HEGYI, Hedvig. Enhancer-promoter interaction facilitated by transiently forming G-quadruplexes. Scientific Reports. LONDON: NATURE PUBLISHING GROUP, 2015, roč. 5, march, s. "nestránkováno", 6 s. ISSN 2045-2322. doi:10.1038/srep09165.
Další formáty:   BibTeX LaTeX RIS
Základní údaje
Originální název Enhancer-promoter interaction facilitated by transiently forming G-quadruplexes
Autoři HEGYI, Hedvig (348 Maďarsko, garant, domácí).
Vydání Scientific Reports, LONDON, NATURE PUBLISHING GROUP, 2015, 2045-2322.
Další údaje
Originální jazyk angličtina
Typ výsledku Článek v odborném periodiku
Obor 10600 1.6 Biological sciences
Stát vydavatele Velká Británie
Utajení není předmětem státního či obchodního tajemství
WWW URL
Impakt faktor Impact factor: 5.228
Kód RIV RIV/00216224:14740/15:00085546
Organizační jednotka Středoevropský technologický institut
Doi http://dx.doi.org/10.1038/srep09165
UT WoS 000351181900001
Klíčová slova anglicky REGULATORY MOTIFS; GENOME-WIDE; DNA; LONG; TRANSCRIPTION; SEQUENCES
Štítky OA, rivok
Příznaky Mezinárodní význam, Recenzováno
Změnil Změnila: Martina Prášilová, učo 342282. Změněno: 5. 1. 2016 12:08.
Anotace
G-quadruplexes are guanine-rich nucleic acid sequences capable of forming a four-stranded structure through Hoogsteen hydrogen bonding. G-quadruplexes are highly concentrated near promoters and transcription start sites suggesting a role in gene regulation. They are less often found on the template than non-template strand where they either inhibit or enhance transcription, respectively. However, their potential role in enhancers and other distal regulatory elements has not been assessed yet. Here we show that DNAse hypersensitive (DHS) cis-regulatory elements are also enriched in Gs and their G-content correlate with that of their respective promoters. Besides local G4s, the distal cis regions may form G-quadruplexes together with the promoters, each contributing half a G4. This model is supported more for the non-template strand and we hypothesised that the G4 forming capability of the promoter and the enhancer non-template strand could facilitate their binding together and making the DHS regions accessible for the transcription factory.
Návaznosti
ED1.1.00/02.0068, projekt VaVNázev: CEITEC - central european institute of technology
VytisknoutZobrazeno: 30. 6. 2022 15:58