Typizace kmenů Plesiomonas shigelloides

GELBÍČOVÁ, Tereza, Ivo SEDLÁČEK and Monika MAREJKOVÁ. Typizace kmenů Plesiomonas shigelloides (Typing of Plesiomonas shigelloides strains). In RNDr. Miloslava Prokšová, CSc. Mikrobiológia vody a životného prostredia. Bratislava - Praha: Československá spoločnosť mikrobiologická, 2012, p. 131-136. ISBN 978-80-971197-2-0.

Basic information

• Original name: Typizace kmenů Plesiomonas shigelloides
• Name in Czech: Typizace kmenů Plesiomonas shigelloides
• Name (in English): Typing of Plesiomonas shigelloides strains
• Authors: GELBÍČOVÁ, Tereza (203 Czech Republic, guarantor, belonging to the institution), Ivo SEDLÁČEK (203 Czech Republic, belonging to the institution) and Monika MAREJKOVÁ (203 Czech Republic).
• Edition: Bratislava - Praha, Mikrobiológia vody a životného prostredia, p. 131-136, 6 pp. 2012.
• Publisher: Československá spoločnosť mikrobiologická

Other information

• Original language: Czech
• Type of outcome: Proceedings paper
• Field of Study: 10600 1.6 Biological sciences
• Country of publisher: Slovakia
• Confidentiality degree: is not subject to a state or trade secret
• Publication form: printed version "print"
• RIV identification code: RIV/00216224:14310/12:00062670
• Organization unit: Faculty of Science
• ISBN: 978-80-971197-2-0
• Keywords (in Czech): biotypizace; ribotypizace; rod Plesiomonas
• Keywords in English: biotyping; ribotyping; genus Plesiomonas
• Tags: AKR, rivok

Abstract

Plesiomonas shigelloides je bakterie vyskytující se ve vodním prostředí, která může vyvolat onemocnění lidí i zvířat. Cílem práce bylo provést charakterizaci kmenů P. shigelloides na základě vybraných fenotypových a genotypových metod (ribotypizace), které umožňují identifikaci a typizaci tohoto etiologického agens. Celkem bylo testováno 45 kmenů P. shigelloides pocházejících z různých zdrojů (lidí, zvířat a vody) a geografických oblastí. U některých kmenů P. shigelloides byla zjištěna variabilita ve fenotypových znacích (arginin dihydroláza, ornithin dekarboxyláza a beta-galaktosidáza) klíčových k identifikaci druhu. U většiny kmenů (98 %) byla prokázána pozitivní DNázová aktivita, přestože je P. shigelloides označována za DNáza negativní bakteriální druh. Na úrovni genotypu byla zjištěna vysoká heterogenita testovaných kmenů. Shlukovou analýzou však byly detekovány i humánní kmeny různého původu vykazující podobnost ribotypů více jak 90 %.

Abstract (in English)

Plesiomonas shigelloides is bacteria which occurring in the aquatic environment and can cause human and animal diseases . The aim of this study was to characterize of P. shigelloides strains on the base of selected phenotypic and genotypic methods (ribotyping), which allow identification and typing of this etiological agent. 45 strains of P. shigelloides from different sources (people, animals, water) and geographic areas were tested. Variability in phenotypic characters (arginin dihydrolase, ornithin decarboxylase and beta-galactosidase) key to identify of species was found in some strains of P. shigelloides. Positive DNase activity was detected for most strains (98%), although P. shigelloides is described as DNase negative bacterial species. At the genotypic level, high heterogenity of tested strains was found. Human strains of different origin exhibiting similarity of ribotypes more than 90% were also detected by cluster analysis.

Links

• CZ.1.07/2.3.00/20.0183, interní kód MU: Name: Centrum experimentální biomedicíny (Acronym: CEB)

Investor: Ministry of Education, Youth and Sports of the CR, 2.3 Human resources in research and development