VOZDOVA, M., S. KUBICKOVA, Karol PÁL, J. FROHLICH, P. FICTUM a J. RUBES. Recurrent gene mutations detected in canine mast cell tumours by next generation sequencing. VETERINARY AND COMPARATIVE ONCOLOGY. HOBOKEN: WILEY, 2020, roč. 18, č. 4, s. 509-518. ISSN 1476-5810. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1111/vco.12572.
Další formáty:   BibTeX LaTeX RIS
Základní údaje
Originální název Recurrent gene mutations detected in canine mast cell tumours by next generation sequencing
Autoři VOZDOVA, M., S. KUBICKOVA, Karol PÁL (703 Slovensko, garant, domácí), J. FROHLICH, P. FICTUM a J. RUBES.
Vydání VETERINARY AND COMPARATIVE ONCOLOGY, HOBOKEN, WILEY, 2020, 1476-5810.
Další údaje
Originální jazyk angličtina
Typ výsledku Článek v odborném periodiku
Obor 40301 Veterinary science
Stát vydavatele Spojené státy
Utajení není předmětem státního či obchodního tajemství
WWW URL
Impakt faktor Impact factor: 2.613
Kód RIV RIV/00216224:14740/20:00118346
Organizační jednotka Středoevropský technologický institut
Doi http://dx.doi.org/10.1111/vco.12572
UT WoS 000590128500007
Klíčová slova anglicky cancer; dog; GNB1; KIT; mast cell tumour; mutation; next generation sequencing; whole exome sequencing
Štítky CF GEN, rivok
Příznaky Mezinárodní význam, Recenzováno
Změnil Změnila: Mgr. Pavla Foltynová, Ph.D., učo 106624. Změněno: 8. 3. 2021 20:16.
Anotace
Genetic causes of canine mast cell tumours (MCTs), except for mutations in the KIT gene detected in some MCTs, are generally unknown. We used whole exome sequencing to reveal mutation spectra in canine MCTs. We detected somatic mutations in 87 genes including 10 genes recognized as human cancer drivers. Besides KIT, 14 other genes were recurrently mutated. Subsequently, we performed next generation sequencing of a panel of 50 selected genes in additional MCT samples. In this group, the most frequently altered gene was GNB1 showing a recurrent dinucleotide substitution at position of Gly116 in 30% of the MCT samples (n = 6/20) and Ile80 substitution accompanied by a splice region mutation in one case. We extended the study by analysis of the above mentioned GNB1 regions in additional MCT samples by Sanger sequencing, and assessed the overall prevalence of GNB1 mutations to 17.3% (n = 14/81), which is similar to the prevalence of KIT alterations. Our results indicate that GNB1 mutations are probably involved in canine MCT pathogenesis in both cutaneous and subcutaneous MCT cases. As opposed to KIT alterations, the presence of GNB1 mutations did not negatively affect survival times, and our data even showed a trend towards positive prognosis. If our results are confirmed in a larger number of MCTs, an extension of molecular testing of canine MCTs by GNB1 analysis would help to refine the molecular stratification of MCTs, and become useful for targeted treatment strategies.
Návaznosti
LM2015091, projekt VaVNázev: Národní centrum lékařské genomiky (Akronym: NCLG)
Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, Národní centrum lékařské genomiky
LQ1601, projekt VaVNázev: CEITEC 2020 (Akronym: CEITEC2020)
Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, CEITEC 2020
VytisknoutZobrazeno: 25. 4. 2024 02:16