Detailed Information on Publication Record
2019
Efektivní metodika pro stanovení haplogenotypů lektinu vázajícího manózu a role tohoto receptoru v etiopatogenezi onemocnění dutiny ústní
MOHLEROVÁ, Nora, Jana MRÁZKOVÁ, Petr ŠÍSTEK, Jan LOCHMAN, Lydie IZAKOVIČOVÁ HOLLÁ et. al.Basic information
Original name
Efektivní metodika pro stanovení haplogenotypů lektinu vázajícího manózu a role tohoto receptoru v etiopatogenezi onemocnění dutiny ústní
Name (in English)
Effective methodology for determination of mannose-binding lectin haplogenotypes and roles of this receptor in the etiopathogenesis of oral disease
Authors
MOHLEROVÁ, Nora (203 Czech Republic, belonging to the institution), Jana MRÁZKOVÁ (203 Czech Republic, belonging to the institution), Petr ŠÍSTEK (203 Czech Republic), Jan LOCHMAN (203 Czech Republic, belonging to the institution), Lydie IZAKOVIČOVÁ HOLLÁ (203 Czech Republic, belonging to the institution) and Petra BOŘILOVÁ LINHARTOVÁ (203 Czech Republic, guarantor, belonging to the institution)
Edition
63. Studentská vědecká konference LF MU, 2019
Other information
Language
Czech
Type of outcome
Konferenční abstrakt
Field of Study
10603 Genetics and heredity
Country of publisher
Czech Republic
Confidentiality degree
není předmětem státního či obchodního tajemství
RIV identification code
RIV/00216224:14110/19:00108549
Organization unit
Faculty of Medicine
ISBN
978-80-210-9285-3
Keywords in English
mannose-binding lectin haplogenotypes; etiopathogenesis of oral disease
Tags
Změněno: 22/4/2020 08:52, Mgr. Tereza Miškechová
V originále
Úvod a cíl: Lektin vázající manózu (MBL) hraje důležitou roli v rámci vrozené imunity. Tento receptor rozpoznávající molekulární vzory na povrchu patogenů je studován a asociován s řadou chorob dutiny ústní (recidivující aftózní stomatitidou, parodontitidou, orálním lichen planus, zubním kazem). Cílem práce bylo navrhnout efektivní metodiku pro identifikaci funkčních polymorfizmů v MBL2 genu, jejichž alelické a genotypové kombinace ovlivňují expresi genu MBL2. Metodika: Byly vybrány tři polymorfizmy v oblasti exonu 1 v kodonech 52, 54 a 57 (těm odpovídají alely D, B a C), dále dva polymorfizmy v promotoru 1 na pozicích -550 (alelová varianta H/L) a -221 (alelová varianta X/Y) a na pozici +4 v 5' nepřekládané oblasti (alelová varianta P/Q) na souboru 353 osob české národnosti. Byl navržen originální protokol pro stanovení variant všech šesti polymorfizmů v rámci jedné SNaPshot analýzy. Pro zpracování dat a následnou haplotypovou/haplogenotypovou analýzu byl vyvinut originální algoritmus. Validace SNaPshot analýzy byla provedena komparací získaných výsledků u 10 vybraných vzorků pomocí sekvenační analýzy a alelově specifické PCR, která se standardně používá pro genotypizaci MBL2. Výsledky: Optimalizovaný protokol byl nastaven na 100 ng vstupní genomové DNA pro analýzu všech šesti polymorfizmů. Spotřeba komerční SNaPshot reakční směsi je 5× nižší než je doporučeno v přiloženém návodu při zachování stejné účinnosti. Genotypové rozložení u všech studovaných variant bylo v Hardy-Weinbergerově rovnováze (P>0,05). Frekvence minoritních alel všech šesti polymorfizmů ve zvolené kohortě odpovídalo frekvencím v evropské populaci. Výsledné genotypy získané touto metodou byly ve 100% shodě s výsledky získanými dalšími dvěma metodickými přístupy. Závěr: Pro určení šesti polymorfizmů v genu MBL2 jsme vyvinuli metodiku, která je rychlá, spolehlivá, nenáročná na vstupní množství DNA a ekonomicky výhodná. Metodika a algoritmus pro sestavení haplotypů/haplogenotypů jsou nyní připraveny pro využití při genetických asociačních studiích, které jsou zaměřeny nejenom na choroby dutiny ústní, ale i na další onemocnění. Poděkování: Studie byla podpořena z grantu NV17-30439A, ze specifického výzkumu MUNI/A/1546/2018 a z prostředků poskytnutých Lékařskou fakultou MU juniorskému výzkumníkovi Petře Bořilové Linhartové.
In English
Mannose-binding lectin (MBL) plays an important role in innate immunity. This receptor recognizing molecular patterns on the surface of pathogens is studied and associated with a number of diseases of the oral cavity (recurrent aphthous stomatitis, periodontitis, oral lichen planus, tooth decay). The aim of this work was to design an effective methodology for the identification of functional polymorphisms in the MBL2 gene, whose allelic and genotypic combinations affect the expression of the MBL2 gene.
Links
| MUNI/A/1546/2018, interní kód MU |
| ||
| NV17-30439A, research and development project |
| ||
| ROZV/23/LF1/2019, interní kód MU |
|