J 2013

How to understand quantum chemical computations on DNA and RNA systems? A practical guide for non-specialists

ŠPONER, Jiří, Judit ŠPONEROVÁ, Arnošt MLÁDEK, Pavel BANÁŠ, Petr JURECKA et. al.

Základní údaje

Originální název

How to understand quantum chemical computations on DNA and RNA systems? A practical guide for non-specialists

Autoři

ŠPONER, Jiří (203 Česká republika, garant, domácí), Judit ŠPONEROVÁ (348 Maďarsko, domácí), Arnošt MLÁDEK (203 Česká republika, domácí), Pavel BANÁŠ (203 Česká republika), Petr JURECKA (203 Česká republika) a Michal OTYEPKA (203 Česká republika)

Vydání

Methods, SAN DIEGO, ACADEMIC PRESS INC ELSEVIER SCIENCE, 2013, 1046-2023

Další údaje

Jazyk

angličtina

Typ výsledku

Článek v odborném periodiku

Obor

10600 1.6 Biological sciences

Stát vydavatele

Spojené státy

Utajení

není předmětem státního či obchodního tajemství

Impakt faktor

Impact factor: 3.221

Kód RIV

RIV/00216224:14740/13:00072151

Organizační jednotka

Středoevropský technologický institut

DOI

http://dx.doi.org/10.1016/j.ymeth.2013.05.025

UT WoS

000326430100002

Klíčová slova anglicky

DNA structure; Quantum chemistry; Molecular mechanics; Molecular structures and energies

Štítky

ok, rivok

Příznaky

Mezinárodní význam, Recenzováno
Změněno: 15. 2. 2014 17:53, Olga Křížová

Anotace

V originále

In this review primarily written for non-experts we explain basic methodological aspects and interpretation of modern quantum chemical (QM) computations applied to nucleic acids. We introduce current reference QM computations on small model systems consisting of dozens of atoms. Then we comment on recent advance of fast and accurate dispersion-corrected density functional theory methods, which will allow computations of small but complete nucleic acids building blocks in the near future. The qualitative difference between QM and molecular mechanics (MM, force field) computations is discussed. We also explain relation of QM and molecular simulation computations to experiments. (C) 2013 Elsevier Inc. All rights reserved.

Návaznosti

ED1.1.00/02.0068, projekt VaV
Název: CEITEC - central european institute of technology
Zobrazeno: 9. 11. 2024 11:29