J 2013

High-Resolution Insight into G-Overhang Architecture

HAENSEL, Robert, Frank LOEHR, Lukáš TRANTÍREK a Volker DOETSCH

Základní údaje

Originální název

High-Resolution Insight into G-Overhang Architecture

Autoři

HAENSEL, Robert (276 Německo), Frank LOEHR (276 Německo), Lukáš TRANTÍREK (203 Česká republika, garant, domácí) a Volker DOETSCH (276 Německo)

Vydání

Journal of the American Chemical Society, Washington, American Chemical Society, 2013, 0002-7863

Další údaje

Jazyk

angličtina

Typ výsledku

Článek v odborném periodiku

Obor

10600 1.6 Biological sciences

Stát vydavatele

Spojené státy

Utajení

není předmětem státního či obchodního tajemství

Impakt faktor

Impact factor: 11.444

Kód RIV

RIV/00216224:14740/13:00072647

Organizační jednotka

Středoevropský technologický institut

DOI

http://dx.doi.org/10.1021/ja312403b

UT WoS

000315373000062

Klíčová slova anglicky

HUMAN TELOMERIC DNA; INTRAMOLECULAR G-QUADRUPLEX; K+ SOLUTION; NMR-SPECTROSCOPY; SMALL-MOLECULE; HUMAN CANCER; PULSED EPR; STABILITY; SEQUENCE; CONFORMATIONS

Štítky

ok, rivok

Příznaky

Mezinárodní význam, Recenzováno
Změněno: 20. 3. 2014 08:25, Olga Křížová

Anotace

V originále

NMR and fluorescence spectroscopy were used to address the effect of intracellular molecular crowding and related hydration on a model telomeric G-quadruplex (G4) DNA structure (d(AG(3)(TTAGGG)(3))). d(AG(3)(TTAGGG)(3)) prevalently adopted the hybrid-1 conformation in vivo, ex vivo, and in dilute potassium-based solution, while it formed the parallel propeller fold in water-depleted potassium-based solution, a commonly used model system for studying intracellular molecular crowding. The dilute potassium-based solution appeared to imitate the properties of the cellular environment required for d(AG(3)(TTAGGG)(3)) folding under in vivo and ex vivo conditions. High-resolution NMR investigations of site-specifically N-15-labeled G4 units in native-like single-stranded telomeric DNA revealed that the 3'-terminal and internal G4 unit predominantly coexist in 2-tetrad antiparallel basket and hybrid-2 structures that are arranged in "beads-on-a-string"-like fashion. Our data provide the first high-resolution insight into the telomeric G-overhang architecture under essentially physiological conditions and identify the 2-tetrad antiparallel basket and hybrid-2 topologies as the structural targets for the development of telomere-specific G4 ligands.

Návaznosti

ED1.1.00/02.0068, projekt VaV
Název: CEITEC - central european institute of technology
Zobrazeno: 10. 11. 2024 23:05