DVOŘÁK, Miroslav, Petra URBANOVÁ a Milena MATEJOVIČOVÁ. Hodnocení kometové analýzy s počítačovou podporou - opakovatelnost a reprodukovatelnost dat. Chemické listy. Praha: Česká společnost chemická, 2014, roč. 108, č. 12, s. 1149-1152. ISSN 0009-2770.
Další formáty:   BibTeX LaTeX RIS
Základní údaje
Originální název Hodnocení kometové analýzy s počítačovou podporou - opakovatelnost a reprodukovatelnost dat
Název anglicky Evaluation of Computer-Assisted Comet Assay - Repeatability and Reproducibility of Data
Autoři DVOŘÁK, Miroslav (203 Česká republika, domácí), Petra URBANOVÁ (203 Česká republika, domácí) a Milena MATEJOVIČOVÁ (203 Česká republika, garant, domácí).
Vydání Chemické listy, Praha, Česká společnost chemická, 2014, 0009-2770.
Další údaje
Originální jazyk čeština
Typ výsledku Článek v odborném periodiku
Obor 10600 1.6 Biological sciences
Stát vydavatele Česká republika
Utajení není předmětem státního či obchodního tajemství
Impakt faktor Impact factor: 0.272
Kód RIV RIV/00216224:14110/14:00078573
Organizační jednotka Lékařská fakulta
UT WoS 000346508000009
Klíčová slova anglicky DNA-damage; sensitivity; principles
Štítky EL OK, podil
Příznaky Mezinárodní význam, Recenzováno
Změnil Změnila: Ing. Mgr. Věra Pospíšilíková, učo 9005. Změněno: 21. 1. 2015 12:49.
Anotace
Metoda kometové analýzy je založena na migraci poškozené DNA jednotlivých buněk při elektroforéze v agarózovém gelu, její následné vizualizaci (migrující poškozená DNA v gelu vytváří obraz podobný kometě) a hodnocení parametrů poškození DNA. Vizualizaci DNA (komet) lze provádět fluorescenčními barvivy nebo stříbřením. Hodnocení je možné buď počítačovými programy založenými na analýze obrazu, případně členěním do kategorií (např. 0–4) dle míry poškození. V naší práci jsme studovali opakovatelnost a reprodukovatelnost výsledků při použití kombinace alkalickoneutrální kometové analýzy, barvení stříbřením a vyhodnocení s pomocí počítačové podpory.
Anotace anglicky
Evaluation of the alkaline/neutral comet assay combined with Ag staining and computer analysis were performed and afford good repeatability and reproducibility. The present study showed that if an appropriate number of comet results (N=100) is evaluated using LUCIA image analysis, there are no statistically significant differences among operators of various levels of experience. Using public domain software CASP, the results showed a consistent tendency to provide lower average values for the studied variable (% tail DNA) compared with LUCIA software. Yet, this tendency was shown to be statistically insignificant for a majority of comets. If limited to a sub-sample of less damaged comets, the software comparison was statistically significant. This together with the fact that CASP was unable to process heavily damaged comets (>90 % tail DNA) may bring certain limitations to the use of CASP combined with presented protocol. In many respects, the results of analysis using CASP are comparable with the values obtained using the LUCIA software.
VytisknoutZobrazeno: 25. 4. 2024 13:36