ŠEDO, Ondrej, Andrea VÁVROVÁ, Marta MEDKOVÁ, Ludmila TVRZOVÁ a Zbyněk ZDRÁHAL. The influence of growth conditions on strain differentiation within the Lactobacillus acidophilus group using matrix-assisted laser desorption/ionization time-of-flight mass spectrometry profiling. Rapid Communications in Mass Spectrometry. Hoboken, USA: WILEY-BLACKWELL, 2013, roč. 27, č. 24, s. 2729-2736. ISSN 0951-4198. doi:10.1002/rcm.6741.
Další formáty:   BibTeX LaTeX RIS
Základní údaje
Originální název The influence of growth conditions on strain differentiation within the Lactobacillus acidophilus group using matrix-assisted laser desorption/ionization time-of-flight mass spectrometry profiling
Autoři ŠEDO, Ondrej (203 Česká republika, domácí), Andrea VÁVROVÁ (203 Česká republika, domácí), Marta MEDKOVÁ (203 Česká republika, domácí), Ludmila TVRZOVÁ (203 Česká republika, domácí) a Zbyněk ZDRÁHAL (203 Česká republika, garant, domácí).
Vydání Rapid Communications in Mass Spectrometry, Hoboken, USA, WILEY-BLACKWELL, 2013, 0951-4198.
Další údaje
Originální jazyk angličtina
Typ výsledku Článek v odborném periodiku
Obor 10406 Analytical chemistry
Stát vydavatele Spojené státy
Utajení není předmětem státního či obchodního tajemství
WWW URL
Impakt faktor Impact factor: 2.642
Kód RIV RIV/00216224:14740/13:00066925
Organizační jednotka Středoevropský technologický institut
Doi http://dx.doi.org/10.1002/rcm.6741
UT WoS 000330107600001
Klíčová slova anglicky DESORPTION-IONIZATION-TIME; MALDI-TOF-MS; LACTIC-ACID BACTERIA; STAPHYLOCOCCUS-AUREUS; RAPID IDENTIFICATION; MICROORGANISM IDENTIFICATION; WHOLE CELLS; CLASSIFICATION; DISCRIMINATION; CULTURE
Štítky podil, rivok
Příznaky Mezinárodní význam, Recenzováno
Změnil Změnila: Olga Křížová, učo 56639. Změněno: 5. 4. 2014 07:37.
Anotace
For the purpose of this study, we used an extraction protocol recommended for clinical laboratories for MALDI-TOF MS profiling of bacteria. Seventeen closely related strains of the Lactobacillus acidophilus group were cultivated under various growth conditions (growth medium, time, and temperature) and analyzed. Out of a total of 327 samples, 80 % were correctly assigned to the species level and 13 % only to the genus level. When using data obtained from strains cultured for lengthy periods (7 days), the identification success rate was reduced due to poor signal quality, whereas with shorter cultivation times there was no influence of growth conditions on the assignment of particular strains to their corresponding species. However, variations in certain cultivation parameters were found to influence identification and differentiation of most of the examined strains. Strain discrimination was frequently found to be dependent on the selection of culture conditions. MALDI-TOF MS data treatment (strain-specific peak detection, BioTyper scoring, subtyping, or cluster analysis) also contributed to the discriminatory power of the method.
Návaznosti
ED1.1.00/02.0068, projekt VaVNázev: CEITEC - central european institute of technology
GA13-26693S, projekt VaVNázev: Genetická diverzita a fylogeneze rodu Acinetobacter v přírodních ekosystémech.
Investor: Grantová agentura ČR, Genetická diverzita a fylogeneze rodu Acinetobacter v přírodních ekosystémech
VytisknoutZobrazeno: 16. 5. 2022 13:52