PABST, Martin, Iva BENEŠOVÁ, Stephan R FAGERER, Mathias JACOBSEN, Klaus EYER, Gregor SCHMIDT, Robert STEINHOFF, Jasmin KRISMER, Fabian WAHL, Jan PREISLER a Renato ZENOBI. Differential Isotope Labeling of Glycopeptides for Accurate Determination of Differences in Site-Specific Glycosylation. Journal of Proteome Research. Washington: American Chemical Society, roč. 15, č. 1, s. 326-331. ISSN 1535-3893. doi:10.1021/acs.jproteome.5b00899. 2016.
Další formáty:   BibTeX LaTeX RIS
Základní údaje
Originální název Differential Isotope Labeling of Glycopeptides for Accurate Determination of Differences in Site-Specific Glycosylation
Autoři PABST, Martin (40 Rakousko), Iva BENEŠOVÁ (203 Česká republika, domácí), Stephan R FAGERER (276 Německo), Mathias JACOBSEN (756 Švýcarsko), Klaus EYER (756 Švýcarsko), Gregor SCHMIDT (756 Švýcarsko), Robert STEINHOFF (276 Německo), Jasmin KRISMER (756 Švýcarsko), Fabian WAHL (756 Švýcarsko), Jan PREISLER (203 Česká republika, garant, domácí) a Renato ZENOBI (756 Švýcarsko).
Vydání Journal of Proteome Research, Washington, American Chemical Society, 2016, 1535-3893.
Další údaje
Originální jazyk angličtina
Typ výsledku Článek v odborném periodiku
Obor 10406 Analytical chemistry
Stát vydavatele Spojené státy
Utajení není předmětem státního či obchodního tajemství
Impakt faktor Impact factor: 4.268
Kód RIV RIV/00216224:14310/16:00093930
Organizační jednotka Přírodovědecká fakulta
Doi http://dx.doi.org/10.1021/acs.jproteome.5b00899
UT WoS 000367706000026
Klíčová slova anglicky glycopeptides; stable isotope labeling; IgG; MALDI MS; LC-ESI-MS
Štítky AKR, rivok
Příznaky Mezinárodní význam, Recenzováno
Změnil Změnil: prof. Mgr. Jan Preisler, Ph.D., učo 45329. Změněno: 15. 2. 2018 22:03.
Anotace
We introduce a stable isotope labeling approach for glycopeptides that allows a specific glycosylation site in a protein to be quantitatively evaluated using mass spectrometry. Succinic anhydride is used to specifically label primary amino groups of the peptide portion of the glycopeptides. The heavy form ((D4C4)-C-13) provides an 8 Da mass increment over the light natural form ((H4C4)-C-12), allowing simultaneous analysis and direct comparison of two glycopeptide profiles in a single MS scan. We have optimized a protocol for an in-solution trypsin digestion, a one-pot labeling procedure, and a post-labeling solid-phase extraction to obtain purified and labeled glycopeptides. We provide the first demonstration of this approach by comparing IgGI Pc glycopeptides from polyclonal IgG samples with respect to their galactosylation and sialylation patterns using MALDI MS and LC-ESI-MS.
Návaznosti
ED1.1.00/02.0068, projekt VaVNázev: CEITEC - central european institute of technology
EE2.3.30.0009, projekt VaVNázev: Zaměstnáním čerstvých absolventů doktorského studia k vědecké excelenci
VytisknoutZobrazeno: 18. 4. 2024 09:10