VELEBA, Adam, František ZEDEK, Lucie HOROVÁ, Pavel VESELÝ, Miroslav SRBA, Petr ŠMARDA and Petr BUREŠ. Is the evolution of carnivory connected with genome size reduction? American Journal of Botany. Wiley, 2020, vol. 107, No 9, p. 1253-1259. ISSN 0002-9122. Available from: https://dx.doi.org/10.1002/ajb2.1526.
Other formats:   BibTeX LaTeX RIS
Basic information
Original name Is the evolution of carnivory connected with genome size reduction?
Name in Czech Souvisí vývoj masožravosti se zmenšením velikosti genomu?
Authors VELEBA, Adam (203 Czech Republic, belonging to the institution), František ZEDEK (203 Czech Republic, belonging to the institution), Lucie HOROVÁ (203 Czech Republic, belonging to the institution), Pavel VESELÝ (203 Czech Republic, belonging to the institution), Miroslav SRBA (203 Czech Republic), Petr ŠMARDA (203 Czech Republic, belonging to the institution) and Petr BUREŠ (203 Czech Republic, guarantor, belonging to the institution).
Edition American Journal of Botany, Wiley, 2020, 0002-9122.
Other information
Original language English
Type of outcome Article in a journal
Field of Study 10611 Plant sciences, botany
Country of publisher United States of America
Confidentiality degree is not subject to a state or trade secret
WWW URL
Impact factor Impact factor: 3.844
RIV identification code RIV/00216224:14310/20:00114413
Organization unit Faculty of Science
Doi http://dx.doi.org/10.1002/ajb2.1526
UT WoS 000565409500001
Keywords (in Czech) EVOLUCE OBSAHU GC; UTRICULARIA; CHROMOSOMOVÝ POČET; C-OXIDÁZA; VELIKOST BUNĚK; LENTIBULARIACEAE; DUSÍK; CEPHALOTACEAE; ROZMANITOST; GEOFYTY
Keywords in English GC CONTENT EVOLUTION; PLANT UTRICULARIA; CHROMOSOME-NUMBER; C-OXIDASE; CELL-SIZE; LENTIBULARIACEAE; NITROGEN; CEPHALOTACEAE; DIVERSITY; GEOPHYTES
Tags rivok
Tags International impact, Reviewed
Changed by Changed by: Mgr. Marie Šípková, DiS., učo 437722. Changed: 29/4/2021 12:21.
Abstract
Premise: As repeatedly shown, the remarkable variation in the genome size of angiosperms can be shaped by extrinsic selective pressures, including nutrient availability. Carnivory has evolved independently in 10 angiosperm clades, but all carnivorous plants share a common affinity to nutrient-poor habitats. As such, carnivory and genome reduction could be responses to the same environmental pressure. Indeed, the smallest genomes among flowering plants are found in the carnivorous family Lentibulariaceae, where a unique mutation in cytochrome c oxidase (COX) is suspected to promote genome miniaturization. Despite these hypotheses, a phylogenetically informed test of genome size and nutrient availability across carnivorous clades has so far been missing. Methods: Using linear mixed models, we compared genome sizes of 127 carnivorous plants from 7 diverse angiosperm clades with 1072 of their noncarnivorous relatives. We also tested whether genome size in Lentibulariaceae reflects the presence of the COX mutation. Results: The genome sizes of carnivorous plants do not differ significantly from those of their noncarnivorous relatives. Based on available data, no significant association between the COX mutation and genome miniaturization could be confirmed, not even when considering polyploidy. Conclusions: Carnivory alone does not seem to significantly affect genome size decrease. Plausibly, it might actually counterbalance the effect of nutrient limitation on genome size evolution. The role of the COX mutation in genome miniaturization needs to be evaluated by analysis of a broader data set because current knowledge of its presence across Lentibulariaceae covers less than 10% of the species diversity in this family.
Abstract (in Czech)
Předpoklad: Jak se opakovaně ukazuje, pozoruhodnou variabilitu velikosti genomu krytosemenných rostlin lze ovlivnit vnějšími selektivními tlaky, včetně dostupnosti živin. Masožravost se vyvinula nezávisle v 10 krytosemenných řádech, ale všechny masožravé rostliny mají společnou afinitu k stanovištím chudým na živiny. Redukce genomu masožravých rostlin by jako taková by mohla být reakcí na stejný tlak prostředí. Nejmenší genomy mezi kvetoucími rostlinami se skutečně nacházejí v masožravé čeledi Lentibulariaceae, kde existuje podezření, že jedinečná mutace v cytochrom c oxidáze (COX) podporuje miniaturizaci genomu. Přes tyto hypotézy dosud chyběl fylogeneticky podložený test vztahu velikosti genomu k dostupnosti živin u masožravých linií. Metody: Pomocí lineárních smíšených modelů jsme porovnali velikosti genomu 127 masožravých rostlin ze 7 různých kladů krytosemenných rostlin s 1072 jejich nemasožravými příbuznými. Také jsme testovali, zda velikost genomu u Lentibulariaceae odráží přítomnost mutace COX. Výsledky: Velikosti genomu masožravých rostlin se významně neliší od velikostí jejich nemasožravých příbuzných. Na základě dostupných údajů nebylo možné potvrdit žádnou významnou souvislost mezi mutací COX a miniaturizací genomu, a to ani při eliminaci polyploidie. Závěr: Nezdá se, že by masožravost významně ovlivňovala zmenšení velikosti genomu. Je pravděpodobné, že by to mohlo skutečně vyvážit účinek omezení živin na vývoj velikosti genomu. Role mutace COX v miniaturizaci genomu je třeba vyhodnotit analýzou širšího souboru dat, protože současné znalosti o její přítomnosti v Lentibulariaceae pokrývají méně než 10% druhové rozmanitosti v této čeledi.
Links
GA20-15989S, research and development projectName: Evoluce velikosti genomu - centromerický drajv v nové roli (Acronym: Centrogenomtah)
Investor: Czech Science Foundation
PrintDisplayed: 1/5/2024 03:27