IONESCU, Crina-Maria, David SEHNAL, Francesco Luca FALGINELLA, Purbaj PANT, Lukáš PRAVDA, Tomáš BOUCHAL, Radka SVOBODOVÁ VAŘEKOVÁ, Stanislav GEIDL a Jaroslav KOČA. AtomicChargeCalculator: Interactive Web-based calculation of atomic charges in large biomolecular complexes and drug like molecules. Journal of Cheminformatics. London: BIOMED CENTRAL LTD, 2015, roč. 7, č. 50, s. "nestránkováno", 13 s. ISSN 1758-2946. doi:10.1186/s13321-015-0099-x.
Další formáty:   BibTeX LaTeX RIS
Základní údaje
Originální název AtomicChargeCalculator: Interactive Web-based calculation of atomic charges in large biomolecular complexes and drug like molecules
Autoři IONESCU, Crina-Maria (642 Rumunsko, domácí), David SEHNAL (203 Česká republika, domácí), Francesco Luca FALGINELLA (380 Itálie, domácí), Purbaj PANT (524 Nepál, domácí), Lukáš PRAVDA (203 Česká republika, domácí), Tomáš BOUCHAL (203 Česká republika, domácí), Radka SVOBODOVÁ VAŘEKOVÁ (203 Česká republika, domácí), Stanislav GEIDL (203 Česká republika, domácí) a Jaroslav KOČA (203 Česká republika, garant, domácí).
Vydání Journal of Cheminformatics, London, BIOMED CENTRAL LTD, 2015, 1758-2946.
Další údaje
Originální jazyk angličtina
Typ výsledku Článek v odborném periodiku
Obor 10600 1.6 Biological sciences
Stát vydavatele Velká Británie
Utajení není předmětem státního či obchodního tajemství
WWW URL
Impakt faktor Impact factor: 3.949
Kód RIV RIV/00216224:14310/15:00081192
Organizační jednotka Přírodovědecká fakulta
Doi http://dx.doi.org/10.1186/s13321-015-0099-x
UT WoS 000363291500001
Klíčová slova anglicky Conformationally dependent atomic charges; Biomacromolecules; Drug-like molecules; Paracetamol; Benzoic acids; Protegrin; Proteasome; Allostery; Chemical reactivity
Štítky AKR, rivok
Příznaky Mezinárodní význam, Recenzováno
Změnil Změnila: Olga Křížová, učo 56639. Změněno: 29. 3. 2016 10:59.
Anotace
This paper introduces AtomicChargeCalculator (ACC), a web-based application for the calculation and analysis of atomic charges which respond to changes in molecular conformation and chemical environment. ACC relies on an empirical method to rapidly compute atomic charges with accuracy comparable to quantum mechanical approaches. Due to its efficient implementation, ACC can handle any type of molecular system, regardless of size and chemical complexity, from drug-like molecules to biomacromolecular complexes with hundreds of thousands of atoms. ACC writes out atomic charges into common molecular structure files, and offers interactive facilities for statistical analysis and comparison of the results, in both tabular and graphical form.
Návaznosti
ED1.1.00/02.0068, projekt VaVNázev: CEITEC - central european institute of technology
EE2.3.30.0009, projekt VaVNázev: Zaměstnáním čerstvých absolventů doktorského studia k vědecké excelenci
GA13-25401S, projekt VaVNázev: Studium proteinů z patogenů zapojených do rozpoznávání hostitelského organismu
Investor: Grantová agentura ČR, Studium proteinu z patogenu zapojených do rozpoznávání hostitelského organismu
MUNI/A/1159/2014, interní kód MUNázev: Rozsáhlé výpočetní systémy: modely, aplikace a verifikace IV.
Investor: Masarykova univerzita, Rozsáhlé výpočetní systémy: modely, aplikace a verifikace IV., DO R. 2020_Kategorie A - Specifický výzkum - Studentské výzkumné projekty
VytisknoutZobrazeno: 16. 5. 2022 15:08