KADEŘÁVEK, Pavel, Sarina GRUTSCH, Nicola SALVI, Martin TOLLINGER, Lukáš ŽÍDEK, Geoffrey BODENHAUSEN a Fabien FERRAGE. Cross-correlated relaxation measurements under adiabatic sweeps: determination of local order in proteins. Journal of Biomolecular NMR. Dordrecht: Springer, 2015, roč. 63, č. 4, s. 353-365. ISSN 0925-2738. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1007/s10858-015-9994-8.
Další formáty:   BibTeX LaTeX RIS
Základní údaje
Originální název Cross-correlated relaxation measurements under adiabatic sweeps: determination of local order in proteins
Autoři KADEŘÁVEK, Pavel (203 Česká republika, domácí), Sarina GRUTSCH (40 Rakousko), Nicola SALVI (756 Švýcarsko), Martin TOLLINGER (40 Rakousko), Lukáš ŽÍDEK (203 Česká republika, garant, domácí), Geoffrey BODENHAUSEN (250 Francie) a Fabien FERRAGE (250 Francie).
Vydání Journal of Biomolecular NMR, Dordrecht, Springer, 2015, 0925-2738.
Další údaje
Originální jazyk angličtina
Typ výsledku Článek v odborném periodiku
Obor 10608 Biochemistry and molecular biology
Stát vydavatele Nizozemské království
Utajení není předmětem státního či obchodního tajemství
WWW Full Text
Impakt faktor Impact factor: 3.439
Kód RIV RIV/00216224:14740/15:00086418
Organizační jednotka Středoevropský technologický institut
Doi http://dx.doi.org/10.1007/s10858-015-9994-8
UT WoS 000365789500004
Klíčová slova anglicky NMR; Protein dynamics; Adiabatic sweep; Cross-correlated cross relaxation
Štítky OA, rivok
Příznaky Mezinárodní význam, Recenzováno
Změnil Změnila: Mgr. Marie Šípková, DiS., učo 437722. Změněno: 16. 12. 2019 14:22.
Anotace
Adiabatically swept pulses were originally designed for the purpose of broadband spin inversion. Later, unexpected advantages of their utilization were also found in other applications, such as refocusing to excite spin echoes, studies of chemical exchange or fragment-based drug design. Here, we present new experiments to characterize fast (ps-ns) protein dynamics, which benefit from little-known properties of adiabatic pulses. We developed a strategy for measuring cross-correlated cross-relaxation (CCCR) rates during adiabatic pulses. This experiment provides a linear combination of longitudinal and transverse CCCR rates, which is offset-independent across a typical amide spectrum. The pulse sequence can be recast to provide accurate transverse CCCR rates weighted by the populations of exchanging states. Sensitivity can be improved in systems in slow exchange. Finally, the experiments can be easily modified to yield residue-specific correlation times. The average correlation time of motions can be determined with a single experiment while at least two different experiments had to be recorded until now.
Návaznosti
12.251-Sciex-N-7, interní kód MUNázev: Motions in Disordered Proteins (Akronym: MoDiPro)
Investor: Ostatní - zahraniční, Motions in Disordered Proteins
286154, interní kód MUNázev: SYLICA - Synergies of Life and Material Sciences to Create a New Future (Akronym: SYLICA)
Investor: Evropská unie, SYLICA - Synergies of Life and Material Sciences to Create a New Future, Kapacity
VytisknoutZobrazeno: 25. 4. 2024 03:12