HOLOCHOVÁ, Pavla, Ivana MAŠLAŇOVÁ, Ivo SEDLÁČEK, Pavel ŠVEC, Stanislava KRÁLOVÁ, Vojtěch KOVAŘOVIC, Hans-Jürgen BUSSE, Eva STAŇKOVÁ, Miloš BARTÁK a Roman PANTŮČEK. Description of Massilia rubra sp. nov., Massilia aquatica sp. nov., Massilia mucilaginosa sp. nov., Massilia frigida sp. nov., and one Massilia genomospecies isolated from Antarctic streams, lakes and regoliths. Systematic and Applied Microbiology. Munich, Germany: ELSEVIER GmbH, 2020, roč. 43, č. 5, s. "126112-1"-"126112-12", 12 s. ISSN 0723-2020. doi:10.1016/j.syapm.2020.126112.
Další formáty:   BibTeX LaTeX RIS
Základní údaje
Originální název Description of Massilia rubra sp. nov., Massilia aquatica sp. nov., Massilia mucilaginosa sp. nov., Massilia frigida sp. nov., and one Massilia genomospecies isolated from Antarctic streams, lakes and regoliths
Autoři HOLOCHOVÁ, Pavla (203 Česká republika, domácí), Ivana MAŠLAŇOVÁ (203 Česká republika, domácí), Ivo SEDLÁČEK (203 Česká republika, domácí), Pavel ŠVEC (203 Česká republika, domácí), Stanislava KRÁLOVÁ (703 Slovensko, domácí), Vojtěch KOVAŘOVIC (203 Česká republika, domácí), Hans-Jürgen BUSSE (40 Rakousko), Eva STAŇKOVÁ (203 Česká republika, domácí), Miloš BARTÁK (203 Česká republika, domácí) a Roman PANTŮČEK (203 Česká republika, garant, domácí).
Vydání Systematic and Applied Microbiology, Munich, Germany, ELSEVIER GmbH, 2020, 0723-2020.
Další údaje
Originální jazyk angličtina
Typ výsledku Článek v odborném periodiku
Obor 10606 Microbiology
Stát vydavatele Německo
Utajení není předmětem státního či obchodního tajemství
WWW URL
Impakt faktor Impact factor: 3.224 v roce 2019
Kód RIV RIV/00216224:14310/20:00116235
Organizační jednotka Přírodovědecká fakulta
Doi http://dx.doi.org/10.1016/j.syapm.2020.126112
UT WoS 000574879000017
Klíčová slova anglicky Massilia; Oxalobacteraceae; Polyphasic taxonomy; Whole-genome sequence; Antarctica; Psychrophilic bacteria
Štítky rivok
Příznaky Mezinárodní význam, Recenzováno
Změnil Změnila: Mgr. Marie Šípková, DiS., učo 437722. Změněno: 24. 2. 2021 11:06.
Anotace
Bacteria of the genus Massilia often colonize extreme ecosystems, however, a detailed study of the massilias from the Antarctic environment has not yet been performed. Here, sixty-four Gram-stain-negative, aerobic, motile rods isolated from different environmental samples on James Ross Island (Antarctica) were subjected to a polyphasic taxonomic study. The psychrophilic isolates exhibited slowly growing, moderately slimy colonies revealing bold pink-red pigmentation on R2A agar. The set of strains exhibited the highest 16S rRNA gene sequence similarities (99.5–99.9%) to Massilia violaceinigra B2T and Massilia atriviolacea SODT and formed several phylogenetic groups based on the analysis of gyrB and lepA genes. Phenotypic characteristics allowed four of them to be distinguished from each other and from their closest relatives. Compared to the nearest phylogenetic neighbours the set of six genome-sequenced representatives exhibited considerable phylogenetic distance at the whole-genome level. Bioinformatic analysis of the genomic sequences revealed a high number of putative genes involved in oxidative stress response, heavy-metal resistance, bacteriocin production, the presence of putative genes involved in nitrogen metabolism and auxin biosynthesis. The identification of putative genes encoding aromatic dioxygenases suggests the biotechnology potential of the strains. Based on these results four novel species and one genomospecies of the genus Massilia are described and named Massilia rubra sp. nov. (P3094T = CCM 8692T = LMG 31213T), Massilia aquatica sp. nov. (P3165T = CCM 8693T = LMG 31211T), Massilia mucilaginosa sp. nov. (P5902T = CCM 8733T = LMG 31210T), and Massilia frigida sp. nov. (P5534T = CCM 8695T = LMG 31212T).
Návaznosti
EF16_013/0001708, projekt VaVNázev: ECOPOLARIS - Změny ve struktuře a funkci součástí terestrických polárních ekosystémů (CzechPolar2)
LM2015078, projekt VaVNázev: Česká polární výzkumná infrastruktura (Akronym: CzechPolar2)
Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, Velké infrastruktury pro výzkum, vývoj a inovace
LM2015091, projekt VaVNázev: Národní centrum lékařské genomiky (Akronym: NCLG)
Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, Velké infrastruktury pro výzkum, vývoj a inovace
MUNI/A/1127/2019, interní kód MUNázev: Podpora výzkumné činnosti studentů molekulární biologie a genetiky 8 (Akronym: MBG 8)
Investor: Masarykova univerzita, Grantová agentura MU, DO R. 2020_Kategorie A - Specifický výzkum - Studentské výzkumné projekty
Typ Název Vložil/a Vloženo Práva
1-s2.0-S0723202020300679-main.pdf Licence Creative Commons  Verze souboru Pantůček, R. 16. 10. 2020

Práva

Právo číst
 
Právo vkládat
 
Právo spravovat
  • osoba Mgr. Ivana Mašlaňová, Ph.D., učo 106011
  • osoba doc. RNDr. Pavel Švec, Ph.D., učo 1098
  • osoba Mgr. Pavla Holochová, PhD., učo 13258
  • osoba Bc. Eva Staňková, učo 134329
  • osoba RNDr. Stanislava Králová, Ph.D., učo 357877
  • osoba Mgr. Vojtěch Kovařovic, učo 408266
  • osoba Mgr. Marie Šípková, DiS., učo 437722
  • osoba prof. Ing. Miloš Barták, CSc., učo 57
  • osoba doc. RNDr. Roman Pantůček, Ph.D., učo 842
  • osoba prof. RNDr. Ivo Sedláček, CSc., učo 866
Atributy
 
Vytisknout
Požádat autora o autorský výtisk Zobrazeno: 28. 7. 2021 17:10