Využití sekvenování nové generace v analýze cirkulujících
mikroRNA jako prediktivních bio markerů u pacientů s lokálně
pokročilým karcinomem rekta

J 2019

Využití sekvenování nové generace v analýze cirkulujících mikroRNA jako prediktivních bio markerů u pacientů s lokálně pokročilým karcinomem rekta

MACHÁČKOVÁ, Táňa, Tomáš GROLICH, L. FIALA, Vladimír PROCHÁZKA, M. ŠKROVINA et. al.

Basic information

Original name

Využití sekvenování nové generace v analýze cirkulujících mikroRNA jako prediktivních bio markerů u pacientů s lokálně pokročilým karcinomem rekta

Name (in English)

Utilization of next generation sequencing in analysis of circulating micrornas as predictive biomarkers for patients with locally advanced rectal Carcinoma

Authors

MACHÁČKOVÁ, Táňa (203 Czech Republic, belonging to the institution), Tomáš GROLICH (203 Czech Republic), L. FIALA, Vladimír PROCHÁZKA (203 Czech Republic, belonging to the institution), M. ŠKROVINA, Zdeněk KALA (203 Czech Republic, belonging to the institution) and Ondřej SLABÝ (203 Czech Republic, guarantor, belonging to the institution)

Edition

Klinická onkologie, Ambit Media a.s. 2019, 0862-495X

Other information

Language

Czech

Type of outcome

Článek v odborném periodiku

Field of Study

30204 Oncology

Country of publisher

Czech Republic

Confidentiality degree

není předmětem státního či obchodního tajemství

References:

URL

RIV identification code

RIV/00216224:14740/19:00108619

Organization unit

Central European Institute of Technology

Keywords in English

MicroRNAs; Neoplasms; CRC patients

Abstract

ORIG EN

V originále

MikroRNA (miRNA) jsou krátké nekódující RNA podílející se na posttranskripční regulaci genové exprese. Jsou esenciálními regulátory fyziologických procesů, podílejí se na patogenezi mnoha onemocnění a jejich deregulace byla prokázána u řady nádorových onemocnění vč. karcinomu rekta. Cirkulující miRNA přítomné v krevní plazmě by mohly být vhodnými kandidáty na neinvaziní prediktivní biomarkery odpovědi na neoadjuvantní chemoradioterapii u pacientů s lokálně pokročilým karcinomem rekta. Předkládaná pilotní studie se zabývá využitím sekvenování nové generace k analýze cirkulujících miRNA.

In English

MicroRNAs (miRNA) are short non-coding RNAs involved in post-transcriptional regulation of gene expression. MiRNAs are essential regulators of both physiological processes as of pathogeneses of many diseases, and their dysregulation was observed in many malignancies including rectal cancer. Circulating miRNAs presented in blood plasma could be potential candidates for non-invasive predictive bio markers of the response of patients with locally advanced rectal cancer to chemoradiotherapy. Presented study aims to evaluate the potential of next-generation sequencing in the analysis of circulating miRNAs. Material and methods: MiRNA expression profi les were done using samples of RNA isolated from blood plasma collected during TNM restaging and paired samples collected before initiation of neoadjuvant chemoradiotherapy. Sequencing libraries were prepared using kit which implements universal molecular indices that help to sensitively fi lter bio logical bias during data analysis. Sequencing data were processed by multidimensional bio statistical approaches. Conclusion: We identifi ed specific miRNA profi le enabling to distinguish the patients accordingly to their response to chemoradiotherapy.

Links

NV16-31765A, research and development project

Name: Využití tkáňových/cirkulujících mikroRNA pro predikci léčebné odpovědi a zpřesnění restagingu karcinomu rekta po neoadjuvantní léčbě

Citovat

MACHÁČKOVÁ, Táňa, Tomáš GROLICH, L. FIALA, Vladimír PROCHÁZKA, M. ŠKROVINA, Zdeněk KALA and Ondřej SLABÝ. Využití sekvenování nové generace v analýze cirkulujících mikroRNA jako prediktivních bio markerů u pacientů s lokálně pokročilým karcinomem rekta (Utilization of next generation sequencing in analysis of circulating micrornas as predictive biomarkers for patients with locally advanced rectal Carcinoma). Klinická onkologie. Ambit Media a.s., 2019, vol. 32, No 2019, p. 157-159. ISSN 0862-495X.

@article{1642603,
   author = {Macháčková, Táňa and Grolich, Tomáš and Fiala, L. and Procházka, Vladimír and Škrovina, M. and Kala, Zdeněk and Slabý, Ondřej},
   article_number = {2019},
   keywords = {MicroRNAs; Neoplasms; CRC patients},
   language = {cze},
   issn = {0862-495X},
   journal = {Klinická onkologie},
   title = {Využití sekvenování nové generace v analýze cirkulujících mikroRNA jako prediktivních bio markerů u pacientů s lokálně pokročilým karcinomem rekta},
   url = {https://www.prolekare.cz/casopisy/klinicka-onkologie/2019-supplementum1/vyuziti-sekvenovani-nove-generace-v-analyze-cirkulujicich-mikrorna-jako-prediktivnich-biomarkeru-u-pacientu-s-lokalne-pokrocilym-karcinomem-rekta-109557},
   volume = {32},
   year = {2019}
}

TY  - JOUR
ID  - 1642603
AU  - Macháčková, Táňa - Grolich, Tomáš - Fiala, L. - Procházka, Vladimír - Škrovina, M. - Kala, Zdeněk - Slabý, Ondřej
PY  - 2019
TI  - Využití sekvenování nové generace v analýze cirkulujících mikroRNA jako prediktivních bio markerů u pacientů s lokálně pokročilým karcinomem rekta
JF  - Klinická onkologie
VL  - 32
IS  - 2019
SP  - 157-159
EP  - 157-159
PB  - Ambit Media a.s.
SN  - 0862495X
KW  - MicroRNAs
KW  - Neoplasms
KW  - CRC patients
UR  - https://www.prolekare.cz/casopisy/klinicka-onkologie/2019-supplementum1/vyuziti-sekvenovani-nove-generace-v-analyze-cirkulujicich-mikrorna-jako-prediktivnich-biomarkeru-u-pacientu-s-lokalne-pokrocilym-karcinomem-rekta-109557
L2  - https://www.prolekare.cz/casopisy/klinicka-onkologie/2019-supplementum1/vyuziti-sekvenovani-nove-generace-v-analyze-cirkulujicich-mikrorna-jako-prediktivnich-biomarkeru-u-pacientu-s-lokalne-pokrocilym-karcinomem-rekta-109557
N2  - MikroRNA (miRNA) jsou krátké nekódující RNA podílející se na posttranskripční regulaci genové exprese. Jsou esenciálními regulátory fyziologických procesů, podílejí se na patogenezi mnoha onemocnění a jejich deregulace byla prokázána u řady nádorových onemocnění vč. karcinomu rekta. Cirkulující miRNA přítomné v krevní plazmě by mohly být vhodnými kandidáty na neinvaziní prediktivní biomarkery odpovědi na neoadjuvantní chemoradioterapii u pacientů s lokálně pokročilým karcinomem rekta. Předkládaná pilotní studie se zabývá využitím sekvenování nové generace k analýze cirkulujících miRNA.
ER  -

MACHÁČKOVÁ, Táňa, Tomáš GROLICH, L. FIALA, Vladimír PROCHÁZKA, M. ŠKROVINA, Zdeněk KALA and Ondřej SLABÝ. Využití sekvenování nové generace v analýze cirkulujících mikroRNA jako prediktivních bio markerů u pacientů s lokálně pokročilým karcinomem rekta (Utilization of next generation sequencing in analysis of circulating micrornas as predictive biomarkers for patients with locally advanced rectal Carcinoma). \textit{Klinická onkologie}. Ambit Media a.s., 2019, vol.~32, No~2019, p.~157-159. ISSN~0862-495X.

Detailed Information on Publication Record