SHUGAY, M., O.V. BRITANOVA, E.M. MERZLYAK, M.A. TURCHANINOVA, I.Z. MAMEDOV, T.R. TUGANBAEV, D.A. BOLOTIN, D.B. STAROVEROV, E.V. PUTINTSEVA, Karla PLEVOVÁ, C. LINNEMANN, D. SHAGIN, Šárka POSPÍŠILOVÁ, S. LUKYANOV, T.N. SCHUMACHER a Dmitriy CHUDAKOV. Towards error-free profiling of immune repertoires. Nature Methods. LONDON: NATURE PUBLISHING GROUP, 2014, roč. 11, č. 6, s. "653"- "+", 5 s. ISSN 1548-7091. doi:10.1038/NMETH.2960.
Další formáty:   BibTeX LaTeX RIS
Základní údaje
Originální název Towards error-free profiling of immune repertoires
Autoři SHUGAY, M. (643 Rusko), O.V. BRITANOVA (643 Rusko), E.M. MERZLYAK (643 Rusko), M.A. TURCHANINOVA (643 Rusko), I.Z. MAMEDOV (643 Rusko), T.R. TUGANBAEV (643 Rusko), D.A. BOLOTIN (643 Rusko), D.B. STAROVEROV (643 Rusko), E.V. PUTINTSEVA (643 Rusko), Karla PLEVOVÁ (203 Česká republika, domácí), C. LINNEMANN (528 Nizozemsko), D. SHAGIN (643 Rusko), Šárka POSPÍŠILOVÁ (203 Česká republika, garant, domácí), S. LUKYANOV (643 Rusko), T.N. SCHUMACHER (528 Nizozemsko) a Dmitriy CHUDAKOV (643 Rusko, domácí).
Vydání Nature Methods, LONDON, NATURE PUBLISHING GROUP, 2014, 1548-7091.
Další údaje
Originální jazyk angličtina
Typ výsledku Článek v odborném periodiku
Obor 10600 1.6 Biological sciences
Stát vydavatele Velká Británie
Utajení není předmětem státního či obchodního tajemství
WWW URL
Impakt faktor Impact factor: 32.072
Kód RIV RIV/00216224:14740/14:00078399
Organizační jednotka Středoevropský technologický institut
Doi http://dx.doi.org/10.1038/NMETH.2960
UT WoS 000336899300025
Klíčová slova anglicky SEQUENCE-ANALYSIS; DEEP; QUANTIFICATION; DIVERSITY
Štítky kontrola MP, podíl ceitec, rivok
Příznaky Mezinárodní význam, Recenzováno
Změnil Změnila: Martina Prášilová, učo 342282. Změněno: 28. 4. 2015 13:12.
Anotace
Deep profiling of antibody and T cell-receptor repertoires by means of high-throughput sequencing has become an attractive approach for adaptive immunity studies, but its power is substantially compromised by the accumulation of PCR and sequencing errors. Here we report MIGEC (molecular identifier groups-based error correction), a strategy for high-throughput sequencing data analysis. MIGEC allows for nearly absolute error correction while fully preserving the natural diversity of complex immune repertoires.
Návaznosti
ED1.1.00/02.0068, projekt VaVNázev: CEITEC - central european institute of technology
VytisknoutZobrazeno: 16. 5. 2022 13:55