KMÍNKOVÁ, Jana, Marek MRÁZ, Kristína ZÁPRAŽNÁ, Veronika NAVRKALOVÁ, Boris TICHÝ, Karla PLEVOVÁ, Jitka MALČÍKOVÁ, Kateřina ČERNÁ, Tobias RAUSCH, Vladimír BENEŠ, Yvona BRYCHTOVÁ, Michael DOUBEK, Jiří MAYER a Šárka POSPÍŠILOVÁ. Identification of novel sequence variations in microRNAs in chronic lymphocytic leukemia. Carcinogenesis. Oxford: Oxford University Press, 2014, roč. 35, č. 5, s. 992-1002. ISSN 0143-3334. doi:10.1093/carcin/bgt396.
Další formáty:   BibTeX LaTeX RIS
Základní údaje
Originální název Identification of novel sequence variations in microRNAs in chronic lymphocytic leukemia
Autoři KMÍNKOVÁ, Jana (203 Česká republika, domácí), Marek MRÁZ (203 Česká republika, domácí), Kristína ZÁPRAŽNÁ (203 Česká republika, domácí), Veronika NAVRKALOVÁ (203 Česká republika, domácí), Boris TICHÝ (203 Česká republika, domácí), Karla PLEVOVÁ (203 Česká republika, domácí), Jitka MALČÍKOVÁ (203 Česká republika, domácí), Kateřina ČERNÁ (203 Česká republika, domácí), Tobias RAUSCH (276 Německo), Vladimír BENEŠ (276 Německo), Yvona BRYCHTOVÁ (203 Česká republika, domácí), Michael DOUBEK (203 Česká republika, domácí), Jiří MAYER (203 Česká republika, domácí) a Šárka POSPÍŠILOVÁ (203 Česká republika, garant, domácí).
Vydání Carcinogenesis, Oxford, Oxford University Press, 2014, 0143-3334.
Další údaje
Originální jazyk angličtina
Typ výsledku Článek v odborném periodiku
Obor 30200 3.2 Clinical medicine
Stát vydavatele Velká Británie
Utajení není předmětem státního či obchodního tajemství
WWW URL
Impakt faktor Impact factor: 5.334
Kód RIV RIV/00216224:14740/14:00078304
Organizační jednotka Středoevropský technologický institut
Doi http://dx.doi.org/10.1093/carcin/bgt396
UT WoS 000336043800004
Klíčová slova anglicky PAPILLARY THYROID-CARCINOMA; COLORECTAL-CANCER; HEPATOCELLULAR-CARCINOMA; FUNCTIONAL POLYMORPHISM; DROSHA-DGCR8 COMPLEX; EXPRESSION; RNA; RISK; GENES; SURVIVAL
Štítky EL OK, kontrola MP, ok, podil, podíl ceitec, rivok
Příznaky Mezinárodní význam, Recenzováno
Změnil Změnila: Martina Prášilová, učo 342282. Změněno: 28. 4. 2015 12:02.
Anotace
We have analyzed the miRNA sequence variations in patients with CLL and the effect of these variations on their secondary structure and expression.MicroRNA (miRNA) expression is deregulated in many tumors including chronic lymphocytic leukemia (CLL). Although the particular mechanism(s) responsible for their aberrant expression is not well characterized, the presence of mutations and single-nucleotide polymorphisms (SNPs) in miRNA genes, possibly affecting their secondary structure and expression, has been described. In CLL; however, the impact and frequency of such variations have yet to be elucidated. Using a custom resequencing microarray, we screened sequence variations in 109 cancer-related pre-miRNAs in 98 CLL patients. Additionally, the primary regions of miR-29b-2/29c and miR-16-1 were analyzed by Sanger sequencing in another cohort of 213 and 193 CLL patients, respectively. Altogether, we describe six novel miR-sequence variations and the presence of SNPs (n = 27), most of which changed the miR-secondary structure. Moreover, some of the identified SNPs have a significantly different frequency in CLL when compared with a control population. Additionally, we identified a novel variation in miR-16-1 that had not been described previously in CLL patients. We show that this variation affects the expression of mature miR-16-1. We also show that the expression of another miRNA with pathogenetic relevance for CLL, namely miR-29b-2, is influenced by the presence of a polymorphic insertion, which is more frequent in CLL than in a control population. Altogether, these data suggest that sequence variations may occur during CLL development and/or progression.
Návaznosti
ED1.1.00/02.0068, projekt VaVNázev: CEITEC - central european institute of technology
EE2.3.20.0045, projekt VaVNázev: Podpora profesního růstu a mezinárodní integrace výzkumných týmů v oblasti molekulární medicíny
EE2.3.30.0009, projekt VaVNázev: Zaměstnáním čerstvých absolventů doktorského studia k vědecké excelenci
MUNI/A/0723/2012, interní kód MUNázev: Nové klinické a diagnostické přístupy u hematogických malignit (Akronym: NoKliDiPřiHeMa)
Investor: Masarykova univerzita, Nové klinické a diagnostické přístupy u hematogických malignit, DO R. 2020_Kategorie A - Specifický výzkum - Studentské výzkumné projekty
NT11218, projekt VaVNázev: Funkční a strukturní změny microRNA u lymfoproliferativních malignit a jejich vliv na prognózu onemocnění a predikci léčebné odpovědi
NT13493, projekt VaVNázev: Molekulární charakterizace B buněčných receptorů a jejich vztah k evoluci genetických změn u chronické lymfocytární leukémie
7E13008, projekt VaVNázev: Next Generation Sequencing Platform for Targeted Personalized Therapy of Leukemia (Akronym: NGS-PTL)
Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, Next Generation Sequencing Platform for Targeted Personalized Therapy of Leukemia
VytisknoutZobrazeno: 23. 5. 2022 07:30