D
2018
Fully Automated Attractor Analysis of Cyanobacteria Models
BENEŠ, Nikola, Luboš BRIM, Jan ČERVENÝ, Samuel PASTVA, David ŠAFRÁNEK et. al.
Základní údaje
Originální název
Fully Automated Attractor Analysis of Cyanobacteria Models
Název česky
Plne Automatizovaná Analýza Atraktorů Modelů Cyanobaktérií
Autoři
BENEŠ, Nikola (203 Česká republika, domácí),
Luboš BRIM (203 Česká republika, domácí),
Jan ČERVENÝ (203 Česká republika),
Samuel PASTVA (703 Slovensko, domácí),
David ŠAFRÁNEK (203 Česká republika, domácí),
Jakub ŠALAGOVIČ (703 Slovensko) a
Matej TROJÁK (703 Slovensko, domácí)
Vydání
Neuveden, 22nd International Conference on System Theory, Control and Computing, od s. 354-359, 6 s. 2018
Další údaje
Typ výsledku
Stať ve sborníku
Obor
10201 Computer sciences, information science, bioinformatics
Utajení
není předmětem státního či obchodního tajemství
Forma vydání
tištěná verze "print"
Kód RIV
RIV/00216224:14330/18:00101265
Organizační jednotka
Fakulta informatiky
Klíčová slova česky
atraktory; parametrizovaný graf; koncové silne souvislé komponenty; cyanobaktérie
Klíčová slova anglicky
attractors; parametrised graph; terminal strongly connected components; cyanobacteria
Příznaky
Mezinárodní význam, Recenzováno
V originále
Complex dynamics arising in biological systems can be characterised by various kinds of attractors. To that end, the task of determining attractors becomes important in modern systems analysis. Biological systems are typically formalised as highly parametrised continuous-time ODE models. Such models can be abstracted in the form of parametrised graphs. In such abstractions, attractors are observed in the form of terminal strongly connected components (tSCCs). In this paper, we demon- strate a novel method for detecting tSCCs in parametrised graphs on several models of cyanobacteria taken from the domain- specific online platform e-cyanobacterium.org.
Návaznosti
GA18-00178S, projekt VaV | Název: Diskrétní bifurkační analýza reaktivních systémů | Investor: Grantová agentura ČR, Diskrétní bifurkační analýza reaktivních systémů |
|
LM2015055, projekt VaV | Název: Centrum pro systémovou biologii (Akronym: C4SYS) | Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, The national infrastructure C4SYS - Centre for Systems Biology |
|
MUNI/A/0854/2017, interní kód MU | Název: Rozsáhlé výpočetní systémy: modely, aplikace a verifikace VII. | Investor: Masarykova univerzita, Rozsáhlé výpočetní systémy: modely, aplikace a verifikace VII., DO R. 2020_Kategorie A - Specifický výzkum - Studentské výzkumné projekty |
|
Zobrazeno: 5. 11. 2024 05:12