STRNAD, Ondřej, Barbora KOZLÍKOVÁ a Jiří SOCHOR. Detection of Intramolecular Tunnels Connecting Sequence of Sites in Protein Structures. In Julio Saez-Rodriguez. Advances in Intelligent Systems and Computing. Switzerland: Springer International Publishing, 2014. s. 73-80. ISBN 978-3-319-07580-8. doi:10.1007/978-3-319-07581-5_9.
Další formáty:   BibTeX LaTeX RIS
Základní údaje
Originální název Detection of Intramolecular Tunnels Connecting Sequence of Sites in Protein Structures
Autoři STRNAD, Ondřej (203 Česká republika, garant, domácí), Barbora KOZLÍKOVÁ (203 Česká republika, domácí) a Jiří SOCHOR (203 Česká republika, domácí).
Vydání Switzerland, Advances in Intelligent Systems and Computing, od s. 73-80, 8 s. 2014.
Nakladatel Springer International Publishing
Další údaje
Originální jazyk angličtina
Typ výsledku Stať ve sborníku
Obor 10201 Computer sciences, information science, bioinformatics
Stát vydavatele Švýcarsko
Utajení není předmětem státního či obchodního tajemství
Forma vydání tištěná verze "print"
Kód RIV RIV/00216224:14330/14:00074781
Organizační jednotka Fakulta informatiky
ISBN 978-3-319-07580-8
ISSN 2194-5357
Doi http://dx.doi.org/10.1007/978-3-319-07581-5_9
UT WoS 000351276700009
Klíčová slova česky proteinová struktura; tunel; intramolekulární tunel; aktivní místo
Klíčová slova anglicky protein structure; tunnel; intramolecular tunnel; active site
Příznaky Mezinárodní význam, Recenzováno
Změnil Změnil: RNDr. Pavel Šmerk, Ph.D., učo 3880. Změněno: 27. 4. 2015 11:45.
Anotace
Proteins are essential for functioning of all living organisms and studying their inner structure and functions has been of a high importance. Many studies concentrated on detection of various inner structures inside macromolecules (e.g. tunnels, channels, pores) which play an essential role in the functioning of a large number of proteins. Here we present a novel approach to a detection of intramolecular tunnels. These pathways may facilitate the transport of reaction intermediates among buried active sites. The results obtained by the proposed algorithm were compared to intramolecular tunnels whose presence in given structures is already known. The algorithm is able to also identify other inner structures, such as channels or pores.
Návaznosti
LG13010, projekt VaVNázev: Zastoupení ČR v European Research Consortium for Informatics and Mathematics (Akronym: ERCIM-CZ)
Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, Zastoupení ČR v European Research Consortium for Informatics and Mathematics
MUNI/A/0915/2013, interní kód MUNázev: Výzkum FI ve vybraných oblastech aplikované informatiky (Akronym: FI_Apl_Inf_2014)
Investor: Masarykova univerzita, Výzkum FI ve vybraných oblastech aplikované informatiky, DO R. 2020_Kategorie A - Specifický výzkum - Studentské výzkumné projekty
VytisknoutZobrazeno: 19. 3. 2024 03:04