SHAIKH, Tanvir, A.S. YASSIN, Z.H. LU, D. BARNARD, X. MENG, T.M. LU, T. WAGENKNECHT a R. K. AGRAWAL. Initial bridges between two ribosomal subunits are formed within 9.4 milliseconds, as studied by time-resolved cryo-EM. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. WASHINGTON: NATL ACAD SCIENCES, 2014, roč. 111, č. 27, s. 9822-9827. ISSN 0027-8424. doi:10.1073/pnas.1406744111.
Další formáty:   BibTeX LaTeX RIS
Základní údaje
Originální název Initial bridges between two ribosomal subunits are formed within 9.4 milliseconds, as studied by time-resolved cryo-EM
Autoři SHAIKH, Tanvir (840 Spojené státy, garant, domácí), A.S. YASSIN (840 Spojené státy), Z.H. LU (840 Spojené státy), D. BARNARD (840 Spojené státy), X. MENG (840 Spojené státy), T.M. LU (840 Spojené státy), T. WAGENKNECHT (840 Spojené státy) a R. K. AGRAWAL (840 Spojené státy).
Vydání Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, WASHINGTON, NATL ACAD SCIENCES, 2014, 0027-8424.
Další údaje
Originální jazyk angličtina
Typ výsledku Článek v odborném periodiku
Obor 10600 1.6 Biological sciences
Stát vydavatele Spojené státy
Utajení není předmětem státního či obchodního tajemství
WWW URL
Impakt faktor Impact factor: 9.674
Kód RIV RIV/00216224:14740/14:00079214
Organizační jednotka Středoevropský technologický institut
Doi http://dx.doi.org/10.1073/pnas.1406744111
UT WoS 000338514800036
Klíčová slova anglicky ribosomal intersubunit bridges; millisecond time resolution cryo-EM
Štítky kontrola MP, MP, OA, rivok, SCOPUS
Příznaky Mezinárodní význam, Recenzováno
Změnil Změnila: Martina Prášilová, učo 342282. Změněno: 25. 2. 2015 09:03.
Anotace
Association of the two ribosomal subunits during the process of translation initiation is a crucial step of protein synthesis. The two subunits (30S and 50S) of the bacterial 70S ribosome are held together by 12 dynamic bridges involving RNA-RNA, RNA-protein, and protein-protein interactions. The process of bridge formation, such as whether all these bridges are formed simultaneously or in a sequential order, is poorly understood. To understand such processes, we have developed and implemented a class of microfluidic devices that mix two components to completion within 0.4 ms and spray the mixture in the form of microdroplets onto an electron microscopy grid, yielding a minimum reaction time of 9.4 ms before cryofixation. Using these devices, we have obtained cryo-EM data corresponding to reaction times of 9.4 and 43 ms and have determined 3D structures of ribosomal subunit association intermediates. Molecular analyses of the cryo-EM maps reveal that eight intersubunit bridges (bridges B1a, B1b, B2a, B2b, B3, B7a, B7b, and B8) form within 9.4 ms, whereas the remaining four bridges (bridges B2c, B4, B5, and B6) take longer than 43 ms to form, suggesting that bridges are formed in a stepwise fashion. Our approach can be used to characterize sequences of various dynamic functional events on complex macromolecular assemblies such as ribosomes.
Návaznosti
EE2.3.20.0042, projekt VaVNázev: Internacionalizace programu Strukturní biologie s důrazem na rozvoj nových směrů výzkumu
VytisknoutZobrazeno: 27. 6. 2022 05:40