MA, Jun, Jun-Jun HE, Guo-Hua LIU, Roman LEONTOVYČ, Martin KAŠNÝ a Xing-Quan ZHU. Complete mitochondrial genome of the giant liver fluke Fascioloides magna (Digenea: Fasciolidae) and its comparison with selected trematodes. PARASITES & VECTORS. BioMed Central, roč. 9, August, s. "nestrankovano", 7 s. ISSN 1756-3305. doi:10.1186/s13071-016-1699-7. 2016.
Další formáty:   BibTeX LaTeX RIS
Základní údaje
Originální název Complete mitochondrial genome of the giant liver fluke Fascioloides magna (Digenea: Fasciolidae) and its comparison with selected trematodes
Autoři MA, Jun (156 Čína), Jun-Jun HE (156 Čína), Guo-Hua LIU (156 Čína), Roman LEONTOVYČ (203 Česká republika), Martin KAŠNÝ (203 Česká republika, garant, domácí) a Xing-Quan ZHU (156 Čína).
Vydání PARASITES & VECTORS, BioMed Central, 2016, 1756-3305.
Další údaje
Originální jazyk angličtina
Typ výsledku Článek v odborném periodiku
Obor 30309 Tropical medicine
Stát vydavatele Velká Británie a Severní Irsko
Utajení není předmětem státního či obchodního tajemství
Impakt faktor Impact factor: 3.035
Kód RIV RIV/00216224:14310/16:00093533
Organizační jednotka Přírodovědecká fakulta
Doi http://dx.doi.org/10.1186/s13071-016-1699-7
UT WoS 000381193700001
Klíčová slova anglicky Fascioloides magna; Fasciola; Mitochondrial genome; Phylogenetic analysis
Štítky AKR, rivok
Změnil Změnila: Mgr. Lucie Jarošová, DiS., učo 205746. Změněno: 6. 3. 2018 14:36.
Anotace
Background: Representatives of the trematode family Fasciolidae are responsible for major socio-economic losses worldwide. Fascioloides magna is an important pathogenic liver fluke of wild and domestic ungulates. To date, only a limited number of studies concerning the molecular biology of F. magna exist. Therefore, the objective of the present study was to determine the complete mitochondrial (mt) genome sequence of F. magna, and assess the phylogenetic relationships of this fluke with other trematodes based on the mtDNA dataset. Findings: The complete F. magna mt genome sequence is 14,047 bp. The gene content and arrangement of the F. magna mt genome is similar to those of Fasciola spp., except that trnE is located between trnG and the only non-coding region in F. magna mt genome. Phylogenetic relationships of F. magna with selected trematodes using Bayesian inference (BI) was reconstructed based on the concatenated amino acid sequences for 12 protein-coding genes, which confirmed that the genus Fascioloides is closely related to the genus Fasciola; the intergeneric differences of amino acid composition between the genera Fascioloides and Fasciola ranged 17.97-18.24 %. Conclusions: The determination of F. magna mt genome sequence provides a valuable resource for further investigations of the phylogeny of the family Fasciolidae and other trematodes, and represents a useful platform for designing appropriate molecular markers.
Návaznosti
MUNI/A/1325/2015, interní kód MUNázev: Analýzy diverzity biologických systémů různých úrovní a na různých škálách prostředí (Akronym: BIDA5)
Investor: Masarykova univerzita, Analýzy diverzity biologických systémů různých úrovní a na různých škálách prostředí, DO R. 2020_Kategorie A - Specifický výzkum - Studentské výzkumné projekty
VytisknoutZobrazeno: 19. 4. 2024 03:47