D
2017
Multi-Enzyme Pathway Optimisation Through Star-Shaped Reachable Sets
MAZURENKO, Stanislav, Jiří DAMBORSKÝ a Zbyněk PROKOP
Základní údaje
Originální název
Multi-Enzyme Pathway Optimisation Through Star-Shaped Reachable Sets
Vydání
Německo, 11th International Conference on Practical Applications of Computational Biology & Bioinformatics, od s. 9-17, 9 s. 2017
Nakladatel
Springer International Publishing
Další údaje
Typ výsledku
Stať ve sborníku
Obor
10102 Applied mathematics
Stát vydavatele
Portugalsko
Utajení
není předmětem státního či obchodního tajemství
Forma vydání
tištěná verze "print"
Kód RIV
RIV/00216224:14310/17:00099434
Organizační jednotka
Přírodovědecká fakulta
Klíčová slova anglicky
Enzyme kinetics; Optimal control; Synthetic biology; Metabolic networks; Non-linear dynamics
Příznaky
Mezinárodní význam, Recenzováno
V originále
This article studies the time evolution of multi-enzyme pathways. The non-linearity of the problem coupled with the infinite dimensionality of the time-dependent input usually results in a rather laborious optimization. Here we discuss how the optimization of the input enzyme concentrations might be efficiently reduced to a calculation of reachable sets. Under some general conditions, the original system has star-shaped reachable sets that can be derived by solving a partial differential equation. This method allows a thorough study and optimization of quite sophisticated enzymatic pathways with non-linear dynamics and possible inhibition. Moreover, optimal control synthesis based on reachable sets can be implemented and was tested on several simulated examples.
Návaznosti
LM2011028, projekt VaV | Název: RECETOX ? Národní infrastruktura pro výzkum toxických látek v prostředí | Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, RECETOX Národní infrastruktura pro výzkum toxických látek v prostředí |
|
LO1214, projekt VaV | Název: Centrum pro výzkum toxických látek v prostředí (Akronym: RECETOX) | Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, Centrum pro výzkum toxických látek v prostředí |
|
Zobrazeno: 3. 11. 2024 10:16