Transgelin negativně přispívá k léčebné odpovědi pacientů s metastatickým reálním karcinomem léčených tyrosinkinasovými inhibitory

BOUCHAL, Pavel, Pavla BOUCHALOVÁ, Jindřich BERÁNEK, Petr LAPČÍK, David POTĚŠIL, Ján PODHOREC, Ondřej FIALA and Alexandr POPRACH. Transgelin negativně přispívá k léčebné odpovědi pacientů s metastatickým reálním karcinomem léčených tyrosinkinasovými inhibitory. In Book of Abstract of: Neformální proteomický webinář. 27.11.2020, str. 10. 2020.

Basic information

• Original name: Transgelin negativně přispívá k léčebné odpovědi pacientů s metastatickým reálním karcinomem léčených tyrosinkinasovými inhibitory
• Authors: BOUCHAL, Pavel, Pavla BOUCHALOVÁ, Jindřich BERÁNEK, Petr LAPČÍK, David POTĚŠIL, Ján PODHOREC, Ondřej FIALA and Alexandr POPRACH.
• Edition: Book of Abstract of: Neformální proteomický webinář. 27.11.2020, str. 10. 2020.

Other information

• Original language: Czech
• Type of outcome: Conference abstract
• Field of Study: 10608 Biochemistry and molecular biology
• Country of publisher: Czech Republic
• Confidentiality degree: is not subject to a state or trade secret
• WWW: URL
• Organization unit: Faculty of Science
• Keywords (in Czech): renální karcinom, sunitinib, rezistence, DIA proteomika, transgelin
• Keywords in English: renal cell carcinoma, sunitinib, resistance, DIA proteomics, transgelin

Abstract

Karcinom renálních buněk (RCC) reprezentuje asi 2-3% všech nádorů s více než 400 000 novými případy za rok s rostoucí incidencí, zvláště pak v České republice. Sunitinib, inhibitor tyrosin kinázy vaskulárního endotheliálního růstového faktoru (VEGF), je používán pro léčbu pacientů s metastatickým RCC (mRCC) v první linii s dobrou nebo střední prognózou. Zhruba třetina mRCC pacientů však na léčbu sunitinibem velmi špatně odpovídá. Cílem prezentované pilotní studie je nalézt proteiny spojené se špatnou terapeutickou odpovědí na sunitinib. V trénovacím souboru bylo analyzováno 8 vs. 8 mRCC nádorových tkání od pacientů odpovídajících vs. neodpovídajících na léčbu sunitinibem 3 měsíce po zahájení léčby a 16 přilehlých nenádorových tkání, pomocí LC-MS proteomiky v módu datově nezávislého sběru (DIA) dat na LC-MS systému Impact II (Bruker). Validační soubor obsahoval dalších 74 pacientů stratifikovaných dle odpovědi na léčbu a byl analyzován na systému QExactive HF-X (Thermo Fisher Scientific). Data byla analyzována v software Spectronaut (Biognosys). V analýze trénovacího souboru bylo v primárních nádorech odpovídajících vs. neodpovídajících na léčbu sunitinibem deregulováno 42 proteinových skupin (q<0.01). Analýza drah odhalila obohacené dráhy elastických vláken, vesikulárního transportu a transportu malých molekul. Na základě uvedených analýz byl pro funkční analýzy vybrán transgelin protein zapojený do remodelace aktinového cytoskeletu. U TAGLN genu byl úspěšně proveden “knockout“ metodou CRISPR/Cas9. Buňky s umlčeným transgelinem neproliferovaly, buňky s částečně umlčeným transgelinem vykazovaly významně horší proliferaci a přežití ve srovnání s mateřskou linií. Vztah k léčebné odpovědi byl následně potvrzen také na nezávislém validačním souboru pacientů. Data ukazují, že transgelin podporuje přežití RCC buněk a zřejmě přispívá k jejich přirozené rezistenci k sunitinibu.

Links

• LM2018127, research and development project: Name: Česká infrastruktura pro integrativní strukturní biologii (Acronym: CIISB)

Investor: Ministry of Education, Youth and Sports of the CR

• MUNI/A/1252/2019, interní kód MU: Name: Podpora biochemického výzkumu v roce 2020

Investor: Masaryk University, Category A

• NV19-08-00250, research and development project: Name: Proteotypová klasifikace renálního karcinomu ve vztahu k prognóze a terapeutické odpovědi

Investor: Ministry of Health of the CR