R 2015

CaverWeb 0,2

ŠTOURAČ, Jan, Jan BREZOVSKÝ and Jiří DAMBORSKÝ

Basic information

Original name

CaverWeb 0,2

Authors

ŠTOURAČ, Jan (203 Czech Republic, belonging to the institution), Jan BREZOVSKÝ (203 Czech Republic, belonging to the institution) and Jiří DAMBORSKÝ (203 Czech Republic, guarantor, belonging to the institution)

Edition

2015

Other information

Language

English

Type of outcome

Software

Field of Study

10201 Computer sciences, information science, bioinformatics

Country of publisher

Czech Republic

Confidentiality degree

není předmětem státního či obchodního tajemství

References:

RIV identification code

RIV/00216224:14310/15:00080425

Organization unit

Faculty of Science

Keywords in English

CaverWeb 0;2; tunnels; proteins

Technical parameters

Web tool for analysis of tunnels and channels in proteins.

Tags

Změněno: 8/4/2016 14:51, Ing. Andrea Mikešková

Abstract

V originále

Web tool for analysis of tunnels and channels in proteins-http://loschmidt.chemi.muni.cz/caverweb.

In Czech

Portál CAVER Web poskytuje přímočarý způsob, jak lze z pouhé znalosti struktury tyto důležité tunely nalézt a analyzovat jejich vlastnosti. Tento portál slouží jako interaktivní grafické uživatelské rozhraní pro nástroj CAVER 3.0 a snaží se ho přiblížit i méně zkušeným uživatelům, kterým díky integraci vhodných podpůrných nástrojů a dalších metod značně usnadňuje správné nastavení celého výpočtu a tak i získání biologicky relevantních výsledků. Pro účel vývoje samotného portálu byla předem navržena a implementována obecná bioinformatická platforma, jejímž cílem je poskytnout spolehlivou implementaci bazálních komponent a bioinformatických nástrojů pro další projekty vyvíjené v rámci Loschmidtových Laboratoří. Tato platforma je kromě výše zmíněného portálu využita také ve třech dalších projektech. Vyvinutý portál CAVER Web je volně dostupný všem uživatelům na webové adrese http://loschmidt.chemi.muni.cz/caverweb.

Links

TA04021380, research and development project
Name: Biosenzor pro monitorování toxických látek v životním prostředí
Investor: Technology Agency of the Czech Republic