TUDEK, Agnieszka, Odil Porrua FUERTE, Tomasz KABZINSKI, Michael LIDSCHREIBER, Karel KUBÍČEK, Andrea FOŘTOVÁ, Francoise LACROUTE, Štěpánka VAŇÁČOVÁ, Patrick CRAMER, Richard ŠTEFL a Domenico LIBRI. Molecular Basis for Coordinating Transcription Termination with Noncoding RNA Degradation. Molecular Cell. CAMBRIDGE: CELL PRESS, 2014, roč. 55, č. 3, s. 467-481. ISSN 1097-2765. doi:10.1016/j.molcel.2014.05.031.
Další formáty:   BibTeX LaTeX RIS
Základní údaje
Originální název Molecular Basis for Coordinating Transcription Termination with Noncoding RNA Degradation
Autoři TUDEK, Agnieszka (250 Francie), Odil Porrua FUERTE (724 Španělsko), Tomasz KABZINSKI (616 Polsko, domácí), Michael LIDSCHREIBER (276 Německo), Karel KUBÍČEK (203 Česká republika, domácí), Andrea FOŘTOVÁ (203 Česká republika, domácí), Francoise LACROUTE (250 Francie), Štěpánka VAŇÁČOVÁ (203 Česká republika, domácí), Patrick CRAMER (276 Německo), Richard ŠTEFL (203 Česká republika, garant, domácí) a Domenico LIBRI (380 Itálie).
Vydání Molecular Cell, CAMBRIDGE, CELL PRESS, 2014, 1097-2765.
Další údaje
Originální jazyk angličtina
Typ výsledku Článek v odborném periodiku
Obor 10610 Biophysics
Stát vydavatele Spojené státy
Utajení není předmětem státního či obchodního tajemství
WWW URL
Impakt faktor Impact factor: 14.018
Kód RIV RIV/00216224:14740/14:00073613
Organizační jednotka Středoevropský technologický institut
Doi http://dx.doi.org/10.1016/j.molcel.2014.05.031
UT WoS 000340646600012
Klíčová slova anglicky CRYPTIC UNSTABLE TRANSCRIPTS; POLYMERASE-II TRANSCRIPTS; BINDING PROTEINS NRD1; QUALITY-CONTROL; SACCHAROMYCES-CEREVISIAE; PERVASIVE TRANSCRIPTION; BIDIRECTIONAL PROMOTERS; POLY(A) POLYMERASE; NUCLEAR EXOSOME; TRAMP COMPLEX
Štítky kontrola MP, MP, OA, rivok
Příznaky Mezinárodní význam, Recenzováno
Změnil Změnila: Martina Prášilová, učo 342282. Změněno: 29. 10. 2014 09:37.
Anotace
The Nrd1-Nab3-Sen1 (NNS) complex is essential for controlling pervasive transcription and generating sn/snoRNAs in S. cerevisiae. The NNS complex terminates transcription of noncoding RNA genes and promotes exosome-dependent processing/degradation of the released transcripts. The Trf4-Air2-Mtr4 (TRAMP) complex polyadenylates NNS target RNAs and favors their degradation. NNS-dependent termination and degradation are coupled, but the mechanism underlying this coupling remains enigmatic. Here we provide structural and functional evidence demonstrating that the same domain of Nrd1p interacts with RNA polymerase II and Trf4p in a mutually exclusive manner, thus defining two alternative forms of the NNS complex, one involved in termination and the other in degradation. We show that the Nrd1-Trf4 interaction is required for optimal exosome activity in vivo and for the stimulation of polyadenylation of NNS targets by TRAMP in vitro. We propose that transcription termination and RNA degradation are coordinated by switching between two alternative partners of the NNS complex.
Návaznosti
ED1.1.00/02.0068, projekt VaVNázev: CEITEC - central european institute of technology
EE2.3.20.0042, projekt VaVNázev: Internacionalizace programu Strukturní biologie s důrazem na rozvoj nových směrů výzkumu
GA13-18344S, projekt VaVNázev: Studium kódu CTD RNA polymerázy II
Investor: Grantová agentura ČR, Studium kódu CTD RNA polymerázy II
GBP305/12/G034, projekt VaVNázev: Centrum biologie RNA
084316/Z/07/Z, interní kód MUNázev: Polyadenylation and mechanisms of nuclear RNA quality control
Investor: Wellcome Trust, Polyadenylation and mechanisms of nuclear RNA quality control
VytisknoutZobrazeno: 4. 10. 2022 22:58