D 2018

Fully Automated Attractor Analysis of Cyanobacteria Models

BENEŠ, Nikola, Luboš BRIM, Jan ČERVENÝ, Samuel PASTVA, David ŠAFRÁNEK et. al.

Základní údaje

Originální název

Fully Automated Attractor Analysis of Cyanobacteria Models

Název česky

Plne Automatizovaná Analýza Atraktorů Modelů Cyanobaktérií

Autoři

BENEŠ, Nikola (203 Česká republika, domácí), Luboš BRIM (203 Česká republika, domácí), Jan ČERVENÝ (203 Česká republika), Samuel PASTVA (703 Slovensko, domácí), David ŠAFRÁNEK (203 Česká republika, domácí), Jakub ŠALAGOVIČ (703 Slovensko) a Matej TROJÁK (703 Slovensko, domácí)

Vydání

Neuveden, 22nd International Conference on System Theory, Control and Computing, od s. 354-359, 6 s. 2018

Nakladatel

IEEE

Další údaje

Jazyk

angličtina

Typ výsledku

Stať ve sborníku

Obor

10201 Computer sciences, information science, bioinformatics

Utajení

není předmětem státního či obchodního tajemství

Forma vydání

tištěná verze "print"

Odkazy

URL

Kód RIV

RIV/00216224:14330/18:00101265

Organizační jednotka

Fakulta informatiky

ISBN

978-1-5386-4444-7

DOI

http://dx.doi.org/10.1109/ICSTCC.2018.8540762

UT WoS

000465109800058

Klíčová slova česky

atraktory; parametrizovaný graf; koncové silne souvislé komponenty; cyanobaktérie

Klíčová slova anglicky

attractors; parametrised graph; terminal strongly connected components; cyanobacteria

Štítky

firank_B

Příznaky

Mezinárodní význam, Recenzováno
Změněno: 13. 5. 2020 19:34, RNDr. Pavel Šmerk, Ph.D.

Anotace

V originále

Complex dynamics arising in biological systems can be characterised by various kinds of attractors. To that end, the task of determining attractors becomes important in modern systems analysis. Biological systems are typically formalised as highly parametrised continuous-time ODE models. Such models can be abstracted in the form of parametrised graphs. In such abstractions, attractors are observed in the form of terminal strongly connected components (tSCCs). In this paper, we demon- strate a novel method for detecting tSCCs in parametrised graphs on several models of cyanobacteria taken from the domain- specific online platform e-cyanobacterium.org.

Návaznosti

GA18-00178S, projekt VaV
Název: Diskrétní bifurkační analýza reaktivních systémů
Investor: Grantová agentura ČR, Diskrétní bifurkační analýza reaktivních systémů
LM2015055, projekt VaV
Název: Centrum pro systémovou biologii (Akronym: C4SYS)
Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, The national infrastructure C4SYS - Centre for Systems Biology
MUNI/A/0854/2017, interní kód MU
Název: Rozsáhlé výpočetní systémy: modely, aplikace a verifikace VII.
Investor: Masarykova univerzita, Rozsáhlé výpočetní systémy: modely, aplikace a verifikace VII., DO R. 2020_Kategorie A - Specifický výzkum - Studentské výzkumné projekty
Zobrazeno: 5. 11. 2024 05:12