SEDLÁČEK, Ivo, Stanislava KRÁLOVÁ, Kamila KÝROVÁ, Ivana MAŠLAŇOVÁ, Hans-Jürgen BUSSE, Eva STAŇKOVÁ, Veronika VRBOVSKÁ, Miroslav NĚMEC, Miloš BARTÁK, Pavla HOLOCHOVÁ, Pavel ŠVEC a Roman PANTŮČEK. Red-pink pigmented Hymenobacter coccineus sp. nov., Hymenobacter lapidarius sp. nov. and Hymenobacter glacialis sp. nov., isolated from rocks in Antarctica. International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology. London: MICROBIOLOGY SOC, 2017, roč. 67, č. 6, s. 1975-1983. ISSN 1466-5026. doi:10.1099/ijsem.0.001898.
Další formáty:   BibTeX LaTeX RIS
Základní údaje
Originální název Red-pink pigmented Hymenobacter coccineus sp. nov., Hymenobacter lapidarius sp. nov. and Hymenobacter glacialis sp. nov., isolated from rocks in Antarctica
Autoři SEDLÁČEK, Ivo (203 Česká republika, garant, domácí), Stanislava KRÁLOVÁ (703 Slovensko, domácí), Kamila KÝROVÁ (203 Česká republika, domácí), Ivana MAŠLAŇOVÁ (203 Česká republika, domácí), Hans-Jürgen BUSSE (40 Rakousko), Eva STAŇKOVÁ (203 Česká republika, domácí), Veronika VRBOVSKÁ (703 Slovensko, domácí), Miroslav NĚMEC (203 Česká republika, domácí), Miloš BARTÁK (203 Česká republika, domácí), Pavla HOLOCHOVÁ (203 Česká republika, domácí), Pavel ŠVEC (203 Česká republika, domácí) a Roman PANTŮČEK (203 Česká republika, domácí).
Vydání International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology, London, MICROBIOLOGY SOC, 2017, 1466-5026.
Další údaje
Originální jazyk angličtina
Typ výsledku Článek v odborném periodiku
Obor 10600 1.6 Biological sciences
Stát vydavatele Velká Británie
Utajení není předmětem státního či obchodního tajemství
WWW URL
Impakt faktor Impact factor: 1.932
Kód RIV RIV/00216224:14310/17:00097224
Organizační jednotka Přírodovědecká fakulta
Doi http://dx.doi.org/10.1099/ijsem.0.001898
UT WoS 000405503800057
Klíčová slova anglicky Hymenobacter; species description; James Ross Island; taxonomy
Štítky NZ, rivok
Příznaky Mezinárodní význam, Recenzováno
Změnil Změnila: Ing. Nicole Zrilić, učo 240776. Změněno: 11. 4. 2018 12:36.
Anotace
Four aerobic bacterial strains CCM 8647, CCM 8649T, CCM 8643T and CCM 8648T were isolated from rocks samples collected at deglaciated northern part of James Ross Island, Antarctica. They were rod-shaped, Gram-stain-negative, non-motile and produced a reddish pigment on R2A agar. A polyphasic taxonomic approach based on extensive biotyping using conventional tests, commercial identification kits, fatty acid profile, chemotaxonomy, 16S rRNA gene sequencing, and whole genome sequencing was applied to isolates in order to clarify their taxonomic position. Phylogenetic analysis based on 16S rRNA gene indicated that all four isolates belonged into the genus Hymenobacter. The quinone systems contained exclusively menaquinone MK-7. The major polyamine was sym-homospermidine. All four strains contained the major lipid phosphatidylethanolamine and moderate amounts of phosphatidylserine, five unidentified lipids without a functional group and an unidentified phospholipid. The G+C content of genomic DNAs ranged 60 – 63 mol%. Obtained gene sequence similarities, with other validly named hymenobacters, were below 97.0 %, i.e. the threshold value recommended for species discrimination. Whole genome sequencing data supported the finding that isolates represent distinct Hymenobacter species. Based on obtained results, we propose three novel species for which the names Hymenobacter coccineus sp. nov., Hymenobacter lapidarius sp. nov., and Hymenobacter glacialis sp. nov. are suggested, with the type strains CCM 8649T (=LMG 29441T =P5239T), CCM 8643T (=LMG 29435T =P3150T), and CCM 8648T (=LMG 29440T =P5086T), respectively.
Návaznosti
LM2015078, projekt VaVNázev: Česká polární výzkumná infrastruktura (Akronym: CzechPolar2)
Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, Velké infrastruktury pro výzkum, vývoj a inovace
VytisknoutZobrazeno: 24. 10. 2021 16:34