PANTŮČEK, Roman, Ivo SEDLÁČEK, Adéla INDRÁKOVÁ, Veronika VRBOVSKÁ, Ivana MAŠLAŇOVÁ, Vojtěch KOVAŘOVIC, Pavel ŠVEC, Stanislava KRÁLOVÁ, Lucie KRIŠTOFOVÁ, Jana KEKLÁKOVÁ, Petr PETRÁŠ a Jiří DOŠKAŘ. Staphylococcus edaphicus sp nov., isolated in Antarctica, harbors the mecC gene and genomic islands with a suspected role in adaptation to extreme environments. APPLIED AND ENVIRONMENTAL MICROBIOLOGY. Washington, D.C.: American Society for Microbiology, 2018, roč. 84, č. 2, s. 1-13. ISSN 0099-2240. doi:10.1128/AEM.01746-17.
Další formáty:   BibTeX LaTeX RIS
Základní údaje
Originální název Staphylococcus edaphicus sp nov., isolated in Antarctica, harbors the mecC gene and genomic islands with a suspected role in adaptation to extreme environments
Autoři PANTŮČEK, Roman (203 Česká republika, garant, domácí), Ivo SEDLÁČEK (203 Česká republika, domácí), Adéla INDRÁKOVÁ (203 Česká republika, domácí), Veronika VRBOVSKÁ (703 Slovensko, domácí), Ivana MAŠLAŇOVÁ (203 Česká republika, domácí), Vojtěch KOVAŘOVIC (203 Česká republika, domácí), Pavel ŠVEC (203 Česká republika, domácí), Stanislava KRÁLOVÁ (703 Slovensko, domácí), Lucie KRIŠTOFOVÁ (203 Česká republika, domácí), Jana KEKLÁKOVÁ (203 Česká republika), Petr PETRÁŠ (203 Česká republika) a Jiří DOŠKAŘ (203 Česká republika, domácí).
Vydání APPLIED AND ENVIRONMENTAL MICROBIOLOGY, Washington, D.C. American Society for Microbiology, 2018, 0099-2240.
Další údaje
Originální jazyk angličtina
Typ výsledku Článek v odborném periodiku
Obor 10606 Microbiology
Stát vydavatele Spojené státy
Utajení není předmětem státního či obchodního tajemství
WWW URL
Impakt faktor Impact factor: 4.077
Kód RIV RIV/00216224:14310/18:00102400
Organizační jednotka Přírodovědecká fakulta
Doi http://dx.doi.org/10.1128/AEM.01746-17
UT WoS 000419048900009
Klíčová slova anglicky coagulase-negative staphylococci; methicillin resistance; genomics; polyphasic taxonomy; pathogenicity islands; drug resistance evolution; beta-lactams; chromosomal islands; mobile genetic elements; penicillin-binding proteins; phylogenetic analysis
Příznaky Mezinárodní význam, Recenzováno
Změnil Změnila: Mgr. Tereza Miškechová, učo 341652. Změněno: 2. 5. 2019 14:10.
Anotace
Two Gram-stain-positive, coagulase-negative staphylococcal strains were isolated from abiotic sources comprising stone fragments and sandy soil in James Ross Island, Antarctica. Here, we describe properties of a novel species of the genus Staphylococcus that has a 16S rRNA gene sequence nearly identical to that of Staphylococcus saprophyticus. However, compared to S. saprophyticus and the next closest relatives, the new species demonstrates considerable phylogenetic distance at the whole-genome level, with an average nucleotide identity of <85% and inferred DNA-DNA hybridization of <30%. It forms a separate branch in the S. saprophyticus phylogenetic clade as confirmed by multilocus sequence analysis of six housekeeping genes, rpoB, hsp60, tuf, dnaJ, gap, and sod. Matrix-assisted laser desorption ionization-time of flight mass spectrometry (MALDI-TOF MS) and key biochemical characteristics allowed these bacteria to be distinguished from their nearest phylogenetic neighbors. In contrast to S. saprophyticus subsp. saprophyticus, the novel strains are pyrrolidonyl arylamidase and beta-glucuronidase positive and beta-galactosidase negative, nitrate is reduced, and acid produced aerobically from D-mannose. Whole-genome sequencing of the 2.69-Mb large chromosome revealed the presence of a number of mobile genetic elements, including the 27-kb pseudo-staphylococcus cassette chromosome mec of strain P5085(T) (psi SCCmec(P5085)), harboring the mecC gene, two composite phage-inducible chromosomal islands probably essential to adaptation to extreme environments, and one complete and one defective prophage. Both strains are resistant to penicillin G, ampicillin, ceftazidime, methicillin, cefoxitin, and fosfomycin. We hypothesize that antibiotic resistance might represent an evolutionary advantage against beta-lactam producers, which are common in a polar environment. Based on these results, a novel species of the genus Staphylococcus is described and named Staphylococcus edaphicus sp. nov. The type strain is P5085(T) (= CCM 8730(T) = DSM 104441(T).
Návaznosti
LM2015078, projekt VaVNázev: Česká polární výzkumná infrastruktura (Akronym: CzechPolar2)
Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, Velké infrastruktury pro výzkum, vývoj a inovace
NV16-29916A, projekt VaVNázev: Využití bakteriofágů v léčbě nozokomiálních infekcí spojených s multirezistencí či tvorbou biofilmu
Typ Název Vložil/a Vloženo Práva
Appl._Environ._Microbiol.-2018-Pant__ek-.pdf Licence Creative Commons  Verze souboru Pantůček, R. 14. 3. 2018

Práva

Právo číst
 
Právo vkládat
 
Právo spravovat
  • osoba Mgr. Ivana Mašlaňová, Ph.D., učo 106011
  • osoba doc. RNDr. Pavel Švec, Ph.D., učo 1098
  • osoba prof. RNDr. Jiří Doškař, CSc., učo 2591
  • osoba Mgr. Veronika Vrbovská, Ph.D., učo 357591
  • osoba RNDr. Stanislava Králová, Ph.D., učo 357877
  • osoba Mgr. Adéla Indráková, učo 380418
  • osoba Mgr. Lucie Krištofová, učo 397803
  • osoba Mgr. Vojtěch Kovařovic, učo 408266
  • osoba doc. RNDr. Roman Pantůček, Ph.D., učo 842
  • osoba prof. RNDr. Ivo Sedláček, CSc., učo 866
Atributy
 
Vytisknout
Požádat autora o autorský výtisk Zobrazeno: 21. 9. 2021 22:34