Identifikace a výskyt rodu Borrelia na území České republiky

BONCZEK, Ondřej, Jan LOCHMAN, Lukáš PEŠÁK and Omar ŠERÝ. Identifikace a výskyt rodu Borrelia na území České republiky (Identification and Occurrence of Borrelia genus in the Czech Republic). In Rutinní analýza nuklových kyselin molekulárně biologickými technikami, RANK 2013. 2013. ISBN 80-86895-28-9.

Basic information

• Original name: Identifikace a výskyt rodu Borrelia na území České republiky
• Name in Czech: Identifikace a výskyt rodu Borrelia na území České republiky
• Name (in English): Identification and Occurrence of Borrelia genus in the Czech Republic
• Authors: BONCZEK, Ondřej (203 Czech Republic, belonging to the institution), Jan LOCHMAN (203 Czech Republic, belonging to the institution), Lukáš PEŠÁK (203 Czech Republic, belonging to the institution) and Omar ŠERÝ (203 Czech Republic, guarantor, belonging to the institution).
• Edition: Rutinní analýza nuklových kyselin molekulárně biologickými technikami, RANK 2013, 2013.

Other information

• Original language: Czech
• Type of outcome: Conference abstract
• Field of Study: 10600 1.6 Biological sciences
• Country of publisher: Czech Republic
• Confidentiality degree: is not subject to a state or trade secret
• WWW: URL
• RIV identification code: RIV/00216224:14310/13:00067716
• Organization unit: Faculty of Science
• ISBN: 80-86895-28-9
• Keywords (in Czech): klíště; lymeská borelióza; Borrelia
• Keywords in English: tick; lyme borreliosis; Borrelia

Abstract

Borrelia burgdorferi sensu lato patří mezi gramnegativní spirochéty a je původcem vleklého, multisystémového onemocnění zvaného lymeská borelióza, jehož bezproblémová antibiotická léčba je značně závislá na včasné diagnostice a průkazu patogenu. Situaci komplikuje i dosavadní absence účinného očkování určeného pro humánní medicínu. Všeobecně uznávaným celosvětovým vektorem je klíště obecné (Ixodes ricinus) a jeho vývojové formy, není však vyloučen ani přenos jinými hematofágními členovci. V naší studii, která probíhala od roku 2008 do října 2012, bylo analyzováno 944 vzorků, převážně klíšťat, na přítomnost B. burgdorferi s. l. Izolace DNA byla prováděna pomocí kitu UltraClean BloodSpin DNA (Mo-Bio). K identifikaci patogenu byla použita vysoce senzitivní souprava EliGene Borrelia LC (Elisabeth Pharmacon), která je schopna specificky detekovat DNA pro boréliový flagellin u 1-10 borélií v 5 ul klinického vzorku při využití RealTime PCR systému na přístrojích LightCycler 2,0, LightCyler 480, LightCycler Nano, RotorGene a dalších. Celkem byla zaznamenána pozitivita u 23 % vzorků. Mezi nejvíce promořené kraje ČR se zařadil Jihočeský a Pardubický kraj. Z analýzy dat po jednotlivých měsících a letech vyšla relativně spolehlivá korelace s průměrnými teplotami ovzduší v ČR a promořeností klíšťat boréliemi. Potencionálně nejvyšší riziko nákazy se podle získaných dat vyskytuje v měsících duben až srpen. Z provedené sekvenační analýzy intergenové oblasti (IGS) pozitivních vzorků byla zjištěna největší přítomnost B. afzelii, následované B. garinii a dalšími druhy. Sekvenační analýza mj. potvrdila robustnost zvolené metody detekce a její možné použití pro včasnou diagnostiku a následnou vhodně zvolenou léčbu antibiotiky.

Abstract (in English)

Borrelia burgdorferi sensu lato is a gram-negative spirochete causing multisystem prolonged disease - Lyme borreliosis that problem-free antibiotic treatment significantly depends on early diagnostics and identification of pathogen. No reliable vaccination against borreliosis was developed for human medicine to this date. The most common global vector of transition is tick (Ixodes ricinus) and its developmental forms, although possibility of infection by a different blood sucking anthropod is not excluded. In our study which was realized from 2008 till October 2012 we analyzed 944 samples mostly of ticks for occurrence of B. burgdorferi s. l. The isolation of DNA was performed using UltraClean BloodSpin DNA Kit (MoBio). For identification of pathogen was used a high sensitive EliGene Borrelia LC (Elisabeth Pharmacon) kit which allows detecting 1–10 Borrelia flagellin DNA in 5 ul of clinic sample by using RealTime PCR systems on the instruments LightCycler 2,0, LightCyler 480, LightCycler Nano, RotorGene and ohters. Average infection rate was 23 % during those four years. Among regions with the highest portion of infected ticks belonged to Jihočeský and Pardubický region. From analysis of our data follows the occurrence of infected ticks which correlates well with annual and monthly weather in the Czech Republic (rain, temperature). From sequence analysis of intergenic spacer (IGS) of positive samples follows the highest occurrence of B. afzelii then B. garinii and the other species. Among others the sequence analysis confirmed robustion of our method of detection and its possible application for early diagnostic and subsequent suitable selected antibiotic treatment.