MRÁZKOVÁ, Jana, Martina POKORNÁ, Eva DEJMKOVÁ, Lenka MALINOVSKÁ a Michaela WIMMEROVÁ. Influence of targeted amino acid substitution on specificity and affinity of lectins from pathogenic bacteria. In XXIII. Biochemický sjezd. ISBN 978-80-86313-34-4. 2012.
Další formáty:   BibTeX LaTeX RIS
Základní údaje
Originální název Influence of targeted amino acid substitution on specificity and affinity of lectins from pathogenic bacteria
Název česky Vliv cílené substituce aminokyseliny na specifitu a afinitu lektinů z patogenních mikroorganismů
Autoři MRÁZKOVÁ, Jana (203 Česká republika, domácí), Martina POKORNÁ (203 Česká republika, domácí), Eva DEJMKOVÁ (203 Česká republika, domácí), Lenka MALINOVSKÁ (203 Česká republika, domácí) a Michaela WIMMEROVÁ (203 Česká republika, garant, domácí).
Vydání XXIII. Biochemický sjezd, 2012.
Další údaje
Originální jazyk angličtina
Typ výsledku Konferenční abstrakt
Obor 10600 1.6 Biological sciences
Stát vydavatele Česká republika
Utajení není předmětem státního či obchodního tajemství
Kód RIV RIV/00216224:14310/12:00057922
Organizační jednotka Přírodovědecká fakulta
ISBN 978-80-86313-34-4
Klíčová slova česky lektiny; patogenní bakterie; PA-IIL; Pseudomonas aeruginosa; RS-IIL; Ralstonia solanacearum; BC2L-A; Burkholderia cenocepacia; CV-IIL; Chromobacterium violaceum; místně-cílená mutageneze; specifita; afinita; vazba cukrů
Klíčová slova anglicky lectins; pathogenic bacteria; PA-IIL; Pseudomonas aeruginosa; RS-IIL; Ralstonia solanacearum; BC2L-A; Burkholderia cenocepacia; CV-IIL; Chromobacterium violaceum; site-directed mutagenesis; specificity; affinity; sugar binding
Změnil Změnila: prof. RNDr. Michaela Wimmerová, Ph.D., učo 854. Změněno: 22. 1. 2013 10:08.
Anotace
Pseudomonas aeruginosa, Chromobacterium violaceum, Burkholderia cenocepacia and Ralstonia solanacearum are saprophytic bacteria found in various environments, including soil, water and vegetation. The first three bacteria occasionally become aggressive opportunistic animal and human pathogens which attack mainly immunocompromised patients, e.g. patients suffering from cystic fibrosis. The fourth bacterium is economically important plant pathogen. All these bacteria produce lectins. Lectins are proteins which are capable of binding diverse carbohydrates with varying specificity. This fact is very important especially in host-pathogen interactions, where lectins help pathogen in adhesion to sugar moieties presented on host cells. Foregoing bacteria produce lectins belonging to a so-called “PA-IIL family”, namely PA-IIL (P. aeruginosa), CV-IIL (C. violaceum), BC2L-A (B. cenocepacia) and RS-IIL (R. solanacearum). These lectins are orthologues with significant sequential and structural similarities. Although they bind similar saccharides, they differ in preferences towards these saccharides. RS-IIL and BC2L-A prefer D-mannose, while PA-IIL and CV-IIL prefer L-fucose. The aim of this work was preparation of mutated variants of these lectins with the amino acid substitution corresponding to the position Thr98 (in PA-IIL), which participates on sugar binding. Changes in affinities/ specificities of the mutants were measured by sothermal titration calorimetry (ITC) and surface plasmon resonance (SPR).
Anotace česky
Pseudomonas aeruginosa, Chromobacterium violaceum, Burkholderia cenocepacia a Ralstonia solanacearum jsou saprofytické bakterie, které se nacházejí v různém prostředí včetně půdy, vody a vegetace. První tři bakterie jsou příležitostnými agresivními oportunistickými zvířecími a lidskými patogeny atakujícími zejména pacienty se sníženou imunitou, např. pacienty trpícími cystickou fibrosou. Čtbrtá bakterie je ekonomicky významný rostlinný patogen. Všechny tyto bakterie produkují lektiny. Lektiny jsou proteiny schopné vázat rozličné cukry s různou specifitou. Tento fakt je velmi důležitý především při interakcích patogenu s hostitelem, kdy lektiny napomáhají patgenu v adhezi na cukerné zbytky přítomné na povrchu hostitelských buněk. Výše zmíněné bakterie produkují lektiny patřící do takzvané "PA-IIL lektinové rodiny", jmenovitě PA-IIL (P. aeruginosa), CV-IIL (C. violaceum), BC2L-A (B. cenocepacia) a RS-IIL (R. solanacearum). Tyto lektiny jsou ortology s významnými sekvenčními a strukturními podobnostmi. Akčkoliv vážou stejné sacharidy odlišují se v preferencích vůči těmto sacharidům. RS-IIL a BC2L-A preferují D-mannosu zatímco PA-IIL a CV-IIL preferují L-fukosu. Cílem této práce byla příprava mutantních variant těchto lektinů se aminokyselinovou substitucí odpovídající pozici Thr98 (v PA-IIL), která se podílí na cukerné vazbě. Změny v afinitě/specifitě mutantů byly měřeny pomocí isotermální titrační kalorimetrie (ITC) a rezonance povrchového plasmonu (SPR).
Návaznosti
CZ.1.05/1.1.00/02.0068, interní kód MUNázev: CEITEC - středoevropský technologický institut (Akronym: CEITEC)
Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, CEITEC - středoevropský technologický institut, 1.1 Evropská centra excelence
GPP207/11/P185, projekt VaVNázev: Příprava lektinů s vysokou specifitou a afinitou
Investor: Grantová agentura ČR, Příprava lektinů s vysokou specifitou a afinitou
MUNI/A/0977/2009, interní kód MUNázev: Moderní metody biochemického výzkumu
Investor: Masarykova univerzita, Moderní metody biochemického výzkumu, DO R. 2020_Kategorie A - Specifický výzkum - Studentské výzkumné projekty
VytisknoutZobrazeno: 19. 4. 2024 22:53