XOCHELLI, Aliki, Andreas AGATHANGELIDIS, Ioannis KAVAKIOTIS, Evangelia MINGA, Lesley Ann SUTTON, Panagiotis BALIAKAS, Ioanna CHOUVARDA, Veronique GIUDICELLI, Ioannis VLAHAVAS, Nikos MAGLAVERAS, Lisa BONELLO, Livio TRENTIN, Alessandra TEDESCHI, Panagiotis PANAGIOTIDIS, Christian GEISLER, Anton W. LANGERAK, Šárka POSPÍŠILOVÁ, Diane F. JELINEK, David OSCIER, Nicholas CHIORAZZI, Nikos DARZENTAS, Fred DAVI, Paolo GHIA, Richard ROSENQUIST, Anastasia HADZIDIMITRIOU, Chrysoula BELESSI, Marie-Paule LEFRANC a Kostas STAMATOPOULOS. Immunoglobulin heavy variable (IGHV) genes and alleles: new entities, new names and implications for research and prognostication in chronic lymphocytic leukaemia. Immunogenetics. New York: Springer, 2015, roč. 67, č. 1, s. 61-66. ISSN 0093-7711. doi:10.1007/s00251-014-0812-3.
Další formáty:   BibTeX LaTeX RIS
Základní údaje
Originální název Immunoglobulin heavy variable (IGHV) genes and alleles: new entities, new names and implications for research and prognostication in chronic lymphocytic leukaemia
Autoři XOCHELLI, Aliki (300 Řecko), Andreas AGATHANGELIDIS (380 Itálie), Ioannis KAVAKIOTIS (300 Řecko), Evangelia MINGA (300 Řecko), Lesley Ann SUTTON (752 Švédsko), Panagiotis BALIAKAS (752 Švédsko), Ioanna CHOUVARDA (300 Řecko), Veronique GIUDICELLI (250 Francie), Ioannis VLAHAVAS (300 Řecko), Nikos MAGLAVERAS (300 Řecko), Lisa BONELLO (380 Itálie), Livio TRENTIN (380 Itálie), Alessandra TEDESCHI (380 Itálie), Panagiotis PANAGIOTIDIS (300 Řecko), Christian GEISLER (208 Dánsko), Anton W. LANGERAK (528 Nizozemsko), Šárka POSPÍŠILOVÁ (203 Česká republika, garant, domácí), Diane F. JELINEK (840 Spojené státy), David OSCIER (826 Velká Británie), Nicholas CHIORAZZI (840 Spojené státy), Nikos DARZENTAS (300 Řecko, domácí), Fred DAVI (250 Francie), Paolo GHIA (380 Itálie), Richard ROSENQUIST (752 Švédsko), Anastasia HADZIDIMITRIOU (300 Řecko), Chrysoula BELESSI (300 Řecko), Marie-Paule LEFRANC (250 Francie) a Kostas STAMATOPOULOS (300 Řecko).
Vydání Immunogenetics, New York, Springer, 2015, 0093-7711.
Další údaje
Originální jazyk angličtina
Typ výsledku Článek v odborném periodiku
Obor 30200 3.2 Clinical medicine
Stát vydavatele Spojené státy
Utajení není předmětem státního či obchodního tajemství
WWW URL
Impakt faktor Impact factor: 2.303
Kód RIV RIV/00216224:14740/15:00082537
Organizační jednotka Středoevropský technologický institut
Doi http://dx.doi.org/10.1007/s00251-014-0812-3
UT WoS 000347161000007
Klíčová slova anglicky CLL; SHM; New IGHV genes; New IGHV gene alleles; Prognostication
Štítky podil, rivok
Příznaky Mezinárodní význam, Recenzováno
Změnil Změnila: Mgr. Eva Špillingová, učo 110713. Změněno: 22. 3. 2016 14:56.
Anotace
Ieext generation sequencing studies in Homo sapiens have identified novel immunoglobulin heavy variable (IGHV) genes and alleles necessitating changes in the international ImMunoGeneTics information system (IMGT) GENE-DB and reference directories of IMGT/V-QUEST. In chronic lymphocytic leukaemia (CLL), the somatic hypermutation (SHM) status of the clonotypic rearranged IGHV gene is strongly associated with patient outcome. Correct determination of this parameter strictly depends on the comparison of the nucleotide sequence of the clonotypic rearranged IGHV gene with that of the closest germline counterpart. Consequently, changes in the reference directories could, in principle, affect the correct interpretation of the IGHV mutational status in CLL. To this end, we analyzed 8066 productive IG heavy chain (IGH) rearrangement sequences from our consortium both before and after the latest update of the IMGT/V-QUEST reference directory. Differences were identified in 405 cases (5 % of the cohort). In 291/405 sequences (71.9 %), changes concerned only the IGHV gene or allele name, whereas a change in the percent germline identity (%GI) was noted in 114/405 (28.1 %) sequences; in 50/114 (43.8 %) sequences, changes in the %GI led to a change in the mutational set. In conclusion, recent changes in the IMGT reference directories affected the interpretation of SHM in a sizeable number of IGH rearrangement sequences from CLL patients. This indicates that both physicians and researchers should consider a re-evaluation of IG sequence data, especially for those IGH rearrangement sequences that, up to date, have a GI close to 98 %, where caution is warranted.
Návaznosti
ED1.1.00/02.0068, projekt VaVNázev: CEITEC - central european institute of technology
NT13493, projekt VaVNázev: Molekulární charakterizace B buněčných receptorů a jejich vztah k evoluci genetických změn u chronické lymfocytární leukémie
VytisknoutZobrazeno: 29. 6. 2022 19:45