ŠTEFLOVÁ, Pavlína, Roman HOBZA, Boris VYSKOT a Eduard KEJNOVSKÝ. Strong Accumulation of Chloroplast DNA in the Y Chromosomes of Rumex acetosa and Silene latifolia. Cytogenetic and Genome Research. Basel: Karger, 2014, roč. 142, č. 1, s. 59-65. ISSN 1424-8581. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1159/000355212.
Další formáty:   BibTeX LaTeX RIS
Základní údaje
Originální název Strong Accumulation of Chloroplast DNA in the Y Chromosomes of Rumex acetosa and Silene latifolia
Autoři ŠTEFLOVÁ, Pavlína (203 Česká republika, domácí), Roman HOBZA (203 Česká republika), Boris VYSKOT (203 Česká republika) a Eduard KEJNOVSKÝ (203 Česká republika, garant, domácí).
Vydání Cytogenetic and Genome Research, Basel, Karger, 2014, 1424-8581.
Další údaje
Originální jazyk angličtina
Typ výsledku Článek v odborném periodiku
Obor Genetika a molekulární biologie
Stát vydavatele Švýcarsko
Utajení není předmětem státního či obchodního tajemství
WWW URL
Impakt faktor Impact factor: 1.561
Kód RIV RIV/00216224:14740/14:00074771
Organizační jednotka Středoevropský technologický institut
Doi http://dx.doi.org/10.1159/000355212
UT WoS 000329056600009
Klíčová slova anglicky Chloroplast DNA; Rumex acetosa; Sex chromosomes; Silene latifolia
Štítky kontrola MP, ok, rivok
Příznaky Mezinárodní význam, Recenzováno
Změnil Změnila: Olga Křížová, učo 56639. Změněno: 21. 2. 2014 13:38.
Anotace
Chloroplast DNA (cpDNA) sequences are often found in plant nuclear genomes, but patterns of their chromosomal distribution are not fully understood. The distribution of cpDNA on the sex chromosomes can only be studied in dioecious plant species possessing heteromorphic sex chromosomes. We reconstructed the whole chloroplast genome of Rumex acetosa (sorrel, XY1Y2 system) from next generation sequencing data. We systematically mapped the chromosomal localization of various regions of cpDNA in R. acetosa and in Silene latifolia (white campion, XY system) using fluorescence in situ hybridization. We found that cpDNA was accumulated on the Y chromosomes of both studied species. In R. acetosa, the entire Y chromosome gathered all parts of cpDNA equally. On the contrary, in S. latifolia, the majority of the cpDNA, corresponding to the single copy regions, was localized in the centromere of the Y chromosome, while the inverted repeat region was present also in other loci. We found a stronger accumulation of cpDNA on the more degenerated Y1 and Y2 chromosomes of R. acetosa than in evolutionary younger S. latifolia Y chromosome. Our data stressed the prominent role of the Y chromosome centromere in cpDNA accumulation.
Návaznosti
ED1.1.00/02.0068, projekt VaVNázev: CEITEC - central european institute of technology
EE2.3.20.0045, projekt VaVNázev: Podpora profesního růstu a mezinárodní integrace výzkumných týmů v oblasti molekulární medicíny
VytisknoutZobrazeno: 24. 4. 2024 21:56