ZÁPRAŽNÁ, Kristína, Jitka MALČÍKOVÁ, Nikola TOM, Lenka RADOVÁ, Kamila RÉBLOVÁ, M. ATCHISON and Šárka POSPÍŠILOVÁ. Studium funkčních vlastností sestřihových variant aktivací indukované deaminázy exprimovaných u B buněčných malignit (Studying the function splicing variants of activation-induced deaminase in B cell malignancies). Klinická onkologie. Praha: Česká Lékařská Společnost J.E. Purkyně, 2016, vol. 29, Supplementum 2, p. 142-143. ISSN 0862-495X.
Other formats:   BibTeX LaTeX RIS
Basic information
Original name Studium funkčních vlastností sestřihových variant aktivací indukované deaminázy exprimovaných u B buněčných malignit
Name in Czech Studium funkčních vlastností sestřihových variant aktivací indukované deaminázy exprimovaných u B buněčných malignit
Name (in English) Studying the function splicing variants of activation-induced deaminase in B cell malignancies
Authors ZÁPRAŽNÁ, Kristína (203 Czech Republic, guarantor, belonging to the institution), Jitka MALČÍKOVÁ (203 Czech Republic, belonging to the institution), Nikola TOM (203 Czech Republic, belonging to the institution), Lenka RADOVÁ (203 Czech Republic, belonging to the institution), Kamila RÉBLOVÁ (203 Czech Republic, belonging to the institution), M. ATCHISON (840 United States of America) and Šárka POSPÍŠILOVÁ (203 Czech Republic, belonging to the institution).
Edition Klinická onkologie, Praha, Česká Lékařská Společnost J.E. Purkyně, 2016, 0862-495X.
Other information
Original language Czech
Type of outcome Article in a journal
Field of Study 30200 3.2 Clinical medicine
Country of publisher Czech Republic
Confidentiality degree is not subject to a state or trade secret
WWW URL
RIV identification code RIV/00216224:14740/16:00091804
Organization unit Central European Institute of Technology
Keywords in English activation; induced deaminase; somatic hypermutation; immunoglobulin; alternative splicing; CLL
Tags rivok
Changed by Changed by: Mgr. Eva Špillingová, učo 110713. Changed: 28/3/2017 10:55.
Abstract
Úvod: Aktivací indukovaná deamináza (AID) hraje významnou roli při zvyšování efektivity protilátek ve zralých B lymfocytech během imunitní odpovědi. AID vnáší somatické hypermutace (SHM) primárně do imunoglobulinových (Ig) genů a hraje roli také v přesmyku Ig tříd (CSR). Tento enzym má obrovský mutační potenciál – frekvence SHM v Ig je až milionkrát vyšší než frekvence spontánní mutageneze. Studium AID v myších modelech prokázalo souvislost mezi aktivitou AID a množstvím změn v celém genomu (mutace, zlomy, translokace). AID je aberantně exprimovaná u B buněčných malignit i u řady solidních nádorů. U chronické lymfocytární leukemie (CLL), Ph akutní lymfoblastické leukemie a lymfomu z plášťových buněk podléhá AID alternativnímu sestřihu. Ve srovnání se zdravými B lymfocyty se zde navíc vyskytují čtyři alternativně sestřižené transkripty AID, které se liší od standardní varianty AID v C terminální doméně. Cíl: Tento projekt má za úkol objasnit, zda delece a inzerce v C terminální doméně AID mění její funkční vlastnosti. Materiál a metody: Alternativně sestřižené transkripty AID detekované ve vzorku periferní krve CLL pacienta byly naklonovány do retrovirového vektoru. Zralé B lymfocyty purifikované ze slezin AID myší byly stimulovány cytokiny a poté infikovány retroviry exprimující jednotlivé sestřihové varianty AID. Po čtyřdenní kultivaci jsme s pomocí průtokové cytometrie hodnotili CSR. Genomická DNA byla podrobena analýze zlomů a mutací v oblasti přesmyku Ig Sm. Zlomy byly detekovány pomocí ligační PCR a hybridizace s radioaktivně značenou sondou. Mutační analýzu jsme provedli pomocí ultra-hlubokého sekvenování nové generace. Výsledky: Zatímco standardní varianta AID indukovala somatické hypermutace, zlomy i přesmyk Ig izotypů, alternativně sestřižené varianty AID se ve všech použitých funkčních testech jevily jako katalyticky neaktivní. CSR, indukce mutací i dvouřetězcových zlomů v Ig Sm byly v buňkách exprimujících alternativně sestřižené AID transkripty pod hranicí detekce použitých esejí. Závěr: Výsledky analýzy aktivity sestřihových variant AID v myších stimulovaných B buňkách (AID) poukazují na ztrátu funkce. Role sestřihových variant AID exprimovaných u CLL zůstává nejasná a jejich funkce je třeba dále analyzovat za použití lidských linií odvozených z B buněčných malignit a klinických vzorků. Výzkum je financován z programu SoMoPro II, který je podpořen EU (REA č. 291782). Výzkum je dále spolufinancován JMK. Tento materiál odráží pouze postoje autora a EU není odpovědná za jakékoli možné použití informací obsažených v takovém materiálu.
Abstract (in English)
Studying the function splicing variants of activation-induced deaminase in B cell malignancies, Studying the function splicing variants of activation-induced deaminase in B cell malignancies, Studying the function splicing variants of activation-induced deaminase in B cell malignancies
Links
3SGA5792, interní kód MUName: Expression and function of activation-induced cytidine deaminase splice variants in normal B cell physiology and chronic lymphocytic leukemia (Acronym: AIDinCLL)
Investor: South-Moravian Region, Incoming grants
PrintDisplayed: 15/7/2024 22:19