J 2013

Extension of microRNA expression pattern associated with high-risk neuroblastoma

BIENERTOVÁ VAŠKŮ, Julie, Pavel MAZÁNEK, Renata HÉŽOVÁ, Anna ČURDOVÁ, Jana NEKVINDOVÁ et. al.

Basic information

Original name

Extension of microRNA expression pattern associated with high-risk neuroblastoma

Authors

BIENERTOVÁ VAŠKŮ, Julie (203 Czech Republic, guarantor, belonging to the institution), Pavel MAZÁNEK (203 Czech Republic, belonging to the institution), Renata HÉŽOVÁ (203 Czech Republic, belonging to the institution), Anna ČURDOVÁ (203 Czech Republic, belonging to the institution), Jana NEKVINDOVÁ (203 Czech Republic), Leoš KŘEN (203 Czech Republic, belonging to the institution), Jaroslav ŠTĚRBA (203 Czech Republic, belonging to the institution) and Ondřej SLABÝ (203 Czech Republic, belonging to the institution)

Edition

Tumor Biology, Dordrecht, Springer, 2013, 1010-4283

Other information

Language

English

Type of outcome

Článek v odborném periodiku

Field of Study

30200 3.2 Clinical medicine

Country of publisher

Netherlands

Confidentiality degree

není předmětem státního či obchodního tajemství

References:

Impact factor

Impact factor: 2.840

RIV identification code

RIV/00216224:14110/13:00070752

Organization unit

Faculty of Medicine

UT WoS

000321912500041

Keywords (in Czech)

Neuroblastom, stratifikaci rizika, mikroRNA, Expression profilování

Keywords in English

Neuroblastoma; Risk stratification; microRNA; Expression profiling

Tags

Tags

International impact, Reviewed
Změněno: 23/4/2014 10:08, Soňa Böhmová

Abstract

V originále

Clinical behavior of neuroblastoma (NBL) is remarkably heterogeneous, as it ranges from spontaneous regression to aggressive clinical phenotype and death. There is increasing body of evidence demonstrating thatmicroRNAs could be considered the potential biomarkers for clinical applications in NBL. In this report, we focus on molecular characterization of high-risk as well as low-risk and intermediate-risk NBL cases in the context of the microRNA expression profile that is specific for the given risk category of the disease.We investigated a total of 30 NBL patients, out of whom there were 19 patients with low- to intermediate-risk and 11 with high-risk NBLs as defined by the Clinical Oncology Group. We determined the expression profiles of 754 microRNAs (miRNAs), whereas the miRNA expression levels were normalized to RNU44, mean expression levels were calculated, and data were analyzed by use of the microarray biostatistical approaches. We identified the signature of 38 miRNAs differentially expressed between these groups of NBL patients (P<0.05): 17 miRNAs were upregulated and 21 miRNAs were downregulated in the tumors of high-risk NBL patients. We confirm some of the previous observations and we report several new microRNAs associated with aggressive NBL, both being relevant subjects for further translational validation and functional studies.

In Czech

Klinické chování neuroblastomu ( NBL ) je pozoruhodně heterogenní , protože se pohybuje v rozmezí od spontánní návrat k agresivním klinickým fenotypem a smrti . tam je rostoucí množství důkazů prokázat thatmicroRNAs mohl být považován za potenciální biomarkery pro klinické aplikace v NBL . V této zprávě se zaměřujeme na molekulární charakteristika s vysokým rizikem , stejně jako s nízkým rizikem a se středním rizikem NBL případy v souvislosti s mikroRNA Výraz profil, který je specifický pro danou kategorii rizika disease.We zkoumala celkem 30 NBL pacientů , z , kterým bylo 19 pacientů s nízkým až středním rizikem a 11 s vysokým rizikem NBLs jak jsou definovány v klinické onkologie Group . Zjistili jsme expresní profily 754 mikroRNA ( miRNA ) , zatímcoexprese miRNA hladiny byly normalizovány na RNU44 , znamená hladiny exprese byly vypočteny , a data byla analyzována použitím mikročipu Biostatistické přístupy . Identifikovali jsme podpis 38 miRNA rozdílně exprimovány mezi těmito skupinami NBL pacientů ( P < 0,05 ) : 17 miRNA byla up-regulována a 21 miRNA byly downregulated v nádory s vysokým rizikem NBL pacientů . Potvrzujeme, některé z předchozích pozorování a se hlásí několik nových microRNAs spojené s agresivní NBL , obě jsou důležité předměty pro další translační validace a funkční studie .

Links

ED1.1.00/02.0068, research and development project
Name: CEITEC - central european institute of technology

Files attached