Targeted-random mutagenesis of PA-IIL lectin and high-throughput screening of mutant library

MRÁZKOVÁ, Jana, Martina POKORNÁ and Michaela WIMMEROVÁ. Targeted-random mutagenesis of PA-IIL lectin and high-throughput screening of mutant library. In XVI. Setkání biochemiků a molekulárních biologů. 2014. ISBN 978-80-210-7340-1.

Basic information

• Original name: Targeted-random mutagenesis of PA-IIL lectin and high-throughput screening of mutant library
• Name in Czech: Cíleně-náhodná mutageneze lektinu PA-IIL a high-throughput screening knihovny mutantů
• Authors: MRÁZKOVÁ, Jana (203 Czech Republic, belonging to the institution), Martina POKORNÁ (203 Czech Republic, belonging to the institution) and Michaela WIMMEROVÁ (203 Czech Republic, guarantor, belonging to the institution).
• Edition: XVI. Setkání biochemiků a molekulárních biologů, 2014.

Other information

• Original language: English
• Type of outcome: Conference abstract
• Field of Study: 10600 1.6 Biological sciences
• Country of publisher: Czech Republic
• Confidentiality degree: is not subject to a state or trade secret
• RIV identification code: RIV/00216224:14310/14:00074241
• Organization unit: Faculty of Science
• ISBN: 978-80-210-7340-1
• Keywords (in Czech): lektiny; PA-IIL; Pseudomonas aeruginosa; cíleně-náhodná mutageneze; high-throughput screening; knihovny mutantů
• Keywords in English: lectins; PA-IIL; Pseudomonas aeruginosa; targeted-random mutagenesis; high-throughput screening; mutant library

Abstract

PA-IIL lectin from Pseudomonas aeruginosa shows a unique binding mode among bacterial lectins because it binds saccharides through two calcium cations. Its features make this protein a good candidate for tuning its affinity and specificity. Two amino acids responsible for sugar binding were chosen for targeted-random mutagenesis. If this approach is used, it is necessary to utilize high-throughput screening of mutant libraries for identification of mutants with interestingly modified specificity and/or affinity.

Abstract (in Czech)

Lektin PA-IIL z bakterie Pseudomonas aeruginosa vykazuje unikátní vazebný mód mezi bakteriálními lektiny, protože váže sacharidy přes dva vápenaté kationty. Vlastnosti tohoto proteinu z něj dělají dobrého kandidáta pro vylepšení jeho afinity a specifity. Dvě aminokyseliny zodpovědné za vazbu cukrů byly vybrány pro cíleně-náhodnou mutagenezi. Jestliže je vybrán tento přístup, je nezbytné použít high-throughput screening knihoven mutantů pro identifikaci mutantů se zajímavě modifikovanou specifitou anebo afinitou.

Links

• CZ.1.05/1.1.00/02.0068, interní kód MU: Name: CEITEC - středoevropský technologický institut (Acronym: CEITEC)

Investor: Ministry of Education, Youth and Sports of the CR, CEITEC - Central European Institute of Technology, 1.1 European Centres of Excellence

• GA13-25401S, research and development project: Name: Studium proteinů z patogenů zapojených do rozpoznávání hostitelského organismu

Investor: Czech Science Foundation