BENEŠ, Nikola, Luboš BRIM, Jan ČERVENÝ, Samuel PASTVA, David ŠAFRÁNEK, Jakub ŠALAGOVIČ a Matej TROJÁK. Fully Automated Attractor Analysis of Cyanobacteria Models. In Marian Barbu, Răzvan Şolea, Adrian Filipescu. 22nd International Conference on System Theory, Control and Computing. Neuveden: IEEE. s. 354-359. ISBN 978-1-5386-4444-7. doi:10.1109/ICSTCC.2018.8540762. 2018.
Další formáty:   BibTeX LaTeX RIS
Základní údaje
Originální název Fully Automated Attractor Analysis of Cyanobacteria Models
Název česky Plne Automatizovaná Analýza Atraktorů Modelů Cyanobaktérií
Autoři BENEŠ, Nikola (203 Česká republika, domácí), Luboš BRIM (203 Česká republika, domácí), Jan ČERVENÝ (203 Česká republika), Samuel PASTVA (703 Slovensko, domácí), David ŠAFRÁNEK (203 Česká republika, domácí), Jakub ŠALAGOVIČ (703 Slovensko) a Matej TROJÁK (703 Slovensko, domácí).
Vydání Neuveden, 22nd International Conference on System Theory, Control and Computing, od s. 354-359, 6 s. 2018.
Nakladatel IEEE
Další údaje
Originální jazyk angličtina
Typ výsledku Stať ve sborníku
Obor 10201 Computer sciences, information science, bioinformatics
Utajení není předmětem státního či obchodního tajemství
Forma vydání tištěná verze "print"
WWW URL
Kód RIV RIV/00216224:14330/18:00101265
Organizační jednotka Fakulta informatiky
ISBN 978-1-5386-4444-7
Doi http://dx.doi.org/10.1109/ICSTCC.2018.8540762
UT WoS 000465109800058
Klíčová slova česky atraktory; parametrizovaný graf; koncové silne souvislé komponenty; cyanobaktérie
Klíčová slova anglicky attractors; parametrised graph; terminal strongly connected components; cyanobacteria
Štítky firank_B
Příznaky Mezinárodní význam, Recenzováno
Změnil Změnil: RNDr. Pavel Šmerk, Ph.D., učo 3880. Změněno: 13. 5. 2020 19:34.
Anotace
Complex dynamics arising in biological systems can be characterised by various kinds of attractors. To that end, the task of determining attractors becomes important in modern systems analysis. Biological systems are typically formalised as highly parametrised continuous-time ODE models. Such models can be abstracted in the form of parametrised graphs. In such abstractions, attractors are observed in the form of terminal strongly connected components (tSCCs). In this paper, we demon- strate a novel method for detecting tSCCs in parametrised graphs on several models of cyanobacteria taken from the domain- specific online platform e-cyanobacterium.org.
Návaznosti
GA18-00178S, projekt VaVNázev: Diskrétní bifurkační analýza reaktivních systémů
Investor: Grantová agentura ČR, Diskrétní bifurkační analýza reaktivních systémů
LM2015055, projekt VaVNázev: Centrum pro systémovou biologii (Akronym: C4SYS)
Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, The national infrastructure C4SYS - Centre for Systems Biology
MUNI/A/0854/2017, interní kód MUNázev: Rozsáhlé výpočetní systémy: modely, aplikace a verifikace VII.
Investor: Masarykova univerzita, Rozsáhlé výpočetní systémy: modely, aplikace a verifikace VII., DO R. 2020_Kategorie A - Specifický výzkum - Studentské výzkumné projekty
VytisknoutZobrazeno: 23. 4. 2024 08:11