TRAN, Trung D., Hieu X. CAO, Gabriele JOVTCHEV, Petr NOVÁK, Giang T. H. VU, Jiří MACAS, Ingo SCHUBERT a Joerg FUCHS. Chromatin organization and cytological features of carnivorous Genlisea species with large genome size differences. Frontiers in Plant Science. Lausanne (Switzerland): Frontiers Media SA, roč. 6, august, s. "nestránkováno", 10 s. ISSN 1664-462X. doi:10.3389/fpls.2015.00613. 2015.
Další formáty:   BibTeX LaTeX RIS
Základní údaje
Originální název Chromatin organization and cytological features of carnivorous Genlisea species with large genome size differences
Autoři TRAN, Trung D. (276 Německo), Hieu X. CAO (276 Německo), Gabriele JOVTCHEV (276 Německo), Petr NOVÁK (203 Česká republika), Giang T. H. VU (276 Německo), Jiří MACAS (203 Česká republika), Ingo SCHUBERT (276 Německo, garant, domácí) a Joerg FUCHS (276 Německo).
Vydání Frontiers in Plant Science, Lausanne (Switzerland), Frontiers Media SA, 2015, 1664-462X.
Další údaje
Originální jazyk angličtina
Typ výsledku Článek v odborném periodiku
Obor 10600 1.6 Biological sciences
Stát vydavatele Švýcarsko
Utajení není předmětem státního či obchodního tajemství
WWW URL
Impakt faktor Impact factor: 4.495
Kód RIV RIV/00216224:14740/15:00081227
Organizační jednotka Středoevropský technologický institut
Doi http://dx.doi.org/10.3389/fpls.2015.00613
UT WoS 000360440200001
Klíčová slova anglicky Genlisea; chromosome number; epigenetic marks; FISH; rDNA; repetitive DNA sequences; single dcopy probes; karyotyping
Štítky OA, rivok
Příznaky Mezinárodní význam, Recenzováno
Změnil Změnila: Mgr. Marie Šípková, DiS., učo 437722. Změněno: 21. 1. 2020 09:06.
Anotace
The monophyletic carnivorous genus Genlisea (Lentibulariaceae) is characterized by a bi-directional genome size evolution resulting in a 25-fold difference in nuclear DNA content. This is one of the largest ranges found within a genus so far and makes Gentlisea an interesting subject to study mechanisms of genome and karyotype evolution. Gentlisea nigrocaulis, with 86 Mbp one of the smallest plant genomes, and the 18-fold larger genome of G. hispidula (1,550 Mbp) possess identical chromosome numbers (2n = 40) but differ considerably in chromatin organization, nuclear and cell size. lnterphase nuclei of G. nigrocaulis and of related species with small genomes, G. aurea (133 Mbp, 2n 104) and G. pygmaea (179 Mbp, 2n = 80), are hallmarked by intensely DAPI -stained chromocenters, carrying typical heterochromatin-associated methylation marks (5-methylcytosine, H3K9me2), while in G. hispidula and surprisingly also in the small genome of G. margaretae (184 Mbp, 2n = 38) the heterochromatin marks are more evenly distributed. Probes of tandem repetitive sequences together with rDNA allow the unequivocal discrimination of 13 out of 20 chromosome pairs of G. hispidula. One of the repetitive sequences labeled half of the chromosome set almost homogenously supporting an allopolyploid status of G. hispidula and its close relative G. subglabra (1,622 Mbp, 2n = 40). In G. nigrocaulis 11 chromosome pairs could be individualized using a combination of rDNA and unique genomic probes. The presented data provide a basis for future studies of karyotype evolution within the genus Genlisea.
Návaznosti
EE2.3.20.0189, projekt VaVNázev: Rozvoj výzkumné excelence v oblasti evoluční cytogenomiky, epigenetiky a buněčné signalizace
GBP501/12/G090, projekt VaVNázev: Evoluce a funkce komplexních genomů rostlin
VytisknoutZobrazeno: 19. 4. 2024 10:37