Detailed Information on Publication Record
2016
Vývoj genově specifických DNA markerů pro skríning rostlin ve šlechtění jetele lučního
ŘEPKOVÁ, Jana, Jana DLUHOŠOVÁ, Jan NEDĚLNÍK and Hana JAKEŠOVÁBasic information
Original name
Vývoj genově specifických DNA markerů pro skríning rostlin ve šlechtění jetele lučního
Name in Czech
Vývoj genově specifických DNA markerů pro skríning rostlin ve šlechtění jetele lučního
Name (in English)
Development of gene specific DNA markers for plant screening in red clover breeding
Authors
ŘEPKOVÁ, Jana (203 Czech Republic, guarantor, belonging to the institution), Jana DLUHOŠOVÁ (203 Czech Republic, belonging to the institution), Jan NEDĚLNÍK (203 Czech Republic) and Hana JAKEŠOVÁ (203 Czech Republic)
Edition
Úroda, Praha, Státní zemědělské nakladatelství, 2016, 0139-6013
Other information
Language
Czech
Type of outcome
Článek v odborném periodiku
Field of Study
Genetics and molecular biology
Country of publisher
Czech Republic
Confidentiality degree
není předmětem státního či obchodního tajemství
RIV identification code
RIV/00216224:14310/16:00087684
Organization unit
Faculty of Science
Keywords (in Czech)
Trifolium pratense; SSR; genetická diverzita
Keywords in English
Trifolium pratense; SSR; genetic diversity
Tags
Reviewed
Změněno: 27/2/2017 09:22, prof. RNDr. Jana Řepková, CSc.
V originále
Jetel luční (Trifolium pratense) je celosvětově důležitá pícnina. Cílem práce byla identifikace SSR (simple sequence repeat) markerů v kódujících sekvencích pro celý genom. Charakterizovali jsme 4005 potenciálních markerů s produkty amplifikace 100 až 350 bp. Hustota markerů byla jeden SSR na 12,39 kbp. Celkem 95 SSR v kódujících sekvencích bylo validováno pro 50 českých i zahraničních odrůd jetele lučního a byla získána kolekce 22 vysoce polymorfních markerů s PIC (polymorphism information content) > 0.9. Tyto makery jsou vhodné pro studium diverzity u T. pratense a pro celogenomové studie vyhledávání markerů ve specifických genech využitelných ve šlechtění jetele lučního. Informace o příbuzenských vztazích u šlechtitelského materiálu jsou využitelné pro plánování křížení, ale i ochranu práv šlechtitelů prostřednictvím identifikace odrůd.
In English
Red clover (Trifolium pratense) is an important forage plant worldwide. We characterized 4,005 potential simple sequence repeat (SSR) markers generating polymerase chain reaction products preferentially within 100 to 350 bp. Marker density of 1 SSR marker per 12.39 kbp was achieved. Altogether, 95 SSRs in coding sequences were analysed for 50 red clover varieties and a collection of 22 highly polymorphic SSRs with PIC (polymorphism information content) > 0.9 was generated, thus obtaining primer pairs for application to diversity studies in T. pratense. Predicted large sets of SSRs throughout the genome are key to rapidly implementing genome-based breeding approaches. Detailed knowledge of genetic relationships among breeding materials can also be useful for breeders in planning crosses or for plant variety protection.
Links
| QI111A019, research and development project |
|