BOTKA, Tibor, Vladislava RŮŽIČKOVÁ, Karla SVOBODOVÁ, Roman PANTŮČEK, Petr PETRÁŠ, Darina ČEJKOVÁ a Jiří DOŠKAŘ. Komparativní analýza dvou odlišných linií plazmidů kódujících exfoliativní toxin B u klinických kmenů Staphylococcus aureus. In Lukáš Vacek. XXVI. konference mladých mikrobiologů TOMÁŠKOVY DNY 2017. 1. vyd. Brno: Masarykova Univerzita. s. 50. ISBN 978-80-210-8585-5. 2017.
Další formáty:   BibTeX LaTeX RIS
Základní údaje
Originální název Komparativní analýza dvou odlišných linií plazmidů kódujících exfoliativní toxin B u klinických kmenů Staphylococcus aureus
Název česky Komparativní analýza dvou odlišných linií plazmidů kódujících exfoliativní toxin B u klinických kmenů Staphylococcus aureus
Název anglicky Comparative analysis of two distinct lineages of exfoliative toxin B encoding plasmids of Staphylococcus aureus clinical strains
Autoři BOTKA, Tibor, Vladislava RŮŽIČKOVÁ, Karla SVOBODOVÁ, Roman PANTŮČEK, Petr PETRÁŠ, Darina ČEJKOVÁ a Jiří DOŠKAŘ.
Vydání 1. vyd. Brno, XXVI. konference mladých mikrobiologů TOMÁŠKOVY DNY 2017, s. 50-50, 2017.
Nakladatel Masarykova Univerzita
Další údaje
Originální jazyk čeština
Typ výsledku Stať ve sborníku
Obor Genetika a molekulární biologie
Stát vydavatele Česká republika
Utajení není předmětem státního či obchodního tajemství
Forma vydání tištěná verze "print"
WWW XXVI. Tomáškovy dny mladých mikrobiologů
Organizační jednotka Přírodovědecká fakulta
ISBN 978-80-210-8585-5
Klíčová slova česky ETB plazmid, exfoliativní toxin B, fylogeneze, genomová analýza
Klíčová slova anglicky ETB plasmid, exfoliative toxin B, phylogeny, genome analysis
Štítky NZ
Změnil Změnila: Ing. Nicole Zrilić, učo 240776. Změněno: 19. 4. 2018 14:45.
Anotace
Schopnost některých kmenů S. aureus produkovat exfoliativní toxiny je podmíněna obsahem specifických mobilních genetických elementů. Z hlediska medicínské praxe jsou nejvýznamnější exfoliativní toxiny A a B, které jsou kódovány geny lokalizovanými na profágu, respektive plazmidu. V této práci byly charakterizovány plazmidy kódující exfoliativní toxin B (ETB plazmidy), které byly izolovány z klinických kmenů zodpovědných za hromadná epidermolytická onemocnění v českých porodnicích. Byla provedena genotypizace a restrikční analýza plazmidů i jejich hostitelských kmenů. Na základě sekvenční analýzy byla navržena multiplex PCR pro detekci všech sekvenčních typů ETB plazmidů. Sekvenování, multiplex PCR a komparativní analýza ukázaly, že většina ETB plazmidů sdílí společnou „core“ sekvenci, typickou přítomností genů pro bakteriociny, inhibitor epidermální diferenciace typu C či rezistenci ke kadmiu. Tvoří tak ucelenou linii (I), jejíž zástupce lze rozdělit do čtyř sekvenčních typů podle přítomnosti specifických genomových úseků. Ty jsou tvořeny replikačními geny či transpozony kódujícími rezistenci k antibiotikům. Všechny plazmidy této linie byly detekovány v kmenech klonálního komplexu CC121, které často obsahovaly i profága s genem pro exfoliativní toxin A. Z bezprofágového kmene sekvenčního typu ST130 byl izolován dosud nepopsaný typ ETB plazmidu, obsahující geny pro konjugaci a také nové varianty genů pro exfoliativní toxin B a další faktory virulence. Geny lokalizované v „core“ sekvenci linie I se u něj nevyskytují. Přestože se dosud předpokládalo, že ETB plazmidy jsou relativně uniformní, byl v této práci izolován a detailně popsán nový, sekvenčně zcela odlišný typ. Svými vlastnostmi tak reprezentuje novou dosud nepopsanou linii (II) ETB plazmidů, mající však velký vliv na patogenitu toxinogenních kmenů S. aureus.
Návaznosti
QJ1510216, projekt VaVNázev: Fágová terapie infekcí vyvolaných Staphylococcus aureus v chovech hospodářských zvířat (Akronym: StafyFag)
Investor: Ministerstvo zemědělství ČR, Fágová terapie infekcí vyvolaných Staphylococcus aureus v chovech hospodářských zvířat
VytisknoutZobrazeno: 20. 4. 2024 02:41