CaverWeb 0,2

ŠTOURAČ, Jan, Jan BREZOVSKÝ and Jiří DAMBORSKÝ. CaverWeb 0,2. 2015.

Basic information

• Original name: CaverWeb 0,2
• Authors: ŠTOURAČ, Jan (203 Czech Republic, belonging to the institution), Jan BREZOVSKÝ (203 Czech Republic, belonging to the institution) and Jiří DAMBORSKÝ (203 Czech Republic, guarantor, belonging to the institution).
• Edition: 2015.

Other information

• Original language: English
• Type of outcome: Software
• Field of Study: 10201 Computer sciences, information science, bioinformatics
• Country of publisher: Czech Republic
• Confidentiality degree: is not subject to a state or trade secret
• WWW: URL
• RIV identification code: RIV/00216224:14310/15:00080425
• Organization unit: Faculty of Science
• Keywords in English: CaverWeb 0;2; tunnels; proteins
• Technical parameters: Web tool for analysis of tunnels and channels in proteins.
• Tags: AKR, rivok

Abstract

Web tool for analysis of tunnels and channels in proteins-http://loschmidt.chemi.muni.cz/caverweb.

Abstract (in Czech)

Portál CAVER Web poskytuje přímočarý způsob, jak lze z pouhé znalosti struktury tyto důležité tunely nalézt a analyzovat jejich vlastnosti. Tento portál slouží jako interaktivní grafické uživatelské rozhraní pro nástroj CAVER 3.0 a snaží se ho přiblížit i méně zkušeným uživatelům, kterým díky integraci vhodných podpůrných nástrojů a dalších metod značně usnadňuje správné nastavení celého výpočtu a tak i získání biologicky relevantních výsledků. Pro účel vývoje samotného portálu byla předem navržena a implementována obecná bioinformatická platforma, jejímž cílem je poskytnout spolehlivou implementaci bazálních komponent a bioinformatických nástrojů pro další projekty vyvíjené v rámci Loschmidtových Laboratoří. Tato platforma je kromě výše zmíněného portálu využita také ve třech dalších projektech. Vyvinutý portál CAVER Web je volně dostupný všem uživatelům na webové adrese http://loschmidt.chemi.muni.cz/caverweb.

Links

• TA04021380, research and development project: Name: Biosenzor pro monitorování toxických látek v životním prostředí

Investor: Technology Agency of the Czech Republic