SEDLÁČEK, Ivo, Roman PANTŮČEK, Stanislava KRÁLOVÁ, Ivana MAŠLAŇOVÁ, Pavla HOLOCHOVÁ, Eva STAŇKOVÁ, Veronika VRBOVSKÁ, Pavel ŠVEC a Hans Jürgen BUSSE. Hymenobacter amundsenii sp. nov. resistant to ultraviolet radiation, isolated from regoliths in Antarctica. Systematic and Applied Microbiology. Munich: Elsevier, 2019, roč. 42, č. 3, s. 284-290. ISSN 0723-2020. doi:10.1016/j.syapm.2018.12.004.
Další formáty:   BibTeX LaTeX RIS
Základní údaje
Originální název Hymenobacter amundsenii sp. nov. resistant to ultraviolet radiation, isolated from regoliths in Antarctica
Autoři SEDLÁČEK, Ivo (203 Česká republika, garant, domácí), Roman PANTŮČEK (203 Česká republika, domácí), Stanislava KRÁLOVÁ (703 Slovensko, domácí), Ivana MAŠLAŇOVÁ (203 Česká republika, domácí), Pavla HOLOCHOVÁ (203 Česká republika, domácí), Eva STAŇKOVÁ (203 Česká republika, domácí), Veronika VRBOVSKÁ (703 Slovensko, domácí), Pavel ŠVEC (203 Česká republika, domácí) a Hans Jürgen BUSSE (40 Rakousko).
Vydání Systematic and Applied Microbiology, Munich, Elsevier, 2019, 0723-2020.
Další údaje
Originální jazyk angličtina
Typ výsledku Článek v odborném periodiku
Obor 10606 Microbiology
Stát vydavatele Německo
Utajení není předmětem státního či obchodního tajemství
WWW Full Text
Impakt faktor Impact factor: 3.224
Kód RIV RIV/00216224:14310/19:00109853
Organizační jednotka Přírodovědecká fakulta
Doi http://dx.doi.org/10.1016/j.syapm.2018.12.004
UT WoS 000468595700003
Klíčová slova anglicky Hymenobacter amundsenii; Antarctica; Soil bacteria; Regolith; UV-radiation resistance; Species description
Štítky rivok
Příznaky Mezinárodní význam, Recenzováno
Změnil Změnila: Mgr. Marie Šípková, DiS., učo 437722. Změněno: 18. 3. 2020 14:53.
Anotace
A group of thirteen bacterial strains was isolated from rock samples collected in a deglaciated northern part of James Ross Island, Antarctica. The cells were rod-shaped, Gram-stain-negative, non-motile, catalase positive, and produced moderately slimy, ultraviolet light (UVC)-irradiation-resistant and red-pink pigmented colonies on R2A agar. A polyphasic taxonomic approach based on 16S rRNA gene sequencing, extensive biotyping, fatty acid profile, chemotaxonomy analyses, and whole genome sequencing were applied in order to clarify the taxonomic position of these isolates. Phylogenetic analysis based on the 16S rRNA gene indicated that all isolates constituted a coherent group belonging to the genus Hymenobacter. The closest relatives to the representative isolate P5136(T) were Hymenobacter psychrophilus BZ33r(T) and Hymenobacter rubripertinctus CCM 8852(T), exhibiting 97.53% and 97.47% 16S rRNA pairwise similarity, respectively. Average nucleotide identity calculated from the whole-genome sequencing data supported the finding that P5136(T) represents a distinct Hymenobacter species. The major components in fatty acid profiles were Summed Feature 3 (C-16:1 omega 7c/C-16:1 omega 6c), C-16:1 omega 5c, C-15:0 iso and C-15:0 anteiso. The cellular quinone content contained unanimously menaquinone MK-6 and MK-7 (ratio 1:5.1). The predominant polar lipid was phosphatidylethanolamine, and moderate to minor amounts of two unknown polar lipids, two unknown aminolipids, one unknown glycolipid and two unknown glycophospholipids were present. The G + C content of genomic DNAs is 60.31 mol%. Based on all the obtained results, we propose a novel species for which the name Hymenobacter amundsenii sp. nov. is suggested, with the type strain P5136(T) (= CCM 8682(T) =LMG 29687(T)). (C) 2018 Elsevier GmbH. All rights reserved.
Návaznosti
LM2015078, projekt VaVNázev: Česká polární výzkumná infrastruktura (Akronym: CzechPolar2)
Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, Velké infrastruktury pro výzkum, vývoj a inovace
MUNI/A/0824/2017, interní kód MUNázev: Podpora výzkumné činnosti studentů molekulární biologie a genetiky 6 (Akronym: MolBiolGen)
Investor: Masarykova univerzita, Grantová agentura MU, DO R. 2020_Kategorie A - Specifický výzkum - Studentské výzkumné projekty
Typ Název Vložil/a Vloženo Práva
1-s2.0-S0723202018300596-main__1_.pdf Licence Creative Commons  Verze souboru Pantůček, R. 7. 6. 2019

Práva

Právo číst
 
Právo vkládat
 
Právo spravovat
  • osoba Mgr. Ivana Mašlaňová, Ph.D., učo 106011
  • osoba doc. RNDr. Pavel Švec, Ph.D., učo 1098
  • osoba Mgr. Pavla Holochová, PhD., učo 13258
  • osoba Bc. Eva Staňková, učo 134329
  • osoba Mgr. Veronika Vrbovská, Ph.D., učo 357591
  • osoba RNDr. Stanislava Králová, Ph.D., učo 357877
  • osoba doc. RNDr. Roman Pantůček, Ph.D., učo 842
  • osoba prof. RNDr. Ivo Sedláček, CSc., učo 866
Atributy
 
Vytisknout
Požádat autora o autorský výtisk Zobrazeno: 26. 2. 2021 08:47