KUDEROVÁ, Alena, Lucia GALLOVÁ, Katarína KURICOVÁ, Eliška NEJEDLÁ, Anna ČURDOVÁ, Lenka MICENKOVÁ, Ondřej PLÍHAL, David ŠMAJS, Lukáš SPÍCHAL a Jan HEJÁTKO. Identification of AHK2- and AHK3-like cytokinin receptors in Brassica napus reveals two subfamilies of AHK2 orthologues. Journal of Experimental Botany. Oxford: OXFORD UNIV PRESS, 2015, roč. 66, č. 1, s. 339-353. ISSN 0022-0957. doi:10.1093/jxb/eru422.
Další formáty:   BibTeX LaTeX RIS
Základní údaje
Originální název Identification of AHK2- and AHK3-like cytokinin receptors in Brassica napus reveals two subfamilies of AHK2 orthologues
Autoři KUDEROVÁ, Alena (203 Česká republika, domácí), Lucia GALLOVÁ (203 Česká republika), Katarína KURICOVÁ (703 Slovensko, domácí), Eliška NEJEDLÁ (203 Česká republika, domácí), Anna ČURDOVÁ (703 Slovensko, domácí), Lenka MICENKOVÁ (703 Slovensko, domácí), Ondřej PLÍHAL (203 Česká republika), David ŠMAJS (203 Česká republika, domácí), Lukáš SPÍCHAL (203 Česká republika) a Jan HEJÁTKO (203 Česká republika, garant, domácí).
Vydání Journal of Experimental Botany, Oxford, OXFORD UNIV PRESS, 2015, 0022-0957.
Další údaje
Originální jazyk angličtina
Typ výsledku Článek v odborném periodiku
Obor 10600 1.6 Biological sciences
Stát vydavatele Velká Británie
Utajení není předmětem státního či obchodního tajemství
WWW URL
Impakt faktor Impact factor: 5.677
Kód RIV RIV/00216224:14740/15:00080639
Organizační jednotka Středoevropský technologický institut
Doi http://dx.doi.org/10.1093/jxb/eru422
UT WoS 000351660900028
Klíčová slova anglicky CHASE-containing His kinase; E. coli-based live-cell competitive receptor assay; gene structure; JBnB library; modular protein architecture; phylogenetic analysis
Štítky EL OK, podil, rivok
Příznaky Mezinárodní význam, Recenzováno
Změnil Změnila: Martina Prášilová, učo 342282. Změněno: 19. 8. 2015 10:44.
Anotace
Cytokinin (CK) signalling is known to play key roles in the regulation of plant growth and development, crop yields, and tolerance to both abiotic stress and pathogen defences, but the mechanisms involved are poorly characterized in dicotyledonous crops. Here the identification and functional characterization of sensor histidine kinases homologous to Arabidopsis CK receptors AHK2 and AHK3 in winter oilseed rape are presented. Five CHASE-containing His kinases were identified in Brassica napus var. Tapidor (BnCHK1–BnCHK5) by heterologous hybridization of its genomic library with gene-specific probes from Arabidopsis. The identified bacterial artificial chromosome (BAC) clones were fingerprinted and representative clones in five distinct groups were sequenced. Using a bioinformatic approach and cDNA cloning, the precise gene and putative protein domain structures were determined. Based on phylogenetic analysis, four AHK2 (BnCHK1–BnCHK4) homologues and one AHK3 (BnCHK5) homologue were defined. It is further suggested that BnCHK1 and BnCHK3, and BnCHK5 are orthologues of AHK2 and AHK3, originally from the B. rapa A genome, respectively. BnCHK1, BnCHK3, and BnCHK5 displayed high affinity for trans-zeatin (1–3nM) in a live-cell competitive receptor assay, but not with other plant hormones (indole acetic acid, GA3, and abscisic acid), confirming the prediction that they are genuine CK receptors. It is shown that BnCHK1 and BnCHK3, and BnCHK5 display distinct preferences for various CK bases and metabolites, characteristic of their AHK counterparts, AHK2 and AHK3, respectively. Interestingly, the AHK2 homologues could be divided into two subfamilies (BnCHK1/BnCK2 and BnCHK3/BnCHK4) that differ in putative transmembrane domain topology and CK binding specificity, thus implying potential functional divergence.
Návaznosti
ED1.1.00/02.0068, projekt VaVNázev: CEITEC - central european institute of technology
EE2.3.20.0043, projekt VaVNázev: Rozvoj lidských zdrojů pro výzkum, vývoj a inovace v oblasti genomiky a proteomiky rostlinných systémů
EE2.3.20.0189, projekt VaVNázev: Rozvoj výzkumné excelence v oblasti evoluční cytogenomiky, epigenetiky a buněčné signalizace
GAP305/11/0756, projekt VaVNázev: Strukturní princip specificity přenosu signálu v rostlinách: síť interakcí příjímačové domény histidinkinas u Arabidospis (Akronym: HKRD-AHP)
Investor: Grantová agentura ČR, Strukturní princip specificity přenosu signálu v rostlinách: síť interakcí příjímačové domény histidinkinas u Arabidospis
GA13-25280S, projekt VaVNázev: Elucidating molecular mechanisms of cytokinins-ethylene crosstalk in the plant development
Investor: Grantová agentura ČR, Elucidating molecular mechanisms of cytokinins-ethylene crosstalk in the plant development
GA13-39982S, projekt VaVNázev: Molekulární mechanismy auxín-cytokinínové interakce v regulaci rostlinné organogenese.
Investor: Grantová agentura ČR, Molekulární mechanismy auxín-cytokinínové interakce v regulaci rostlinné organogenese
VytisknoutZobrazeno: 30. 9. 2022 01:19