KOZLÍKOVÁ, Barbora, Eva ŠEBESTOVÁ, Vilém ŠUSTR, Jan BREZOVSKÝ, Ondřej STRNAD, Lukáš DANIEL, David BEDNÁŘ, Antonín PAVELKA, Martin MANAK, Martin BEZDĚKA, Petr BENEŠ, Matúš KOTRY, Artur Wiktor GORA, Jiří DAMBORSKÝ a Jiří SOCHOR. CAVER Analyst 1.0: Graphic tool for interactive visualization and analysis of tunnels and channels in protein structures. Bioinformatics. Oxford University Press, 2014, roč. 30, č. 18, s. 2684-2685. ISSN 1367-4803. doi:10.1093/bioinformatics/btu364.
Další formáty:   BibTeX LaTeX RIS
Základní údaje
Originální název CAVER Analyst 1.0: Graphic tool for interactive visualization and analysis of tunnels and channels in protein structures
Název česky CAVER Analyst 1.0: Grafický nástroj pro interaktivní vizualizaci a analýzu tunelů a kanálů v proteinech
Autoři KOZLÍKOVÁ, Barbora (203 Česká republika, domácí), Eva ŠEBESTOVÁ (203 Česká republika, domácí), Vilém ŠUSTR (203 Česká republika, domácí), Jan BREZOVSKÝ (203 Česká republika, domácí), Ondřej STRNAD (203 Česká republika, domácí), Lukáš DANIEL (203 Česká republika, domácí), David BEDNÁŘ (203 Česká republika, domácí), Antonín PAVELKA (203 Česká republika, domácí), Martin MANAK (203 Česká republika), Martin BEZDĚKA (203 Česká republika, domácí), Petr BENEŠ (203 Česká republika, domácí), Matúš KOTRY (703 Slovensko, domácí), Artur Wiktor GORA (616 Polsko, domácí), Jiří DAMBORSKÝ (203 Česká republika, domácí) a Jiří SOCHOR (203 Česká republika, garant, domácí).
Vydání Bioinformatics, Oxford University Press, 2014, 1367-4803.
Další údaje
Originální jazyk angličtina
Typ výsledku Článek v odborném periodiku
Obor 10201 Computer sciences, information science, bioinformatics
Stát vydavatele Velká Británie a Severní Irsko
Utajení není předmětem státního či obchodního tajemství
Impakt faktor Impact factor: 4.981
Kód RIV RIV/00216224:14330/14:00073649
Organizační jednotka Fakulta informatiky
Doi http://dx.doi.org/10.1093/bioinformatics/btu364
UT WoS 000342913000027
Klíčová slova anglicky protein; visualization; tunnel; cavity
Štítky AKR
Příznaky Mezinárodní význam, Recenzováno
Změnil Změnil: prof. Ing. Jiří Sochor, CSc., učo 2446. Změněno: 21. 6. 2015 20:05.
Anotace
The transport of ligands, ions or solvent molecules into proteins with buried binding sites or through the membrane is enabled by protein tunnels and channels. CAVER Analyst is a software tool for calculation, analysis and real-time visualization of access tunnels and channels in static and dynamic protein structures. It provides an intuitive graphic user interface for setting up the calculation and interactive exploration of identified tunnels/channels and their characteristics.
Návaznosti
GAP202/10/1435, projekt VaVNázev: Analýza a vizualizace proteinových struktur
Investor: Grantová agentura ČR, Analýza a vizualizace proteinových struktur
LC06008, projekt VaVNázev: Centrum počítačové grafiky (Akronym: CPG)
Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, CPG - Centrum počítačové grafiky
MUNI/A/0915/2013, interní kód MUNázev: Výzkum FI ve vybraných oblastech aplikované informatiky (Akronym: FI_Apl_Inf_2014)
Investor: Masarykova univerzita, Výzkum FI ve vybraných oblastech aplikované informatiky, DO R. 2020_Kategorie A - Specifický výzkum - Studentské výzkumné projekty
VytisknoutZobrazeno: 19. 3. 2024 05:51