MUCHOVÁ, Veronika, S. AMIARD, Iva MOZGOVÁ, Martina DVOŘÁČKOVÁ, M. E. GALLEGO, Ch. WHITE a Jiří FAJKUS. Homology-dependent repair is involved in 45S rDNA loss in plant CAF-1 mutants. Plant Journal. Hoboken (USA): Wiley-Blackwell, 2015, roč. 81, č. 2, s. 198-209. ISSN 0960-7412. doi:10.1111/tpj.12718.
Další formáty:   BibTeX LaTeX RIS
Základní údaje
Originální název Homology-dependent repair is involved in 45S rDNA loss in plant CAF-1 mutants
Autoři MUCHOVÁ, Veronika (203 Česká republika, domácí), S. AMIARD (250 Francie), Iva MOZGOVÁ (203 Česká republika, domácí), Martina DVOŘÁČKOVÁ (203 Česká republika, domácí), M. E. GALLEGO (250 Francie), Ch. WHITE (250 Francie) a Jiří FAJKUS (203 Česká republika, garant, domácí).
Vydání Plant Journal, Hoboken (USA), Wiley-Blackwell, 2015, 0960-7412.
Další údaje
Originální jazyk angličtina
Typ výsledku Článek v odborném periodiku
Obor Genetika a molekulární biologie
Stát vydavatele Spojené státy
Utajení není předmětem státního či obchodního tajemství
WWW URL
Impakt faktor Impact factor: 5.468
Kód RIV RIV/00216224:14740/15:00080676
Organizační jednotka Středoevropský technologický institut
Doi http://dx.doi.org/10.1111/tpj.12718
UT WoS 000347830900002
Klíčová slova anglicky DNA repair; genome instability; 45S rDNA; chromatin assembly factor 1; Arabidopsis thaliana; FAS1; FAS2; RAD51B
Štítky podil, rivok
Příznaky Mezinárodní význam, Recenzováno
Změnil Změnila: Olga Křížová, učo 56639. Změněno: 4. 5. 2016 10:53.
Anotace
Arabidopsis thaliana mutants in FAS1 and FAS2 subunits of chromatin assembly factor 1 (CAF1) show progressive loss of 45S rDNA copies and telomeres. We hypothesized that homology-dependent DNA damage repair (HDR) may contribute to the loss of these repeats in fas mutants. To test this, we generated double mutants by crossing fas mutants with knock-out mutants in RAD51B, one of the Rad51 paralogs of A.thaliana. Our results show that the absence of RAD51B decreases the rate of rDNA loss, confirming the implication of RAD51B-dependent recombination in rDNA loss in the CAF1 mutants. Interestingly, this effect is not observed for telomeric repeat loss, which thus differs from that acting in rDNA loss. Involvement of DNA damage repair in rDNA dynamics in fas mutants is further supported by accumulation of double-stranded breaks (measured as -H2AX foci) in 45S rDNA. Occurrence of the foci is not specific for S-phase, and is ATM-independent. While the foci in fas mutants occur both in the transcribed (intranucleolar) and non-transcribed (nucleoplasmic) fraction of rDNA, double fas rad51b mutants show a specific increase in the number of the intranucleolar foci. These results suggest that the repair of double-stranded breaks present in the transcribed rDNA region is RAD51B dependent and that this contributes to rDNA repeat loss in fas mutants, presumably via the single-stranded annealing recombination pathway. Our results also highlight the importance of proper chromatin assembly in the maintenance of genome stability. Significance Statement In this work we demonstrate that homology-dependent repair is involved in the observed loss of 45S rDNA in plant CAF-1 mutants. The results suggest that the repair of double-strand breaks present in the transcribed rDNA region is RAD51B-dependent and that this contributes to rDNA repeat loss in fas mutants, presumably via the single strand annealing recombination pathway.
Návaznosti
ED1.1.00/02.0068, projekt VaVNázev: CEITEC - central european institute of technology
EE2.3.30.0009, projekt VaVNázev: Zaměstnáním čerstvých absolventů doktorského studia k vědecké excelenci
GAP501/11/0289, projekt VaVNázev: Ztráta specifických repetic DNA v důsledku dysfunkce CAF1 u rostlin
Investor: Grantová agentura ČR, Ztráta specifických repetic DNA v důsledku dysfunkce CAF1 u rostlin
VytisknoutZobrazeno: 16. 5. 2022 14:24