Komparativní analýza dvou odlišných linií plazmidů kódujících
exfoliativní toxin B u klinických kmenů Staphylococcus aureus

D 2017

Komparativní analýza dvou odlišných linií plazmidů kódujících exfoliativní toxin B u klinických kmenů Staphylococcus aureus

BOTKA, Tibor, Vladislava RŮŽIČKOVÁ, Karla SVOBODOVÁ, Roman PANTŮČEK, Petr PETRÁŠ et. al.

Basic information

Original name

Komparativní analýza dvou odlišných linií plazmidů kódujících exfoliativní toxin B u klinických kmenů Staphylococcus aureus

Name in Czech

Komparativní analýza dvou odlišných linií plazmidů kódujících exfoliativní toxin B u klinických kmenů Staphylococcus aureus

Name (in English)

Comparative analysis of two distinct lineages of exfoliative toxin B encoding plasmids of Staphylococcus aureus clinical strains

Authors

BOTKA, Tibor, Vladislava RŮŽIČKOVÁ, Karla SVOBODOVÁ, Roman PANTŮČEK, Petr PETRÁŠ, Darina ČEJKOVÁ and Jiří DOŠKAŘ

Edition

1. vyd. Brno, XXVI. konference mladých mikrobiologů TOMÁŠKOVY DNY 2017, p. 50-50, 2017

Publisher

Masarykova Univerzita

Other information

Language

Czech

Type of outcome

Stať ve sborníku

Field of Study

Genetics and molecular biology

Country of publisher

Czech Republic

Confidentiality degree

není předmětem státního či obchodního tajemství

Publication form

printed version "print"

References:

XXVI. Tomáškovy dny mladých mikrobiologů

Organization unit

Faculty of Science

ISBN

978-80-210-8585-5

Keywords (in Czech)

ETB plazmid, exfoliativní toxin B, fylogeneze, genomová analýza

Keywords in English

ETB plasmid, exfoliative toxin B, phylogeny, genome analysis

Abstract

V originále

Schopnost některých kmenů S. aureus produkovat exfoliativní toxiny je podmíněna obsahem specifických mobilních genetických elementů. Z hlediska medicínské praxe jsou nejvýznamnější exfoliativní toxiny A a B, které jsou kódovány geny lokalizovanými na profágu, respektive plazmidu. V této práci byly charakterizovány plazmidy kódující exfoliativní toxin B (ETB plazmidy), které byly izolovány z klinických kmenů zodpovědných za hromadná epidermolytická onemocnění v českých porodnicích. Byla provedena genotypizace a restrikční analýza plazmidů i jejich hostitelských kmenů. Na základě sekvenční analýzy byla navržena multiplex PCR pro detekci všech sekvenčních typů ETB plazmidů. Sekvenování, multiplex PCR a komparativní analýza ukázaly, že většina ETB plazmidů sdílí společnou „core“ sekvenci, typickou přítomností genů pro bakteriociny, inhibitor epidermální diferenciace typu C či rezistenci ke kadmiu. Tvoří tak ucelenou linii (I), jejíž zástupce lze rozdělit do čtyř sekvenčních typů podle přítomnosti specifických genomových úseků. Ty jsou tvořeny replikačními geny či transpozony kódujícími rezistenci k antibiotikům. Všechny plazmidy této linie byly detekovány v kmenech klonálního komplexu CC121, které často obsahovaly i profága s genem pro exfoliativní toxin A. Z bezprofágového kmene sekvenčního typu ST130 byl izolován dosud nepopsaný typ ETB plazmidu, obsahující geny pro konjugaci a také nové varianty genů pro exfoliativní toxin B a další faktory virulence. Geny lokalizované v „core“ sekvenci linie I se u něj nevyskytují. Přestože se dosud předpokládalo, že ETB plazmidy jsou relativně uniformní, byl v této práci izolován a detailně popsán nový, sekvenčně zcela odlišný typ. Svými vlastnostmi tak reprezentuje novou dosud nepopsanou linii (II) ETB plazmidů, mající však velký vliv na patogenitu toxinogenních kmenů S. aureus.

Links

QJ1510216, research and development project

Name: Fágová terapie infekcí vyvolaných Staphylococcus aureus v chovech hospodářských zvířat (Acronym: StafyFag)

Investor: Ministry of Agriculture of the CR

Citovat

BOTKA, Tibor, Vladislava RŮŽIČKOVÁ, Karla SVOBODOVÁ, Roman PANTŮČEK, Petr PETRÁŠ, Darina ČEJKOVÁ and Jiří DOŠKAŘ. Komparativní analýza dvou odlišných linií plazmidů kódujících exfoliativní toxin B u klinických kmenů Staphylococcus aureus (Comparative analysis of two distinct lineages of exfoliative toxin B encoding plasmids of Staphylococcus aureus clinical strains). In Lukáš Vacek. XXVI. konference mladých mikrobiologů TOMÁŠKOVY DNY 2017. 1st ed. Brno: Masarykova Univerzita, 2017, p. 50. ISBN 978-80-210-8585-5.

@inproceedings{1382679,
   author = {Botka, Tibor and Růžičková, Vladislava and Svobodová, Karla and Pantůček, Roman and Petráš, Petr and Čejková, Darina and Doškař, Jiří},
   address = {Brno},
   booktitle = {XXVI. konference mladých mikrobiologů TOMÁŠKOVY DNY 2017},
   edition = {1.},
   editor = {Lukáš Vacek},
   keywords = {ETB plasmid, exfoliative toxin B, phylogeny, genome analysis},
   howpublished = {tištěná verze "print"},
   language = {cze},
   location = {Brno},
   isbn = {978-80-210-8585-5},
   note = {Nepřenášíme do RIV, výsledek má jen 1 stranu, podle metodiky M17+ musí mít stať ve sborníku min. 2 strany.},
   pages = {50-50},
   publisher = {Masarykova Univerzita},
   title = {Komparativní analýza dvou odlišných linií plazmidů kódujících exfoliativní toxin B u klinických kmenů Staphylococcus aureus},
   url = {http://www.med.muni.cz/tomdny/},
   year = {2017}
}

TY  - JOUR
ID  - 1382679
AU  - Botka, Tibor - Růžičková, Vladislava - Svobodová, Karla - Pantůček, Roman - Petráš, Petr - Čejková, Darina - Doškař, Jiří
PY  - 2017
TI  - Komparativní analýza dvou odlišných linií plazmidů kódujících exfoliativní toxin B u klinických kmenů Staphylococcus aureus
PB  - Masarykova Univerzita
CY  - Brno
SN  - 9788021085855
N1  - Nepřenášíme do RIV, výsledek má jen 1 stranu, podle metodiky M17+ musí mít stať ve sborníku min. 2 strany.
KW  - ETB plasmid, exfoliative toxin B, phylogeny, genome analysis
UR  - http://www.med.muni.cz/tomdny/
N2  - Schopnost některých kmenů S. aureus produkovat exfoliativní toxiny je podmíněna obsahem specifických mobilních genetických elementů. Z hlediska medicínské praxe jsou nejvýznamnější exfoliativní toxiny A a B, které jsou kódovány geny lokalizovanými na profágu, respektive plazmidu. V této práci byly charakterizovány plazmidy kódující exfoliativní toxin B (ETB plazmidy), které byly izolovány z klinických kmenů zodpovědných za hromadná epidermolytická onemocnění v českých porodnicích. Byla provedena genotypizace a restrikční analýza plazmidů i jejich hostitelských kmenů. Na základě sekvenční analýzy byla navržena multiplex PCR pro detekci všech sekvenčních typů ETB plazmidů. Sekvenování, multiplex PCR a komparativní analýza ukázaly, že většina ETB plazmidů sdílí společnou „core“ sekvenci, typickou přítomností genů pro bakteriociny, inhibitor epidermální diferenciace typu C či rezistenci ke kadmiu. Tvoří tak ucelenou linii (I), jejíž zástupce lze rozdělit do čtyř sekvenčních typů podle přítomnosti specifických genomových úseků. Ty jsou tvořeny replikačními geny či transpozony kódujícími rezistenci k antibiotikům. Všechny plazmidy této linie byly detekovány v kmenech klonálního komplexu CC121, které často obsahovaly i profága s genem pro exfoliativní toxin A. Z bezprofágového kmene sekvenčního typu ST130 byl izolován dosud nepopsaný typ ETB plazmidu, obsahující geny pro konjugaci a také nové varianty genů pro exfoliativní toxin B a další faktory virulence. Geny lokalizované v „core“ sekvenci linie I se u něj nevyskytují. Přestože se dosud předpokládalo, že ETB plazmidy jsou relativně uniformní, byl v této práci izolován a detailně popsán nový, sekvenčně zcela odlišný typ. Svými vlastnostmi tak reprezentuje novou dosud nepopsanou linii (II) ETB plazmidů, mající však velký vliv na patogenitu toxinogenních kmenů S. aureus.
ER  -

BOTKA, Tibor, Vladislava RŮŽIČKOVÁ, Karla SVOBODOVÁ, Roman PANTŮČEK, Petr PETRÁŠ, Darina ČEJKOVÁ and Jiří DOŠKAŘ. Komparativní analýza dvou odlišných linií plazmidů kódujících exfoliativní toxin B u klinických kmenů Staphylococcus aureus (Comparative analysis of two distinct lineages of exfoliative toxin B encoding plasmids of Staphylococcus aureus clinical strains). In Lukáš Vacek. \textit{XXVI. konference mladých mikrobiologů TOMÁŠKOVY DNY 2017}. 1st ed. Brno: Masarykova Univerzita, 2017, p.~50. ISBN~978-80-210-8585-5.

Detailed Information on Publication Record