet HERDEWIJN a Luc VAN MEERVELT. How does hydroxyl introduction influence the double helical structure: the stabilization of an altritol nucleic acid: ribonucleic acid duplex. Nucleic Acids Research. Oxford, UK: Oxford Press, 2012, roč. 40, č. 15, s. 7573-7583. ISSN 0305-1048. doi:10.1093/nar/gks470.
Další formáty:   BibTeX LaTeX RIS
Základní údaje
Originální název How does hydroxyl introduction influence the double helical structure: the stabilization of an altritol nucleic acid: ribonucleic acid duplex
Autoři OVAERE, Margriet (56 Belgie), Jiří ŠPONER (203 Česká republika, garant, domácí), Judit ŠPONEROVÁ (348 Maďarsko, domácí), Piet HERDEWIJN (56 Belgie) a Luc VAN MEERVELT (56 Belgie).
Vydání Nucleic Acids Research, Oxford, UK, Oxford Press, 2012, 0305-1048.
Další údaje
Originální jazyk angličtina
Typ výsledku Článek v odborném periodiku
Obor 10610 Biophysics
Stát vydavatele Velká Británie
Utajení není předmětem státního či obchodního tajemství
WWW URL
Impakt faktor Impact factor: 8.278
Kód RIV RIV/00216224:14740/12:00062154
Organizační jednotka Středoevropský technologický institut
Doi http://dx.doi.org/10.1093/nar/gks470
UT WoS 000308958600054
Klíčová slova anglicky BASIS-SET CONVERGENCE; DNA-BASE PAIRS; INTERACTION ENERGIES; CRYSTAL-STRUCTURE; MODIFIED SIRNAS; MODEL; RI-MP2; REFINEMENT; EFFICIENCY; COMPLEXES
Štítky ok, rivok
Příznaky Mezinárodní význam, Recenzováno
Změnil Změnila: Olga Křížová, učo 56639. Změněno: 6. 4. 2013 06:46.
Anotace
Altritol nucleic acids (ANAs) are a promising new tool in the development of artificial small interfering ribonucleic acids (siRNAs) for therapeutical applications. To mimic the siRNA: messenger RNA (mRNA) interactions, the crystal structure of the ANA: RNA construct a(CCGUAAUGCC-P):r(GGCAUUACGG) was determined to 1.96 angstrom resolution which revealed the hybrid to form an A-type helix. As this A-form is a major requirement in the RNAi process, this crystal structure confirms the potential of altritol-modified siRNAs. Moreover, in the ANA strands, a new type of intrastrand interactions was found between the O2' hydroxyl group of one residue and the sugar ring O4' atom of the next residue. These interactions were further investigated by quantum chemical methods. Besides hydration effects, these intrastrand hydrogen bonds may also contribute to the stability of ANA: RNA duplexes.
Návaznosti
ED1.1.00/02.0068, projekt VaVNázev: CEITEC - central european institute of technology
VytisknoutZobrazeno: 18. 5. 2022 09:35