NOVÁKOVÁ, Dana, Pavel ŠVEC, Michal ZEMAN, Hans-Jürgen BUSSE, Ivana MAŠLAŇOVÁ, Roman PANTŮČEK, Stanislava KRÁLOVÁ, Lucie KRIŠTOFOVÁ a Ivo SEDLÁČEK. Pseudomonas leptonychotis sp. nov., isolated from Weddell seals in Antarctica. International Journal of systematic and Evolutionary Microbiology. London: Microbiology Society, 2020, roč. 70, č. 1, s. 302-308. ISSN 1466-5026. doi:10.1099/ijsem.0.003753.
Další formáty:   BibTeX LaTeX RIS
Základní údaje
Originální název Pseudomonas leptonychotis sp. nov., isolated from Weddell seals in Antarctica
Autoři NOVÁKOVÁ, Dana (203 Česká republika, domácí), Pavel ŠVEC (203 Česká republika, garant, domácí), Michal ZEMAN (703 Slovensko, domácí), Hans-Jürgen BUSSE (40 Rakousko), Ivana MAŠLAŇOVÁ (203 Česká republika, domácí), Roman PANTŮČEK (203 Česká republika, domácí), Stanislava KRÁLOVÁ (703 Slovensko, domácí), Lucie KRIŠTOFOVÁ (203 Česká republika, domácí) a Ivo SEDLÁČEK (203 Česká republika, domácí).
Vydání International Journal of systematic and Evolutionary Microbiology, London, Microbiology Society, 2020, 1466-5026.
Další údaje
Originální jazyk angličtina
Typ výsledku Článek v odborném periodiku
Obor 10606 Microbiology
Stát vydavatele Velká Británie
Utajení není předmětem státního či obchodního tajemství
WWW URL
Impakt faktor Impact factor: 2.415 v roce 2019
Organizační jednotka Přírodovědecká fakulta
Doi http://dx.doi.org/10.1099/ijsem.0.003753
UT WoS 000514419600043
Klíčová slova anglicky Pseudomonas leptonychotis; Antarctica; Weddell seal; polyphasic taxonomy
Štítky rivok
Příznaky Mezinárodní význam, Recenzováno
Změnil Změnila: Mgr. Marie Šípková, DiS., učo 437722. Změněno: 24. 11. 2020 14:59.
Anotace
A taxonomic study was carried out on four Gram-stain-negative strains P5773(T), P6169, P4708 and P6245, isolated from anus or mouth samples of Weddell seals at James Ross Island, Antarctica. The results of initial 16S rRNA gene sequence analysis showed that all four strains formed a group placed in the genus Pseudomonas and found Pseudomonas guineae and Pseudomonas peli to be their closest neighbours with 99.9 and 99.2% sequence similarity, respectively. Sequence analysis of rpoD, rpoB and gyrB housekeeping genes confirmed the highest similarity of isolates to P. peli (rpoD) and to P. guineae (rpoB and gyrB). The average nucleotide identity value below 86%, as calculated from the whole-genome sequence data, showed the low genomic relatedness of P5773(T) to its phylogenetic neighbours. The complete genome of strain P5773(T) was 4.4 Mb long and contained genes encoding proteins with biotechnological potential. The major fatty acids of the seal isolates were summed feature 8 (C-18:1 omega 7c), summed feature 3 (C-16 :1 omega 7c/C-16:1 omega 6c) and C-16:0. The major respiratory quinone was Q9. The major polar lipids were phosphatidylethanolamine, phosphatidylglycerol and diphosphatidylglycerol. Putrescine and spermidine are predominant in the polyamine pattern. Further characterization performed using repetitive sequence-based PCR fingerprinting and MALDI-TOF MS analysis showed that the studied isolates formed a coherent cluster separated from the remaining Pseudomonas species and confirmed that they represent a novel species within the genus Pseudomonas, for which the name Pseudomonas leptonychotis sp. nov. is suggested. The type strain is P5773(T) (=CCM 8849(T)=LMG 30618(T)).
Návaznosti
EF16_013/0001708, projekt VaVNázev: ECOPOLARIS - Změny ve struktuře a funkci součástí terestrických polárních ekosystémů (CzechPolar2)
LM2015043, projekt VaVNázev: Česká infrastruktura pro integrativní strukturní biologii (Akronym: CIISB)
Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, Velké infrastruktury pro výzkum, vývoj a inovace
LM2015078, projekt VaVNázev: Česká polární výzkumná infrastruktura (Akronym: CzechPolar2)
Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, Velké infrastruktury pro výzkum, vývoj a inovace
MUNI/A/0958/2018, interní kód MUNázev: Podpora výzkumné činnosti studentů molekulární biologie a genetiky 7 (Akronym: MBG 7)
Investor: Masarykova univerzita, Grantová agentura MU, DO R. 2020_Kategorie A - Specifický výzkum - Studentské výzkumné projekty
NV16-29916A, projekt VaVNázev: Využití bakteriofágů v léčbě nozokomiálních infekcí spojených s multirezistencí či tvorbou biofilmu
Typ Název Vložil/a Vloženo Práva
302_ijsem003753.pdf Licence Creative Commons  Verze souboru Pantůček, R. 11. 4. 2020

Práva

Právo číst
 
Právo vkládat
 
Právo spravovat
  • osoba Mgr. Ivana Mašlaňová, Ph.D., učo 106011
  • osoba doc. RNDr. Pavel Švec, Ph.D., učo 1098
  • osoba Mgr. Dana Nováková, Ph.D., učo 13197
  • osoba RNDr. Stanislava Králová, Ph.D., učo 357877
  • osoba Mgr. Michal Zeman, učo 379931
  • osoba Mgr. Lucie Krištofová, učo 397803
  • osoba Mgr. Marie Šípková, DiS., učo 437722
  • osoba doc. RNDr. Roman Pantůček, Ph.D., učo 842
  • osoba prof. RNDr. Ivo Sedláček, CSc., učo 866
Atributy
 
Vytisknout
Požádat autora o autorský výtisk Zobrazeno: 8. 3. 2021 17:44