ZDRÁHAL, Zbyněk. Processing of proteomics data in KNIME. 2019.
Další formáty:   BibTeX LaTeX RIS
Základní údaje
Originální název Processing of proteomics data in KNIME
Název anglicky Processing of proteomics data in KNIME
Autoři ZDRÁHAL, Zbyněk (203 Česká republika, garant, domácí).
Vydání 2019.
Další údaje
Originální jazyk čeština
Typ výsledku Uspořádání workshopu
Obor 10600 1.6 Biological sciences
Stát vydavatele Česká republika
Utajení není předmětem státního či obchodního tajemství
WWW URL
Kód RIV RIV/00216224:14740/19:00113578
Organizační jednotka Středoevropský technologický institut
Klíčová slova anglicky proteomics; data processing; analytics; infrastructure
Štítky rivok
Změnil Změnila: Mgr. Pavla Foltynová, Ph.D., učo 106624. Změněno: 7. 4. 2020 13:11.
Anotace
Zpracování dat proteomiky se stává stále složitější a obtížnější. V reakci na tento trend byl vytvořen software KNIME Analytics Platform. Vyvíjíme také nové metody a komponenty KNIME, které umožní využití pokročilých metod zpracování dat a vizualizačních technik. Díky tomu vytváří reprodukovatelné a flexibilní zpracování a interpretaci nejen proteomických dat. Platforma je bezplatná, open-source a jejím cílem je také snadné uživatelské užití, které umožní úpravu a kontrolu jednotlivých kroků, včetně všech potenciálně použitých skriptů.
Anotace anglicky
Omics data processing are becoming increasingly complex and harder to process and reproduce. In response to this trend, we have built and are maintaining docker software container containing KNIME Analytics Platform. We are also developing new KNIME metanodes/components enabling utilization of advanced data processing methods and visualization techniques. Combined, they enable reproducible and flexible processing and interpretation of not only proteomics data. The platform is free and open-source and aims to be easy to use, still enabling detailed inspection and adjustment of individual steps including all scripts potentially used.
Návaznosti
LM2015043, projekt VaVNázev: Česká infrastruktura pro integrativní strukturní biologii (Akronym: CIISB)
Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, Czech Infrastructure for Integrative Structural Biology
VytisknoutZobrazeno: 1. 9. 2024 01:16