BRIM, Luboš, Jiří BARNAT, David ŠAFRÁNEK, Nikola BENEŠ, Martin DEMKO, Samuel PASTVA a Matej HAJNAL. Detecting Attractors in Biological Models with Uncertain Parameters. In Jérôme Feret and Heinz Koeppl. Computational Methods in Systems Biology. CMSB 2017. LNCS 10545. Cham: Springer International Publishing. s. 40-56. ISBN 978-3-319-67470-4. doi:10.1007/978-3-319-67471-1_3. 2017.
Další formáty:   BibTeX LaTeX RIS
Základní údaje
Originální název Detecting Attractors in Biological Models with Uncertain Parameters
Autoři BRIM, Luboš (203 Česká republika, garant, domácí), Jiří BARNAT (203 Česká republika, domácí), David ŠAFRÁNEK (203 Česká republika, domácí), Nikola BENEŠ (203 Česká republika, domácí), Martin DEMKO (703 Slovensko, domácí), Samuel PASTVA (703 Slovensko, domácí) a Matej HAJNAL (703 Slovensko, domácí).
Vydání LNCS 10545. Cham, Computational Methods in Systems Biology. CMSB 2017, od s. 40-56, 17 s. 2017.
Nakladatel Springer International Publishing
Další údaje
Originální jazyk angličtina
Typ výsledku Stať ve sborníku
Obor 10201 Computer sciences, information science, bioinformatics
Stát vydavatele Česká republika
Utajení není předmětem státního či obchodního tajemství
Forma vydání tištěná verze "print"
Impakt faktor Impact factor: 0.402 v roce 2005
Kód RIV RIV/00216224:14330/17:00094899
Organizační jednotka Fakulta informatiky
ISBN 978-3-319-67470-4
ISSN 0302-9743
Doi http://dx.doi.org/10.1007/978-3-319-67471-1_3
UT WoS 000542715600003
Klíčová slova anglicky model checking; systems biology; Computational Tree Logic; dynamical systems; distributed algorithms;
Štítky firank_B
Příznaky Mezinárodní význam, Recenzováno
Změnil Změnil: doc. RNDr. David Šafránek, Ph.D., učo 3159. Změněno: 13. 5. 2021 13:12.
Anotace
Complex behaviour arising in biological systems is typically characterised by various kinds of attractors. An important problem in this area is to determine these attractors. Biological systems are usually described by highly parametrised dynamical models that can be represented as parametrised graphs typically constructed as discrete abstractions of continuous-time models. In such models, attractors are observed in the form of terminal strongly connected components (tSCCs). In this paper, we introduce a novel method for detecting tSCCs in parametrised graphs. The method is supplied with a parallel algorithm and evaluated on discrete abstractions of several non-linear biological models.
Návaznosti
GA15-11089S, projekt VaVNázev: Získávání parametrů biologických modelů pomocí techniky ověřování modelů
Investor: Grantová agentura ČR, Získávání parametrů biologických modelů pomocí techniky ověřování modelů
LM2015055, projekt VaVNázev: Centrum pro systémovou biologii (Akronym: C4SYS)
Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, The national infrastructure C4SYS - Centre for Systems Biology
MUNI/A/0992/2016, interní kód MUNázev: Zapojení studentů Fakulty informatiky do mezinárodní vědecké komunity (Akronym: SKOMU)
Investor: Masarykova univerzita, Zapojení studentů Fakulty informatiky do mezinárodní vědecké komunity, DO R. 2020_Kategorie A - Specifický výzkum - Studentské výzkumné projekty
VytisknoutZobrazeno: 16. 4. 2024 19:20