BRIM, Luboš, Milan ČEŠKA, Martin DEMKO, Samuel PASTVA a David ŠAFRÁNEK. Parameter Synthesis by Parallel Coloured CTL Model Checking. In Roux, Olivier and Bourdon, Jérémie. Computational Methods in Systems Biology. Neuveden: Springer International Publishing. s. 251-263. ISBN 978-3-319-23400-7. doi:10.1007/978-3-319-23401-4_21. 2015.
Další formáty:   BibTeX LaTeX RIS
Základní údaje
Originální název Parameter Synthesis by Parallel Coloured CTL Model Checking
Autoři BRIM, Luboš (203 Česká republika, domácí), Milan ČEŠKA (203 Česká republika, domácí), Martin DEMKO (703 Slovensko, domácí), Samuel PASTVA (703 Slovensko, domácí) a David ŠAFRÁNEK (203 Česká republika, garant, domácí).
Vydání Neuveden, Computational Methods in Systems Biology, od s. 251-263, 13 s. 2015.
Nakladatel Springer International Publishing
Další údaje
Originální jazyk angličtina
Typ výsledku Stať ve sborníku
Obor 10201 Computer sciences, information science, bioinformatics
Stát vydavatele Česká republika
Utajení není předmětem státního či obchodního tajemství
Forma vydání tištěná verze "print"
Impakt faktor Impact factor: 0.402 v roce 2005
Kód RIV RIV/00216224:14330/15:00081130
Organizační jednotka Fakulta informatiky
ISBN 978-3-319-23400-7
ISSN 0302-9743
Doi http://dx.doi.org/10.1007/978-3-319-23401-4_21
UT WoS 000366198300021
Klíčová slova anglicky model checking; systems biology; Computational Tree Logic; dynamical systems; distributed algorithms
Štítky firank_B
Příznaky Mezinárodní význam, Recenzováno
Změnil Změnil: RNDr. Pavel Šmerk, Ph.D., učo 3880. Změněno: 28. 4. 2016 15:06.
Anotace
We propose a new distributed-memory parallel algorithm for parameter synthesis from CTL hypotheses. The algorithm colours the state space transitions by different parameterisations and extends CTL model checking to identify the maximal set of parameters that guarantee the satisfaction of the given CTL property. We experimentally confirm good scalability of our approach and demonstrate its applicability in the case study of a genetic switch controlling decisions in the cell cycle.
Návaznosti
GA15-11089S, projekt VaVNázev: Získávání parametrů biologických modelů pomocí techniky ověřování modelů
Investor: Grantová agentura ČR, Získávání parametrů biologických modelů pomocí techniky ověřování modelů
MUNI/A/1159/2014, interní kód MUNázev: Rozsáhlé výpočetní systémy: modely, aplikace a verifikace IV.
Investor: Masarykova univerzita, Rozsáhlé výpočetní systémy: modely, aplikace a verifikace IV., DO R. 2020_Kategorie A - Specifický výzkum - Studentské výzkumné projekty
MUNI/A/1206/2014, interní kód MUNázev: Zapojení studentů Fakulty informatiky do mezinárodní vědecké komunity (Akronym: SKOMU)
Investor: Masarykova univerzita, Zapojení studentů Fakulty informatiky do mezinárodní vědecké komunity, DO R. 2020_Kategorie A - Specifický výzkum - Studentské výzkumné projekty
VytisknoutZobrazeno: 20. 4. 2024 03:33