BEJDÁK, Petr, Martina LENGEROVÁ, Dita PALOUŠOVÁ, Pavlína VOLFOVÁ, Iva KOCMANOVÁ, Jiří MAYER a Zdeněk RÁČIL. Detekce a identifikace původců mykotických infekcí způsobených vláknitými houbami pomocí metod molekulární genetiky. Klinická mikrobiologie a infekční lékařství. Praha: TRIOS spol. s r.o., 2012, roč. 18, č. 4, s. 109-114. ISSN 1211-264X.
Další formáty:   BibTeX LaTeX RIS
Základní údaje
Originální název Detekce a identifikace původců mykotických infekcí způsobených vláknitými houbami pomocí metod molekulární genetiky
Název anglicky Detection and identification of filamentous fungi causing mycoses using molecular genetic methods
Autoři BEJDÁK, Petr (203 Česká republika, garant, domácí), Martina LENGEROVÁ (203 Česká republika, domácí), Dita PALOUŠOVÁ (203 Česká republika, domácí), Pavlína VOLFOVÁ (203 Česká republika, domácí), Iva KOCMANOVÁ (203 Česká republika), Jiří MAYER (203 Česká republika, domácí) a Zdeněk RÁČIL (203 Česká republika, domácí).
Vydání Klinická mikrobiologie a infekční lékařství, Praha, TRIOS spol. s r.o. 2012, 1211-264X.
Další údaje
Originální jazyk čeština
Typ výsledku Článek v odborném periodiku
Obor 30200 3.2 Clinical medicine
Stát vydavatele Česká republika
Utajení není předmětem státního či obchodního tajemství
Kód RIV RIV/00216224:14740/12:00058700
Organizační jednotka Středoevropský technologický institut
Klíčová slova česky molekulární genetika; diagnostika; mykotické infekce; vláknité houby; barcoding; databáze sekvencí
Klíčová slova anglicky molecular genetics; diagnosis; mycoses; fiIamentous fungi; barcoding; sequence databases
Štítky ok, rivok
Příznaky Recenzováno
Změnil Změnila: Ing. Mgr. Věra Pospíšilíková, učo 9005. Změněno: 12. 2. 2013 09:07.
Anotace
Metody molekulární genetiky nabízejí možnost rychlé a citlivé detekce a identifikace houbových patogenů. Používané diagnostické metody jsou založeny převážně na PCR. Vzhledem k tomu, že houby jsou takřka všudypřítomné, je třeba zabránit kontaminaci v průběhu celého procesu od odběru vzorku až po laboratorní analýzy. Molekulárně genetické metody diagnostiky nepatři mezi kritéria EORTC/MSG pro stanovení diagnózy mykotických onemocnění, protože stále chybí mezilaboratorní standardizace těchto metod. Dalším důvodem je používání různých cílových genů pro PCR. Pro druhovou identifikaci se doporučuje použivat variabilní sekvence mezerníků (ITS) v genech pro rRNA. Určování hub pomocí sekvenování DNA s sebou nese jistá úskalí a interpretace výsledků může být v některých případech problematická. Sekvence DNA se vyhledávají a porovnávají v internetových databázích, z nichž nejznámější je GenBank. Spolehlivější data pro identifikaci hub však poskytují specializované mykologické databaze.
Anotace anglicky
Methods of molecular genetics offer rapid and sensitive detection and identification of fungal pathogens. The currently used methods are based mainly on PCR. With regard to the ubiquitous presence of fungi, it is important to prevent contamination during the whole process, from sampling to laboratory analyses. Molecular genetic methods are not included among the EORTC/MSG criteria used for the diagnosis of invasive fungal diseases since interlaboratory standardization is still missing. Anothet reason is the use of different target genes for PCR. ITS sequences from rDNA clusters are recommended for DNA barcoding of fungi. The use of DNA sequencing for identification of fungi in clinical samples has certain limitations and interpretation of results could be problematic in some cases. DNA sequences are searched and compared in public databases on the Internet, the best known of them being the GenBank. However,more reliable data for identification of fungi are offered by specialized mycological databases.
Návaznosti
FR-TI2/254, projekt VaVNázev: *Real-time PCR soupravy pro diagnostiku v onkologii (Akronym: ONKOKITY)
Investor: Ministerstvo průmyslu a obchodu ČR, TIP
Typ Název Vložil/a Vloženo Práva
petr_clanek.pdf   Verze souboru Pospíšilíková, V. 4. 2. 2013

Práva

Právo číst
 
Právo vkládat
 
Právo spravovat
  • osoba Mgr. Petr Bejdák, učo 106491
  • osoba doc. Mgr. Martina Lengerová, Ph.D., učo 10815
  • osoba Mgr. Iva Kocmanová, učo 168967
  • osoba Mgr. Pavlína Volfová, Ph.D., učo 185109
  • osoba prof. MUDr. Zdeněk Ráčil, Ph.D., učo 18831
  • osoba prof. MUDr. Jiří Mayer, CSc., učo 212
  • osoba Mgr. Dita Říčná, Ph.D., učo 229691
  • osoba Ing. Mgr. Věra Pospíšilíková, učo 9005
Atributy
 
Vytisknout
Požádat autora o autorský výtisk Zobrazeno: 24. 7. 2021 07:52